含有锚蛋白重复序列和 SOCS 框的蛋白 10; ASB10
HGNC 批准的基因符号:ASB10
细胞遗传学位置:7q36.1 基因组坐标(GRCh38):7:151,175,698-151,187,792(来自 NCBI)
▼ 说明
ASB 家族的蛋白质,例如 ASB10,包含中央串联锚蛋白(参见 612641)重复序列和细胞因子信号转导(SOCS) 框的 C 端抑制因子。据预测,SOCS 框蛋白将通过充当底物蛋白和 E3 泛素蛋白连接酶之间的桥梁来参与蛋白质降解(参见 601623)(Kile 等人的评论,2002)。
▼ 克隆与表达
基尔等人(2001) 表明推导的 467 个氨基酸的小鼠 Asb10 蛋白含有 7 个串联锚蛋白重复序列和一个 C 端 SOCS 框。对小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到 Asb10 在心脏中表达显着,而在骨骼肌中表达较弱。
帕苏托等人(2012) 评估了正常供体眼睛的眼组织中的 ASB10 mRNA 谱,观察到虹膜中的表达最高,小梁网(TM)、椎板和视神经中的表达水平中等;睫状体、视网膜和脉络膜的水平略低;并且镜头中的水平非常低。免疫组织化学检测人 TM 细胞、外 TM 束和近小管区域中的 ASB10 蛋白。它也存在于施累姆管内壁和外壁的内皮细胞中。在睫状体中,ASB10主要在覆盖睫状突的色素性睫状上皮细胞的细胞质和核周区域中观察到,在非色素性上皮细胞中表达最少。在视网膜中,ASB10 定位于视网膜神经节细胞和内核层的单个神经元,在那里它表现出独特的核表达模式。外核层中的感光细胞核大部分呈阴性,但在感光细胞体和内节之间的外界膜处观察到明显的荧光。
▼ 测绘
Hartz(2013) 根据 ASB10 序列(GenBank AF417920) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ASB10 基因对应到染色体 7q36.1。
▼ 基因功能
为了测试 ASB10 是否影响房水流出,Pasutto 等人(2012) 使用 RNAi 沉默来敲低人类眼前段灌注培养物中 ASB10 mRNA 的表达。当shASB10慢病毒在灌注培养中应用于人眼时,与对照相比,48小时内流出设施减少了约50%。流出实验后组织提取物的定量 RT-PCR 显示,在 shASB10 感染的小梁网中,ASB10 mRNA 水平仅降低至对照水平的 5%;免疫染色证实 ASB10 的量显着减少。
▼ 分子遗传学
在俄勒冈州一个成人发病的原发性开角型青光眼(POAG) 家族中,对应到染色体 7q35-q36(GLC1F; 603383),Pasutto 等人(2012) 对 42 个候选基因进行了测序,并鉴定了 ASB10 基因(T255T; 603383.0001) 中同义变异的杂合性,该变异与疾病分离,并且在 HapMap 或 dbSNP 数据库、1000 个基因组计划数据库或 85 个对照中未发现。对患者 mRNA 的分析表明,T255T 突变体产生了选择性剪接的截短产物。对来自美国和德国的总共 1,172 个 POAG 病例的完整 ASB10 编码区进行筛查,发现 70 名患者中有 26 个氨基酸变化,13 名对照中有 9 个氨基酸变化(p = 0.008;参见例如 603383.0002-603383.0004)。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 青光眼 1,开角型,F
ASB10、THR255THR(rs104886478)
在一个 4 代大家庭的受影响成员中,患有成人发病的原发性开角型青光眼(GLC1F; 603383),最初由 Wirtz 等人报道(1999),帕苏托等人(2012) 鉴定了 ASB10 基因外显子 3 中 c.765C-T 转变的杂合性,导致第五个锚蛋白结构域中的 thr255 至 thr(T255T;rs104886478)取代。在未受影响的家庭成员或 461 个对照中,或者在 HapMap 或 dbSNP 数据库或 1000 基因组计划数据库中未发现该突变。对患者 mRNA 的分析显示,外显子 3 不存在,这改变了阅读框,并在外显子 4 中引入了终止密码子,预计会产生仅包含 7 个锚蛋白重复中的 2 个且缺少 SOCS 框的蛋白质产物。在一名患有原发性开角型青光眼的德国患者中也发现了 T255T 突变。
.0002 青光眼 1,开角型,F
ASB10、CYS173TER
Pasutto 等人在一位患有原发性开角型青光眼(GLC1F; 603383) 的德国患者中(2012) 鉴定了 ASB10 基因外显子 2 中 519C-A 颠换的杂合性,导致第三个锚蛋白结构域中的 cys173-to-ter(C173X) 取代。在 461 个对照中未发现该突变。
.0003 青光眼 1,开角型,F
ASB10,VAL192LEU(rs104886474)
Pasutto 等人在 7 例原发性开角型青光眼(GLC1F; 603383) 患者中进行了研究,其中 4 例为青少年发病(JOAG),3 例为正常眼压性青光眼(NTG)(2012) 鉴定了 ABS10 基因外显子 3 中 574G-C 颠换的杂合性,导致 val192-to-leu(V192L; rs104886474) 取代,引入更大的侧链,预计会降低蛋白质稳定性或改变蛋白质确认。在 461 个对照中未发现该突变。
.0004 青光眼 1,开角型,F
ASB10、ARG72HIS
Pasutto 等人在 10 名原发性开角型青光眼(GLC1F; 603383) 患者中进行了研究,其中包括 5 名正常眼压性青光眼(NTG)、4 名成人发病的原发性开角型青光眼(POAG) 和 1 名青少年发病的青光眼(JOAG)等人(2012) 鉴定了 ASB10 基因外显子 1 中 215G-A 转变的杂合性,导致 N 末端 arg72-to-his(R72H) 取代并导致正电荷丢失。 461 名对照者中的 1 名也检测到了该突变。