X连锁小肌蛋白; SMPX
凿子,小鼠,同源;CSL
HGNC 批准的基因符号:SMPX
细胞遗传学位置:Xp22.12 基因组坐标(GRCh38):X:21,705,978-21,758,116(来自 NCBI)
▼ 说明
SMPX 基因编码一种最初在骨骼肌中分离的蛋白质,在保护肌膜质膜免受机械应力方面发挥着重要作用(Abdelfatah 等人总结,2013)。
▼ 克隆与表达
帕扎克等人(1999) 研究了 Lee 等人先前通过相互探测鉴定的部分 cDNA 克隆(1995)。通过搜索表达和基因组数据库,Patzak 等人(1999) 鉴定了 21 个 EST,允许分配 887 bp 的人类扩展共有序列,表明有一个完全表达的基因,称为 SMPX。通过使用人类共有序列,可以通过对文库筛选获得的其他 SMPX染色体连锁克隆进行完整测序来比对和确认直系同源小鼠和大鼠 Smpx 基因。人类和啮齿动物 SMPX 基因分别编码 88 至 86 和 85 个氨基酸的蛋白质。 Northern 印迹分析显示 SMPX 在心脏和骨骼肌中优先且丰富地表达。
坎普等人(2001) 发现被动拉伸后小鼠骨骼肌中的 Smpx 基因上调。推导的 85 个残基蛋白的预测分子量为 9.25 kD,并包含核定位基序和 2 个酪蛋白激酶 II 磷酸化位点。 Northern blot分析检测到1.1 kb mRNA转录本,在骨骼肌和心脏中高表达,在脑中表达较弱。免疫染色显示 Smpx 定位于体外分化培养的成肌细胞的细胞核,并在发育中的小鼠心脏中表达。
帕尔默等人(2001) 鉴定出小鼠 Smpx 基因,他们将其称为 Chisel(Csl),作为心脏同源域因子 Nkx2-5 的靶标(600584)。 Csl 基因在胚胎和成人骨骼肌和心脏中表达。 Northern 印迹分析检测到 1.1 至 1.2 kb 的转录本。
▼ 基因结构
帕扎克等人(1999)发现SMPX基因由5个外显子和4个内含子组成,总共52.1 kb。
▼ 测绘
作者:FISH,Patzak 等人(1999) 将 SMPX 基因定位在标记 DXS7101 附近,距 Xp22.1 处 X 染色体短臂端粒 31.9 cM。他们通过单染色体和亚染色体作图面板上的 PCR 以及使用 CEPH YAC 库证实了这一分配。作者得出的结论是,表达和图谱数据使 SMPX 成为 X 连锁心脏或肌肉疾病的候选者。
▼ 基因功能
在发育小鼠中,Palmer 等人(2001) 发现 Smpx 首次在 E8.25 处的肌细胞中检测到,该肌细胞位于正在进行主动融合的心脏祖细胞区域的腹侧表面,以及心脏循环早期阶段的心室外曲率处。在胚胎骨骼肌中,转录本在 E11.5 处很明显。在 E13.5,Smpx 存在于体节的肌瘤区室以及发育中的四肢、头部和颈部肌肉中,其模式类似于生肌调节因子基因肌细胞生成素(MYOG; 159980)。在成年小鼠中,Smpx 在所有心室和骨骼肌中均强烈表达。在细胞内,Smpx 定位于肌丝和肋节,它们是细胞骨架/膜粘附复合物的肌膜下位点。 Smpx 在培养的成肌细胞中过度表达,由于诱导突出的板状伪足伴随着膜褶皱,导致成肌细胞尺寸变大。表达 Smpx 的成肌细胞响应 IGF1(147440) 显示出增强的分化和融合。 Smpx 在发育过程中的动态细胞骨架定位表明,Smpx 可能在调节网络中发挥作用,肌肉细胞通过该网络在生长、适应和修复过程中协调其结构和功能状态。
Huebner 等人在 HeLa 细胞中(2011) 发现板状伪足中 SMPX 的主要细胞内染色和富集,以及与纽蛋白(193065) 的部分重叠,尤其是在细胞外周的粘附复合物中。小鼠耳蜗的免疫染色显示不同细胞类型中存在 Smpx,包括 Bottcher 细胞、根细胞、柱细胞和螺旋缘的齿间细胞。在毛细胞中也检测到低水平的 Smpx 免疫反应性。
施拉德斯等人(2011) 在第 8 周时发现 SMPX 在人类内耳中表达。妊娠期和妊娠 14.5 天时的小鼠内耳。来自成年人的视网膜也显示出相对较高水平的 SMPX 转录本。
▼ 分子遗传学
X连锁耳聋4
Huebner 等人在 2 个患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4; 300066) 的无关家庭中(2011) 在 SMPX 基因中发现了 2 个不同的截短突变(分别为 300226.0001 和 300226.0002)。注意到 SMPX 的一个特征是对物理力做出反应,作者认为,内耳中 SMPX 的丢失可能会使某些细胞容易受到听力过程固有的机械挑战的压力。
