死框解旋酶 1； DDX1

死亡/H框 1

HGNC 批准的基因符号：DDX1

细胞遗传学位置：2p24.3 基因组坐标（GRCh38）：2:15,591,868-15,631,101（来自 NCBI）

▼ 说明

DEAD 框蛋白，例如 DDX1，是假定的 RNA 解旋酶，具有特征性的 asp-glu-ala-asp（DEAD）框基序。通过改变 RNA 二级结构，DEAD 框蛋白可以影响翻译起始、剪接以及核糖体和剪接体组装（Godbout 和 Squire 总结，1993）。

▼ 克隆与表达

Godbout 和 Squire（1993）通过对 cDNA 文库进行差异筛选获得了 DEAD box 基因的克隆，该文库是通过从结肠癌细胞系和胎儿组织中扣除 Poly（A）+ RNA 后从 2 个视网膜母细胞瘤细胞系中选择非杂交 cDNA 制成的。作者将这个 2.4 kb cDNA 命名为 HuDBP-RB（人类 DEAD 框蛋白 - 视网膜母细胞瘤），编码 739 个氨基酸的蛋白质。 Northern 印迹分析显示，在 2 种视网膜母细胞瘤细胞系和神经外胚层来源的组织（包括视网膜、大脑和脊髓）中表达最高。 Southern 印迹分析表明，在高表达的视网膜母细胞瘤系中，DDX1 基因与 MYCN 原癌基因（164840）共扩增。

Tanaka 等人通过对几种小鼠组织进行 Northern 印迹分析（2009）在睾丸中检测到最高的 Ddx1 表达。在发育中的小鼠胚胎中，Ddx1 从性交后 11.5 天（dpc）的性冷漠性腺表达到 19.5 dpc 的胎儿睾丸。 Ddx1 表达在成人睾丸中得以维持。小鼠睾丸的免疫组织化学分析和人睾丸的原位杂交揭示了曲细精管基底膜附近的一组细胞中存在 DDX1 表达。在小鼠中，Ddx1 表达在精子发生过程中逐渐下降。 DDX1也在人类精原细胞瘤和胚胎癌肿瘤中表达。

▼ 基因功能

Tanaka 等人使用小鼠 cDNA 微阵列和 RT-PCR（2009）表明，在小鼠精原细胞系中，小干扰 RNA 介导的 Ddx1 敲低会降低细胞周期蛋白 D2（CCND2; 123833）、Gdf3（606522）和 Cd9（143030）基因的表达。这3个基因位于小鼠6号染色体和人类12p13.3号染色体上的干细胞基因簇中。报告基因、电泳迁移率变化和染色质免疫沉淀测定证实了小鼠 Ddx1 与细胞周期蛋白 D2 基因的结合和激活。 NEC8 人胚胎癌衍生细胞系中 DDX1 的敲除会降低细胞周期蛋白 D2 和 CD9 的表达，但不会降低 GDF3。 NEC8细胞中DDX1的敲低也降低了NEC8细胞移植到无胸腺裸鼠时诱导肿瘤的能力。田中等人（2009）得出结论，DDX1 是一种干细胞调节因子，当过度表达时会导致睾丸生殖细胞肿瘤。

通过使用生物素化聚 I:C 进行免疫沉淀和蛋白质下拉分析，Zhang 等人（2011）在小鼠骨髓树突状细胞（mDC）中鉴定出一种胞质、不依赖内体的病毒核苷酸传感器，由 RNA 解旋酶 Ddx1、Ddx21（606357）和 Dhx36（612767）以及接头分子 Trif（TICAM1; 607601）组成。双链 RNA（dsRNA）传感器 Pkr（EIF2AK2; 176871）和 Lgp2（DHX58; 608588）也被沉淀。通过短发夹 RNA 敲低每个解旋酶可阻断 mDC 装载 I 型干扰素（参见 147660）的能力以及对 Poly I:C、甲型流感和呼肠孤病毒的细胞因子反应。 Ddx1 通过其解旋酶 A 结构域结合聚 I:C，而 Dhx36 和 Ddx21 分别通过其 HA2-DUF 和 PRK 结构域结合 Trif 的 TIR 结构域。张等人（2011）得出结论，DDX1-DDX21-DHX36 复合物是一种 dsRNA 传感器，它使用 TRIF 途径激活 mDC 胞质中的 I 型干扰素反应。

波波等人（2014）发现 archease（ZBTB8OS; 615891）与 DDX1 合作，刺激 RTCB（613901）的前 tRNA 剪接。 HEK293 细胞蛋白的交联揭示了一种蛋白质复合物，其中包括表位标记的古酶、RTCB、FAM98B（616142）和 DDX1。 Archease 需要 GTP 来刺激 RTCB 活性，并且需要 DDX1 水解 ATP 才能最大程度地刺激 RTCB。波波等人（2014）得出结论，archease 促进了前 tRNA 连接所需的 RTCB-鸟苷酸中间体的 DDX1 依赖性形成。

Perez-Gonzalez 等人通过对来自 HEK293T 细胞的 CLE（C14ORF166; 610858）免疫沉淀的胰蛋白酶肽进行质谱分析（2014）鉴定了一个 220 至 480 kD 的蛋白质复合物，除了 CLE 之外，还包括 DDX1、HSPC117（RTCB）和 FAM98B；该复合物还包含RNA。 HEK293T 细胞中 CLE 的短发夹 RNA 依赖性下调减少了 DDX1、HSPC117 和 FAM98B 的核和胞质积累。 CLE 的过度表达稳定了两个区室中的复合物，RNase 处理导致 CLE 和 HSPC117 部分解离，表明它是核糖核蛋白复合物。转录抑制减少了复合物的核输入，导致 DDX1 在胞质中积累。

▼ 测绘

Godbout 和 Squire（1993）通过荧光原位杂交将 DDX1 基因定位到染色体 2p24。

▼ 命名法

Kitajima 等人报道的基因（1994），被 HUGO 命名委员会指定为 DDX7，后来被确定为细菌序列而不是人类序列。