谷氨酰胺酰胺转移酶样 1 类域包含蛋白 3A; GATD3A
ES1、斑马鱼、同系物; ES1; HES1
21 号染色体开放解读码组 33; C21ORF33
D21S2048E
KNPI
GT335
HGNC 批准的基因符号:GATD3
细胞遗传学位置:21q22.3 基因组坐标(GRCh38):21:44,133,683-44,145,711(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
作为确定对应到 21q22.3 的疾病候选基因的努力的一部分,Lafreniere 等人(1996) 构建了一个 405-kb 粘粒重叠群,包含 5 个紧密连锁的标记,对应到该区域。通过杂交选择方法鉴定出的一个 cDNA 片段,被他们命名为 GT335,主要在心脏和骨骼肌中表达为 1.7 kb 转录物,可能显示交替剪接,并预测编码 268 个氨基酸的蛋白质。拉法尼尔等人(1996) 发现该基因在进化上非常保守,在斑马鱼和大肠杆菌中发现了同源物,表明它在基本细胞代谢中发挥着重要作用。
长岭等人(1996) 分离了一种新型人类蛋白质(他们将其命名为 KNPI)的 cDNA 克隆,该蛋白质在各种人体组织中普遍表达。预测的 268 个氨基酸蛋白与大肠杆菌抗 σ 交叉反应蛋白(SCRP-27A/SCRP27;44% 同一性)和斑马鱼 es1 蛋白(49% 同一性)具有显着同源性。
斯科特等人(1997) 使用 21 号染色体粘粒进行外显子捕获,并通过搜索 DNA 数据库,发现了 2 个与斑马鱼蛋白(ES1) 和大肠杆菌 SCRP27 具有显着同源性的外显子,两者的功能均未知。外显子还与多个表达序列标签(EST) 共享同一性。完整的 cDNA 序列对应于 1.7 kb 的 mRNA,具有 268 个氨基酸的开放解读码组。该基因的 mRNA 被作者称为 HES1,广泛表达,但在心脏和骨骼肌中表达强烈。在人类和斑马鱼蛋白质中都发现了潜在的线粒体靶向信号,这与肌肉组织中的高表达水平一致。远缘物种之间的强烈同源性表明其具有重要的生物学作用。
▼ 基因结构
拉法尼尔等人(1996) 发现对应于 C21ORF33 基因的 cDNA 片段 GT335 跨越了估计 13 kb 的基因组 DNA,并被分成 7 个外显子。 6 个内含子中的 5 个符合内含子剪接点的 GT...AG 共识。第六个包含非常规(AT...AC)内含子连接。发现了几种序列变异,其中 2 种引起了保守氨基酸取代。
Nagamine 等人通过基因组测序(1996) 证明 KNPI 基因由 7 个跨度 12 kb 的外显子组成。外显子 5 参与选择性剪接。
▼ 基因功能
Kawasaki 和 Taira(2003) 发现 NT2 细胞(用视黄酸处理后分化为神经元细胞的人胚胎癌细胞)中的 miRNA23(607962) 降低了抑制子 HES1 的蛋白质水平。在撤回中,他们指出被鉴定为 miRNA23 靶标的 mRNA 来自人类“ES1 同源物”。基因(C21ORF33)而不是来自“分裂的毛/增强子”;基因(HES1;139605),如论文所述。由于这个错误导致解释困难,他们撤回了论文。
▼ 测绘
长岭等人(1996) 将 D21S1460 和 D21S25 之间的基因定位在染色体 21q22.3 上,自身免疫性多腺体疾病 I 型(APECED; 240300) 也定位在同一区域。
斯科特等人(1997) 使用 RT-PCR 产物与染色体 21q22.3 的粘粒重叠群杂交来绘制紧邻 D21S25 的 HES1 基因图谱。