真核翻译起始因子 3,亚基 D; EIF3D
EIF3-p66
以前的真核翻译起始因子 3,亚基 7; EIF3S7,前
HGNC 批准的基因符号:EIF3D
细胞遗传学位置:22q12.3 基因组坐标(GRCh38):22:36,510,855-36,529,166(来自 NCBI)
▼ 说明
真核起始因子 3(eIF3) 是最大的 eIF,是一种大约 600 kD 的多蛋白复合物,可与 40S 核糖体结合,帮助维持 40S 和 60S 核糖体亚基处于解离状态。它还被认为通过与 eIF2/GTP/甲硫氨酰-tRNA 三元复合物相互作用并促进 mRNA 结合,在 40S 起始复合物的形成中发挥作用。哺乳动物 eIF3 由至少 10 个不相同的亚基组成:p170(602039)、p116(603917)、p110(603916)、p66(EIF3D)、p48(602210)、p47(603914)、p44(603913)、p40(603912)、第 36 页(603911)和第 35 页(603910)。 p170、p110、p116、p36 和 p44 亚基与酿酒酵母蛋白同源,表明它们代表了能够进行 RNA-蛋白质和蛋白质-蛋白质相互作用的核心复合物,以刺激依赖于 eIF3 的翻译起始反应。其余的亚基可能是在真核进化后期获得的,以提供额外的翻译控制手段(浅野等人总结,1997)。
▼ 克隆与表达
Asano 等人通过检索兔 p66、p47 和 p40 的部分蛋白序列 EST 数据库,(1997) 鉴定了编码人类同源物的 cDNA。预测的 548 个氨基酸的人 p66 蛋白在富含精氨酸和赖氨酸的 N 端亲水片段内包含一个 RNA 结合结构域。 Northern 印迹分析显示 p66 表达为 1.9 kb mRNA。
▼ 基因功能
浅野等人(1997) 表明重组人 p66 在体外结合放射性标记的 RNA。突变分析显示 p66 的 RNA 结合结构域位于残基 86 和 118 之间。
李等人(2016) 描述了人类细胞中帽依赖的翻译起始途径,该途径依赖于 EIF3D(800-kD EIF3 复合物的一个亚基)的帽结合活性。 EIF3D 帽结合域的 1.4 埃晶体结构揭示了与参与 RNA 周转的核酸内切酶意外的同源性,并允许对 EIF3D 帽识别进行建模。 EIF3D 与帽发生特异性接触,如帽类似物竞争所示,这些相互作用对于 EIF3 特异性 mRNA(例如细胞增殖调节剂 c-Jun(JUN; 165160))上翻译起始复合物的组装至关重要。 c-Jun mRNA 进一步编码一个抑制性 RNA 元件,该元件可阻止 EIF4E(133440) 募集,从而强制 EIF3D 进行替代帽识别。李等人(2016) 得出的结论是,他们的结果揭示了一种孤立于 EIF4E 的帽依赖性翻译机制,并说明了模块化 RNA 元件如何协同工作以指导特殊形式的翻译起始。
▼ 测绘
Hartz(2012) 根据 EIF3D 序列(GenBank BC014912) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 EIF3D 基因对应到染色体 22q12.3。