染色质组装因子 I,亚基 B; CHAF1B

染色质组装因子 I,p60 亚基; CAF1P60
CAF1A

HGNC 批准的基因符号:CHAF1B

细胞遗传学位置:21q22.12-q22.13 基因组坐标(GRCh38):21:36,385,392-36,419,015(来自 NCBI)

▼ 说明

染色质组装因子 I(CAF1) 是由 p50、p60 和 p150(CHAF1A; 601246) 亚基组成的 3 亚基核复合物,可在体外将组蛋白八聚体组装到复制 DNA 上(Kaufman 等人,1995)。

▼ 克隆与表达

考夫曼等人(1995) 使用纯化蛋白的部分氨基酸序列数据获得了 p60 的 cDNA。预测的 559 个氨基酸蛋白质属于 WD(色氨酸-天冬氨酸)或转导蛋白家族(参见 139330)。这些蛋白质的特征通常是具有约 40 个残基的 4 至 8 个重复拷贝,通常以 WD 序列结尾(p60 有 7 个基序拷贝)。 p60 亚基的 C 末端还有一个 PEST(脯氨酸-谷氨酸-丝氨酸-苏氨酸)框,与短半衰期的蛋白质相关。

▼ 基因功能

考夫曼等人(1995) 发现 p150 和 p60 亚基在核小体组装过程中相互作用,并且从 p150 中删除 p60 结合域会废除染色质组装。考夫曼等人(1995) 还表明 p150 和 p60 与新合成的组蛋白 H3(参见 601058)和乙酰化组蛋白 H4(参见 602822)形成复合物,该复合物可能在复制 DNA 上组装之前形成中间体。

为了阐明保护体蜂窝状态的监管途径,Cheloufi 等人(2015),在转录因子介导的小鼠成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞(iPS 细胞) 过程中,针对染色质因子进行了 2 次全面的 RNA 干扰(RNAi) 筛选。 CAF1 复合物的亚基(包括 Chaf1a 和 Chaf1b)成为两个筛选中最突出的命中,其次是赖氨酸苏酰化和异染色质维持的调节剂。 CAF1 和转录因子水平的最佳调节可将重编程效率提高几个数量级,并在短短 4 天内促进 iPS 细胞形成。从机制上讲,CAF1 抑制导致重编程早期增强子元件上的染色质结构更容易接近。这些变化伴随着体细胞异染色质结构域的减少、Sox2(184429) 与多能性特异性靶标的结合增加以及相关基因的激活。值得注意的是,抑制 CAF1 还增强了 B 细胞直接转化为巨噬细胞以及成纤维细胞直接转化为神经元。 Cheloufi 等人的研究结果(2015) 揭示组蛋白伴侣 CAF1 在转录因子诱导的细胞命运转变过程中是体细胞身份的新型调节剂,并提供了在再生环境中调节细胞可塑性的潜在策略。

▼ 测绘

布卢因等人(1996) 通过将 CHAF1B 基因的序列与从唐氏综合症关键区域捕获的外显子的序列对应起来,将 CHAF1B 基因对应到 21q22.2。 Katsanis 和 Fisher(1996) 使用 PCR 在单染色体杂交组和高分辨率辐射杂交组中扩增该基因的 3-prime 非翻译区,证实了该基因的位置,他们将其称为 CAF1P60。此外,他们还对 21 号染色体 YAC 集合进行了 PCR 分析。他们证明 CHAF1B 基因对应到 D21S333 和 D21S334 之间的 21q22.2。