凋亡拮抗转录因子; AATF

CHE1

HGNC 批准的基因符号:AATF

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:36,948,954-37,056,871(来自 NCBI)

▼ 说明

AATF 是一种参与基因转录和细胞增殖调节的核蛋白(Di Padova 等,2003)。

▼ 克隆与表达

Fanciulli 等人通过使用 RNA 聚合酶 II 的核心亚基 RPB11(604150) 作为诱饵,然后使用 5-prime RACE 进行酵母 2-杂交分析(2000) 从骨骼肌 cDNA 文库中克隆了 AATF,他们将其称为 CHE1。推导的 558 个氨基酸的蛋白质的计算分子量约为 62.3 kD。 CHE1 包含一个典型的亮氨酸拉链基序和 3 个分布在整个蛋白质中的核受体结合 LxxLL 共有序列。 Northern 印迹分析检测到 2.1 kb 转录物在心脏、骨骼肌和睾丸中高水平表达,而在所有其他分析组织中低水平表达。

Lindfors 等人通过差异显示肠隐窝上皮细胞系中 TGFB(190180) 下调的基因(2000) 克隆 AATF。 AATF 转录物包含几个 4 核苷酸重复序列,推导的 560 个氨基酸蛋白质包含一个亮氨酸拉链基序、几个磷酸化位点、一个核定位信号和 3 个核受体 LxxLL 结合基序。 Northern 印迹分析在所有检查的正常组织中检测到 2.4 kb 转录物。

摩纳哥等人(2003) 克隆小鼠 Che1,它编码推导的 526 个氨基酸的蛋白质。 Northern印迹分析检测到表达无处不在,在心脏、大脑、肺和睾丸中表达水平最高。

▼ 基因功能

通过突变分析,Fanciulli 等人(2000) 确定 RPB11 富含亮氨酸的 C 端 α 基序与 CHE1 结合。他们发现 CHE1 在体外和体内通过 2 个不同的结构域结合视网膜母细胞瘤易感基因 RB1(614041)。 CHE1 通过逆转 RB1 对 E2F1(对 G1/S 转变至关重要的转录因子)的抑制作用来对抗 RB1 的生长抑制功能。

Monaco 等人使用启动子报告构建体和人 CHE1 共转染的小鼠成纤维细胞(2003) 证明 CHE1 的过度表达会抑制其自身启动子的活性。染色质免疫沉淀分析证实CHE1通过结合其自身的启动子发挥其抑制作用。

迪帕多瓦等人(2003) 发现与匹配的正常组织相比,CHE1 表达在多种肿瘤中下调,包括结肠癌和肾癌。 CHE1 过表达通过以 p53(190070) 依赖性方式激活细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 WAF1(CDKN1A; 116899) 并促进细胞周期 G1 期的生长停滞,从而抑制 2 种结肠癌细胞系的增殖。 CHE1 通过从 WAF1 启动子的 Sp1(189906) 结合位点置换组蛋白脱乙酰酶-1(HDAC1;601241) 并在这些位点上积累组蛋白 H3(参见 602810)来激活 WAF1。通过干扰 RNA 下调 CHE1 可抑制 WAF1 反式激活并增加细胞增殖。迪帕多瓦等人(2003) 得出结论,CHE1 是一般 HDAC1 的竞争对手。

▼ 基因结构

摩纳哥等人(2003) 确定小鼠 Aatf 基因包含 13 个外显子,跨度为 35 kb。启动子区域不包含 TATA 或 CAAT 框。

▼ 测绘

作者:FISH,Lindfors 等人(2000) 将 AATF 基因对应到染色体 17q11.2-q12,着丝粒到 ERBB2 基因(164870)。摩纳哥等人(2003) 将小鼠 Aatf 基因定位到 11 号染色体,靠近 Lim1 基因(601999)。