冷诱导RNA结合蛋白; CIRBP
CIRP
HGNC 批准的基因符号:CIRBP
细胞遗传学位置:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:1,269,332-1,274,880(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
冷应激诱导微生物合成多种蛋白质,这些蛋白质参与转录、翻译和重组等各种细胞过程。轻度冷应激(32 摄氏度)可在啮齿动物细胞中诱导寒冷诱导的 RNA 结合蛋白(Cirp)。 Cirp 由 N 端 RNA 结合结构域和 C 端富含gly 的结构域组成,在冷诱导的细胞增殖抑制中发挥重要作用。西山等人(1997) 克隆了编码 18 kD 蛋白质的 cDNA,其氨基酸序列与小鼠 Cirp 蛋白质有 95.3% 的同一性。 CIRBP mRNA 在所有检查的细胞系中组成型表达。在所有细胞系中,温度从 37 摄氏度降至 32 摄氏度后 12 小时内,CIRBP mRNA 和蛋白质水平均有所增加。这些结果表明,CIRBP 是人体细胞中的冷休克蛋白。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Nishiyama 等人(1997) 将 CIRBP 基因定位到染色体 19p13.3。
▼ 基因功能
莫夫等人(2012) 表明,模拟体温循环而非外周振荡器控制培养成纤维细胞中冷诱导 RNA 结合蛋白(CIRBP) 的节律表达。反过来,功能丧失实验表明,CIRBP 是高振幅昼夜节律基因表达所必需的。通过基于生物素-链霉亲和素的交联和免疫沉淀(CLIP) 程序对 CIRBP 结合 RNA 进行全转录组鉴定,揭示了编码昼夜节律振荡器蛋白的多个转录本,包括 CLOCK(601851)。此外,在 CIRBP 耗尽的成纤维细胞中,CLOCK 积累显着减少。由于 CLOCK 的异位表达改善了这些细胞中的昼夜节律基因表达,Morf 等人(2012) 得出的结论是,CIRBP 通过调节 CLOCK 表达赋予昼夜节律振荡器稳健性。