CALICIN; CCIN
HGNC 批准的基因符号:CCIN
细胞遗传学位置:9p13.3 基因组坐标(GRCh38):9:36,169,388-36,171,334(来自 NCBI)
▼ 说明
在哺乳动物精子中,细胞核周围致密的细胞质网包含一种称为核周卵泡膜的复杂结构。隆戈等人(1987) 确定 2 种碱性蛋白质是花萼结构的主要成分:calicin(一种几乎仅位于花萼的 60 kD 蛋白质)和一组多带多肽(MBP 或 cylicins;参见 300768)存在于花萼和顶体下层。
▼ 克隆与表达
冯·布洛等人(1995)从公牛精子中纯化出calicin并确定了部分蛋白质序列。通过使用基于 calicin 蛋白序列的寡核苷酸引物对睾丸 cDNA 进行 PCR 分析,他们分离出了编码 calicin 的牛和人 cDNA。预测的牛蛋白含有 588 个氨基酸,计算的等电点为 8.1。部分人cDNA编码一种蛋白质,其起始位置对应于牛钙素的第四个氨基酸。总体而言,2 种 calicins 91% 相同。 calicin 蛋白中间有 3 个连续的重复序列。序列比较显示,calicin 与果蝇 kelch 蛋白具有同源性,该蛋白与连接卵母细胞和滋养细胞的卵室中富含肌节蛋白的细胞间桥(环管)相关。冯·布洛等人(1995) 指出,在畸形人类精子的头部中,例如“圆头”畸形精子症,calicin 缺失或以显着不同的方式排列。精子或其他“顶体后鞘缺陷”。
通过免疫印迹分析,Lecuyer 等人(2000) 表明,野猪和人类精子头的蛋白质提取物中存在 Calicin。免疫印迹分析表明,calicin 存在于人类生精细胞中。免疫荧光分析显示野猪和人类精子细胞中均存在花萼结构。在公猪和人类睾丸中,calicin 与肌节蛋白一起存在于圆形精子细胞的顶体区域中(参见 102560),并且主要位于晚期精子细胞和精子的顶体后区域。对纯化的猪钙素的 HPLC 凝胶过滤分析表明,钙素在体外形成同多聚体。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 CCIN 序列(GenBank AF333334) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CCIN 基因对应到染色体 9p13.3。
▼ 基因功能
Lecuyer 等人使用从公猪精子头中纯化的 Calicin(2000) 表明 calicin 以高亲和力和大约 1:12 的化学计量与 F-肌节蛋白结合。
▼ 分子遗传学
有关生精失败(参见 258150)和 CCIN 基因变异之间可能关联的讨论,请参见 603960.0001。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 意义未知的变体
CCIN,GLY285SER
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对生精失败的贡献尚未得到证实(参见 258150)。
Oud 等人通过对 15 名患有球形精子症或顶体发育不全的不育男性进行外显子组测序,这些男性的已知球形精子症相关基因 SPATA16(609856) 和 DPY19L2(613893) 突变呈阴性(2020) 鉴定出一名患有球形精子症的黎巴嫩男子(GL-12),其 CCIN 基因中的 c.853G-A 转换(NM_005893.2) 是纯合子,导致保守的 gly285 到 Ser(G285S) 取代Kelch 结构域内的残基。先证者的精液分析显示精子浓度降低以及缺乏顶体的圆头精子。据报道,先证者是近亲父母所生,有3个不育兄弟,但隔离分析尚未发表。该变体存在于 gnomAD 数据库的非芬兰欧洲人群中,次要等位基因频率为 0.0001。