锌指 CCCH 结构域蛋白 3; ZC3H3
SMAD 相互作用 CPSF 样蛋白;SMICL
HGNC 批准的基因符号:ZC3H3
细胞遗传学位置:8q24.3 基因组坐标(GRCh38):8:143,437,659-143,541,447(来自 NCBI)
▼ 说明
ZC3H3 是一种 SMAD(参见 601595)相互作用蛋白,参与 mRNA 核腺苷酸化和输出的调节(Hurt 等人,2009)。
▼ 克隆与表达
科拉特等人(2005) 克隆了非洲爪蟾 Zc3h3,他们将其称为 Smicl。预测的 827 个氨基酸的蛋白质与小鼠 Smicl 具有 43.1% 的氨基酸同一性,在含有 5 个 C3H 型锌指的结构域中保守性最高。原位杂交和 RT-PCR 分析表明,Smicl 在母本表达,然后在非洲爪蟾发育过程中在合子中表达。
赫特等人(2009) 报道果蝇 Zc3h3 与人类 ZC3H3 具有 15% 的氨基酸同一性,并在其 C 末端附近含有 3 个 CCCH 型锌指。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 ZC3H3 序列(GenBank BC038670) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZC3H3 基因对应到染色体 8q24.3。
▼ 基因功能
科拉特等人(2005) 表明,与其小鼠同源物一样,Xenopus Smicl 是一种 SMAD 相互作用蛋白。抑制 Smicl 会下调 Chordin(CHRD; 603475) 的表达,并导致非洲爪蟾的原肠胚形成缺陷。在非洲爪蟾中,Xlim1 直接诱导 Chordin 需要 Smicl。免疫沉淀分析表明,Xlim1 存在于与 Smad3(603109) 和 Smicl 的复合物中。 Pull-down 测定表明 Xlim1 结合了 Chordin 启动子中的 2 个假定的 Xlim1 结合位点。
赫特等人(2009) 发现果蝇 Zc3h3 是多聚(A) RNA 核输出所必需的。果蝇 Zc3h3 的 N 末端可以与 Poly(A) RNA 相互作用,并介导 Zc3h3 与 Nxf1(602647) 的相互作用,而 C 末端对于核 Poly(A) RNA 输出是必需的且部分充分。果蝇 Zc3h3 还与一系列输出因子相关,包括 Nxf1、Pabp2(PABPN1; 602279) 和 Swm,它们在转录本核输出中共同发挥作用。 Zc3h3 是正确的 mRNA 多腺苷酸化所必需的,因为果蝇细胞中 Zc3h3 的缺失会导致转录本的高腺苷酸化。 ZC3H3 在 mRNA 核输出中的这种功能在人类中是保守的,因为 ZC3H3 调节人类细胞中 PABPN1 下游 mRNA 的适当多腺苷酸化,而 ZC3H3 的耗竭会导致 mRNA 输出缺陷。
Collart 等人使用微阵列分析(2009) 发现 Smicl 在爪蟾中囊胚转变(MBT) 处从细胞质转移到细胞核,并开始对其靶基因表达进行时间调控。 Smicl 的过度表达延长了至少 1 个靶基因 Xiro1 的 mRNA 聚(A) 尾部,而 Smicl 的缺失则缩短了它,从而影响了未加工的 Xiro1 转录本的水平。免疫沉淀分析表明,Smicl 与 Rpb1(POLR2A;180660) 相互作用,并且 Smicl 的 C 端结构域对于这种相互作用至关重要。 Smicl 影响 Rpb1 在其 C 端结构域内 Ser2 处的磷酸化。
聚腺苷酸尾外泌体靶向(PAXT) 连接促进核糖核酸外泌体向核聚腺苷酸化 RNA 的募集,该连接由核心 MTR4(MTREX; 618122)-ZFC3H1 二聚体和其他因子组成。 Silla 等人通过使用 HEK293 和 HeLa 细胞进行蛋白质组学和敲低分析(2020) 确定 ZC3H3、RBM26(620081) 和 RBM27(620082) 是 PAXT 成分,对 PAXT 介导的核 RNA 衰变至关重要。