含有三核苷酸重复的基因 6B; TNRC6B
KIAA1093
HGNC 批准的基因符号:TNRC6B
细胞遗传学位置:22q13.1 基因组坐标(GRCh38):22:40,044,834-40,335,808(来自 NCBI)
▼ 说明
TNRC6B 基因编码参与翻译抑制的蛋白质。它属于与 argonaute(Ago) 蛋白相关的蛋白质家族,后者是转录后基因沉默的中心效应子(Granadillo 等人的总结,2020)。
▼ 克隆与表达
Kikuno 等人通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,(1999) 克隆了 TNRC6B,他们将其命名为 KIAA1093。推导的 1,203 个氨基酸的蛋白质包含 RNA 识别基序。 RT-PCR ELISA 检测到在所检查的所有组织和特定脑区域中均有中等表达,其中在小脑中表达最高。
施耐德等人(2006) 指出 1,727 个氨基酸的 TNRC6B 蛋白包含富含甘氨酸/色氨酸(GW) 的 N 端结构域、中央富含谷氨酰胺的区域和 C 端 RNA 识别基序。
格拉纳迪略等人(2020) 指出 TNRC6B 普遍表达,在某些脑组织中表达水平较高,包括额叶皮层、基底神经节和小脑。
▼ 基因功能
梅斯特等人(2005) 发现 TNRC6B 与含有 AGO2(EIF2C2; 606229)、DICER(606241) 和 MOV10(610742) 的细胞质 HeLa 细胞蛋白复合物共纯化。表位标记的 TNRC6B 与标记的 AGO1(EIF2C1; 606228) 和标记的 AGO2 共免疫沉淀。 HeLa 细胞培养物中需要 TNRC6B 来介导 microRNA 引导的 mRNA 切割。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Kikuno 等人(1999) 将 TNRC6B 基因定位到 22 号染色体。
Stumpf(2021) 根据 TNRC6B 序列(GenBank BC028626) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TNRC6B 基因对应到染色体 22q13.1。
▼ 分子遗传学
Eising 等人在患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常的 4 岁女孩(患者 15)中(GDSBA;619243)(2019) 鉴定了 TNRC6B 基因中的从头杂合无义突变(W680X; 610740.0001)。该突变是通过全基因组测序发现的,并通过桑格测序证实。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
Granadillo 等人在 17 名无关的 GDSBA 患者中进行了研究(2020) 鉴定了 TNRC6B 基因中的 17 个不同的杂合突变(参见,例如 610740.0002-610740.0006)。这些患者是通过 GeneMatcher 项目推动的多个机构之间的合作来确定的。大多数患者是通过外显子组测序来识别的;其中一些以下一代测序为目标。这些突变已通过桑格测序证实,但在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。已证实有 10 种突变从头发生,其中 3 种是从轻度受影响的父母遗传的,4 种分离状态未知。有 7 个无义、5 个移码、2 个剪接位点、2 个基因内缺失和 1 个错义变异。大多数发生在外显子 5 中,表明可能存在热点,尽管外显子 5 是最大的外显子。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计所有这些都会导致功能丧失和单倍体不足。六名患者有额外的基因发现,这些发现可能与表型相关,具有不同的相关性。
▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):
.0001 伴有言语和行为异常的全面发育迟缓
TNRC6B、TRP680TER
Eising 等人在患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常的 4 岁女孩(患者 15)中(GDSBA;619243)(2019) 鉴定了 TNRC6B 基因中的从头杂合 c.2040G-A 转变(c.2040G-A,ENST00000454349),导致 trp680 到 ter(W680X) 取代。该突变是通过全基因组测序发现的,并通过桑格测序证实。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
.0002 伴有言语和行为异常的整体发育迟缓
TNRC6B、GLN627TER
Granadillo 等人对一名患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常的 6 岁中国男孩(患者 2)(GDSBA;619243)进行了研究(2020) 在 TNRC6B 基因的外显子 5 中鉴定出一个从头杂合的 c.1879C-T 转换(c.1879C-T,NM_001162501.1),导致 gln627 到 ter(Q627X) 的取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
.0003 伴有言语和行为异常的整体发育迟缓
TNRC6B、1-BP DEL、NT4872
Granadillo 等人对一名 3.7 岁的中国女孩(患者 3)进行了研究,该女孩患有整体发育迟缓并伴有言语和行为异常(GDSBA; 619243)(2020) 在 TNRC6B 基因的外显子 20 中发现了一个从头杂合的 1-bp 缺失(c.4872del, NM_001162501.1),导致移码和提前终止(Thr1625GlyfsTer40)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
.0004 伴有言语和行为异常的整体发育迟缓
TNRC6B、GLN1323TER
Granadillo 等人对一名 12 岁白人男孩(患者 7)进行了研究,该男孩患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常(GDSBA;619243)(2020) 在 TNRC6B 基因的外显子 15 中发现了一个从头杂合的 c.3967C-T 转换(c.3967C-T,NM_001162501.1),导致 gln1323 到 ter(Q1323X) 的取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
.0005 伴有言语和行为异常的整体发育迟缓
TNRC6B、IVS9AS、G-C、+5
Granadillo 等人对一名 13 岁白人男孩(患者 10)进行了研究,该男孩患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常(GDSBA; 619243)(2020) 鉴定了 TNRC6B 基因内含子 9(c.3262+5G-C, NM_001162501.1) 中的从头杂合 G 到 C 颠换,预计会导致剪接位点改变。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。
.0006 伴有言语和行为异常的全面发育迟缓
TNRC6B、VAL1357GLU
Granadillo 等人对一名 2.6 岁汉族男孩(患者 12)进行了研究,该男孩患有全身发育迟缓并伴有言语和行为异常(GDSBA;619243)(2020) 在 TNRC6B 基因的外显子 15 中鉴定出从头杂合的 c.4070T-A 颠换(c.4070T-A,NM_001162501.1),导致 val1357-to-glu(V1357E) 在保守残基处取代沉默域。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在包括 gnomAD 在内的多个公共数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。