施拉德斯等人(2011) 在 2 个 DFNX4 家族中孤立鉴定出 SMPX 基因中另外 2 个截短突变(分别为 300226.0003 和 300226.0004)。作者认为 SMPX 在感觉毛细胞的发育和/或维持中发挥作用。
阿卜杜勒法塔赫等人(2013) 在来自纽芬兰的 2 个大型多代家庭的 DFNX4 受影响成员中发现了 SMPX 基因(R34EfsX47; 300226.0005) 的截短突变。单倍型分析表明存在创始人效应。携带该突变的男性会出现进行性、严重的双侧感音神经性耳聋,影响所有频率。它通常在语言前发病,但不一定从出生时就出现,因为至少有 2 名男性在第一个十年发病,并且在学校有困难。女性突变携带者表现出不同的表型,一些患有早发性听力损失,另一些则患有晚发性听力损失。突变携带者均未出现肌无力。
远端肌病 7,成人发病,X 连锁
Johari 等人在来自 9 个不相关家庭的 10 名患有 X 连锁成人发病远端肌病 7(MPD7; 301075) 的男性中进行了研究(2021) 鉴定出 SMPX 基因(300226.0006-300226.0009) 中的半合子错义突变。这些突变是通过外显子组测序或目标基因组测序发现的,并通过桑格测序证实,在现有的健康家庭成员中不存在。单倍型分析显示一些家族之间存在共同的单倍型,这表明创始人效应。患者在20至60岁之间出现远端肌无力;没有人有听力损失。大多数患者肌肉活检显示肌浆内含物 SMPX 染色呈阳性,并且它们倾向于形成淀粉样蛋白样聚集。与更接近 C 末端的 S78N 突变(300226.0006) 的患者相比,N 末端突变的老年患者有更多的肌浆内含物和 SMPX 积聚病理。内含物和蛋白质积累是异质的:一些纤维含有 SMPX 内含物,并且还观察到肌原纤维病变。进一步的研究显示突变蛋白的正常亚细胞定位,并且 SMPX 的过度表达显示出与应激颗粒(SG) 的一些共定位,表明 SMPX 可能影响 SG 动态。乔哈里等人(2021) 假设导致肌肉疾病的错义 SMPX 变体通过与突变蛋白肌浆聚集相关的功能获得机制起作用。
▼ 动物模型
帕尔默等人(2001)发现Smpx缺失小鼠的心脏或骨骼肌没有明显的发育缺陷,表明功能冗余。
▼ 等位基因变异体(9 个精选示例):
.0001 耳聋,X染色体连锁 4
SMPX、GLY59TER
在患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4; 300066) 的西班牙家庭的受影响成员中,最初由 del Castillo 等人报道(1996),休布纳等人(2011) 在 SMPX 基因的外显子 4 中发现了 175G-T 颠换,导致 gly59 至 ter(G59X) 取代。突变转录本预计会经历无义介导的 mRNA 衰变,导致功能丧失。体外功能表达研究表明,细胞膜上不存在突变蛋白。
.0002 耳聋,X染色体连锁 4
SMPX、GLU37TER
Huebner 等人在患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4; 300066) 的德国大家庭的受影响成员中(2011) 在 SMPX 基因的外显子 3 中发现了 109G-T 颠换,导致 glu37-to-ter(E37X) 取代。突变转录本预计会经历无义介导的 mRNA 衰变,导致功能丧失。
.0003 耳聋,X染色体连锁 4
SMPX、GLU72TER
Schraders 等人在患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4;300066)的荷兰血统 5 代大家族的受影响成员中(2011) 在 SMPX 基因的外显子 4 中发现了 214G-T 颠换,导致 glu72-to-ter(E72X) 取代。在 172 名对照者中未发现该突变。
.0004 耳聋,X染色体连锁 4
SMPX、1-BP DEL、130G
Schraders 等人在患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4; 300066) 的家庭受影响成员中(2011) 在 SMPX 基因的外显子 3 中发现了 1 bp 缺失(130delG),导致移码和过早终止。在 129 个对照中未发现该突变。
