视黄酸早期转录 1E; RAET1E
淋巴细胞效应细胞毒性激活配体;LETAL
UL16 结合蛋白 4; ULBP4
HGNC 批准的基因符号:RAET1E
细胞遗传学位置:6q25.1 基因组坐标(GRCh38):6:149,883,179-149,898,113(来自 NCBI)
▼ 说明
RAET1 家族的成员(例如 RAET1E)是主要组织相容性复合体(MHC) I 类相关基因,位于染色体 6q24.2-q25.3 上的 180 kb 簇内。 RAET1 蛋白含有 MHC I 类样 α-1 和 α-2 结构域。 RAET1E 和 RAET1G(609244) 与其他 RAET1 蛋白(例如 RAET1I 或 ULBP1;605697)的不同之处在于,它们的 C 末端具有 I 型跨膜序列,而不是糖基磷脂酰肌醇锚定序列。 RAET1E 是 NKG2D(KLRK1; 611817) 的配体,在多种类型的免疫细胞表面表达,参与先天性和适应性免疫反应(Radosavljevic 等人(2002) 和 Cao 等人(2007) 总结) ))。
▼ 克隆与表达
Chalupny 等人通过搜索数据库中的 ULBP 同源物,然后对食管 mRNA 进行 RT-PCR(2003) 分离出编码 RAET1E 的 cDNA,他们将其称为 ULBP4。推导的 263 个氨基酸的蛋白质包含 α-1 和 α-2 结构域、跨膜结构域和短胞质尾。实时 RT-PCR 检测到皮肤中的表达量最高,气管中的表达量低得多,其他组织中的表达量为痕量。
科内霍-加西亚等人(2003) 分离出编码 RAET1E 的 cDNA,他们将其称为 LETAL。他们还鉴定出一种剪接变体,该变体编码一种缺乏 α-1 结构域 36 个氨基酸的蛋白质。实时 RT-PCR 检测到小肠中表达丰富,但在大多数其他测试组织中表达水平较低。 LETAL 在大多数测试的结肠癌细胞系中表达,但仅在 15 个卵巢癌细胞系中的 2 个中表达。
Bacon 等人使用 RT-PCR 分析(2004) 在几种肿瘤细胞系中检测到 RAET1E 表达,但在 5 种测试的正常组织中未检测到 RAET1E 表达。
通过 HO-8910 人卵巢癌细胞系的 RT-PCR 和 3-prime RACE,Cao 等人(2007) 鉴定了 RAET1E 的剪接变体,他们将其称为 RAET1E2。与全长 RAET1E 相比,推导的 209 个氨基酸的 RAET1E2 蛋白被截短,并且具有 2 个替代的 C 端氨基酸而不是 C 端跨膜结构域。 RT-PCR 在几种恶性肿瘤细胞系以及原发性宫颈和卵巢肿瘤细胞中检测到 RAET1E2 和 RAET1E。蛋白质印迹分析在 RAET1E 和 RAET1E2 阳性的肿瘤细胞系以及原代肿瘤细胞培养物中检测到 35 kD 和 40 kD 的蛋白质,分别对应于 RAET1E2 和 RAET1E。 HO-8910细胞、MGC-803人胃腺癌细胞系和HepG2人肝癌细胞系的上清液中检测到可溶性RAET1E2。
▼ 基因功能
Chalupny 等人使用流式细胞术分析(2003) 发现 ULBP4 结合 NKG2D(602893)。然而,与其他 ULBP 不同,ULBP4 不结合巨细胞病毒 UL16 糖蛋白。
科内霍-加西亚等人(2003) 证实了 LETAL 和 NKG2D 之间的结合。 RT-PCR 显示,与其他 NKG2D 配体不同,卵巢癌细胞系中的 LETAL 表达在视黄酸处理后下降。 LETAL 接合和 T 细胞受体(参见 186880)激活诱导 CD8(参见 186910)阳性 T 淋巴细胞增殖,以及 γ-干扰素(IFNG;147570)和白介素-2(IL2;147680)的分泌。此外,LETAL 表达诱导自然杀伤(NK) 细胞和 CD8 阳性 T 细胞杀死肿瘤细胞。
Bacon 等人使用流式细胞术分析(2004) 证明了 RAET1E、RAET1G 和 ULBP2(605698) 与 NKG2D 的结合。表达 RAET1E 或 RAET1G 的细胞是 NK 细胞杀伤的目标,但在抗 NKG2D 存在的情况下则不然。
Conejo-Garcia 等人使用免疫组织化学(2004) 发现缺乏 CD28(186760) 但表达 NKG2D 的 CD8 阳性细胞浸润卵巢肿瘤。激光捕获显微切割和 RT-PCR 分析表明,含有浸润淋巴细胞的肿瘤胰岛表达高水平的 LETAL,特别是在晚期卵巢癌中。 LETAL 表达被发现是改善生存的孤立预后因素。 LETAL 对 T 细胞受体介导的 CD8 阳性/CD28 阴性淋巴细胞增殖具有显着的共刺激作用。流式细胞术分析表明,用携带抗 CD3 抗体的 LETAL 表达细胞刺激淋巴细胞可显着诱导 GLUT1(SLC2A1;138140)表达,并增强 CD8 阳性淋巴细胞中的葡萄糖摄取。 LETAL 还可以保护细胞毒性淋巴细胞免受顺铂诱导的杀伤,并下调 FAS(TNFRSF6; 134637) 表达,从而减少 FAS 依赖性细胞凋亡。科内霍-加西亚等人(2004)提出LETAL在外周CD8阳性效应T细胞的稳态和针对肿瘤的免疫防御中具有重要作用。他们建议 LETAL 可用于离体扩增抗凋亡、肿瘤反应性细胞毒性淋巴细胞,以进行过继转移。
曹等人(2007) 表明,将 NK-92 自然杀伤细胞暴露于 RAET1E2(RAET1E 的一种分泌型可溶性异构体),会降低其表面 NKG2D 的表达。它还降低了 NK-92 细胞对 HepG2 细胞、MGC-803 细胞和 K562 人类慢性粒细胞白血病细胞的细胞毒性。曹等人(2007) 得出结论,肿瘤细胞表达 RAET1E2 会损害 NKG2D 介导的细胞杀伤,使肿瘤细胞逃避免疫反应。
▼ 基因结构
拉多萨夫列维奇等人(2002) 确定 RAET1E 基因包含 4 个外显子,跨度约为 2.4 kb。科内霍-加西亚等人(2003)证实了RAET1E基因结构。曹等人(2007) 鉴定了 RAET1E2 剪接变体使用的内含子 3 中的终止密码子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Radosavljevic 等人(2002) 将 RAET1E 基因定位到染色体 6q24.2-q25.3,着丝粒为 RAET1F,一个假基因。
▼ 分子遗传学
罗姆弗鲁克等人(2009) 对 176 名健康、无关的泰国东北部人的 RAET1E、RAET1G、RAET1H(ULBP2)、RAET1I、RAET1L(611047) 和 RAET1N(ULBP3; 605699) 基因的多态性外显子 2 和 3 进行了测序,这些基因均编码 NKG2D 的配体。他们鉴定了几个 SNPS,包括 RAET1E、RAET1G 和 RAET1H 中的非同义 SNP。值得注意的是,RAET1N 基因在白种人中呈多态性,但在泰国人群中似乎并不具有多态性。罗姆弗鲁克等人(2009) 提出 RAET1 多态性可能有助于未来分析不同疾病条件下的免疫反应。