.0005 耳聋,X染色体连锁 4
SMPX、1-BP DEL、99C
在来自纽芬兰的一个患有 X 连锁耳聋 4(DFNX4; 300066) 的大型多代亲属的受影响成员中,Abdelfatah 等人(2013) 在 SMPX 基因的外显子 3 中发现了 1 bp 缺失(99delC),导致移码和提前终止(Arg34GlufsTer47)。通过连锁和单倍型分析结合候选基因测序来鉴定突变。对患者类淋巴母细胞的分析表明,该突变不会导致无义介导的 mRNA 衰减。随后在另一个纽芬兰家庭中发现了相同的突变,该家族具有从 229 名患有听力损失的加拿大先证者组成的队列中确定的相似表型。单倍型分析表明纽芬兰的两个家庭存在创始人效应。携带该突变的男性会出现进行性、严重的双侧感音神经性耳聋,影响所有频率。它通常在语言前发病,但不一定从出生时就出现,因为至少有 2 名男性在第一个十年发病,并且在学校有困难。女性突变携带者表现出不同的表型,一些患有早发性听力损失,另一些则患有晚发性听力损失。突变携带者均未出现肌无力。
.0006 远端肌病,7 ,成人发病,X 连锁
SMPX、SER78ASN
Johari 等人在来自 5 个不相关家庭(F1-F5) 的 6 名患有 X 连锁成人发病远端肌病 7(MPD7; 301075) 的男性中,(2021) 在 SMPX 基因的外显子 4 中发现了一个半合子 c.233G-A 转换(c.233G-A, NM_014332.3),导致 ser78 到 asn(S78N) 的取代。该突变是通过外显子组测序或目标基因组测序发现的,并通过桑格测序证实,在其中 2 个家庭的 3 名健康家庭成员中不存在这种突变。 gnomAD 数据库中不存在该变体。家族 1-5 的共同祖先可追溯到马耳他。单倍型分析显示 F1 和 F2 之间存在共同的单倍型,表明存在创始人效应。这些患者在 20 至 54 岁之间出现远端肌无力。体外研究表明,与野生型相比,突变蛋白的可溶性稍差。
.0007 远端肌病,7 ,成人发病,X 连锁
SMPX、PRO27ALA
Johari 等人在 2 名来自 F6 和 F7 家族的 60 多岁无亲属关系的法国男性中,患有 X 连锁成人发病远端肌病 7(MPD7;301075)(2021) 在 SMPX 基因的外显子 3 中发现了半合子 c.79C-G 颠换(c.79C-G, NM_014332.3),导致 pro27 到 ala(P27A) 的取代。该突变是通过靶向测序发现并经桑格测序证实的,在 4 名未受影响的家庭成员中不存在该突变。 F6中有1名无症状携带者女性。 gnomAD 数据库中不存在该变体。单倍型分析表明存在创始人效应。体外研究表明,与野生型相比,突变蛋白的可溶性稍差。
.0008 远端肌病,7 ,成人发病,X 连锁
SMPX、ALA13VAL
Johari 等人在一名患有 X 连锁成人发病远端肌病 7(MPD7; 301075) 的 67 岁德国男性(F8 家族)中(2021) 在 SMPX 基因的外显子 2 中发现了半合子 c.38C-T 转换(c.38C-T, NM_014332.3),导致 ala13 到 val(A13V) 的替换。该突变是通过靶向测序发现并经桑格测序证实的,但在gnomAD数据库中并不存在。没有进行家庭内部的隔离研究,但没有其他受影响的家庭成员。将突变转染到 HeLa 细胞中表明,与野生型相比,它的溶解度较低,并且有聚集的趋势。他 43 岁时出现下肢远端肌肉无力。
.0009 远端肌病,7 ,成人发病,X 连锁
SMPX、PRO7THR
Johari 等人在一名患有 X 连锁成人发病远端肌病 7(MPD7; 301075) 的 77 岁芬兰男性(F9 家族)中进行了研究(2021) 在 SMPX 基因的外显子 2 中鉴定出半合子 c.19C-A 颠换(c.19C-A, NM_014332.3),导致 pro7 至 thr(P7T) 取代。该突变是通过靶向测序发现并经桑格测序证实的,在gnomAD数据库中发现频率较低(205,256个等位基因中的6个,2.92 x 10(-5))。没有进行家庭内部的隔离研究,但没有其他受影响的家庭成员。将突变转染到 HeLa 细胞中表明,与野生型相比,它的溶解度较低,并且有聚集的趋势。他在 60 岁时出现进行性远端肢体无力。