Polycomb 同系物 1 的增强剂； EPC1

Polycomb 增强剂，果蝇，同源物，1

HGNC 批准的基因符号：EPC1

细胞遗传学位置：10p11.22 基因组坐标（GRCh38）：10:32,267,751-32,378,769（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Shimono 等人使用 RFP（TRIM27; 602165）作为睾丸 cDNA 文库的酵母 2-杂交筛选中的诱饵，然后进行 3-prime 和 5-prime RACE（2000）克隆了EPC1。推导的 836 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 92 kD。它具有 EPcA、EPcB 和 EPcC 结构域以及 Qx 区域，所有这些结构域从酵母到人类都高度保守。内源性 EPC1 定位于人结直肠腺癌细胞系的核结构域和核膜。

NuA4 组蛋白乙酰转移酶（HAT）复合物负责酵母中组蛋白 H4（参见 602822）和 H2A（参见 613499）N 末端尾部的乙酰化。其催化亚基 Esa1 与人 TIP60（HTATIP; 601409）同源。 Doyon 等人使用亲和纯化、蛋白质印迹分析、细胞分级分离、免疫沉淀和质谱分析（2004）发现 TIP60 及其剪接变体 TIP60B/PLIP 是多亚基 NuA4 复合物的一部分，在多种人类细胞系中具有 HAT 活性。他们鉴定了 12 个酵母 NuA4 亚基中的 11 个的人类同源物，包括 EPC1。在 NuA4 复合物中检测到 EPC1 的两种亚型，分别含有 813 和 836 个氨基酸。

Kee 等人在心脏 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中使用 HOP（607275）作为诱饵（2007）克隆了EPC1。 Northern 印迹分析检测到 4 kb 转录物的普遍表达，在心脏和骨骼肌中表达水平最高。对胚胎小鼠的免疫组织化学分析发现，心脏中的 Epc1 表达随着年龄的增长而降低，但骨骼肌中的表达却随着年龄的增长而增加。 Epc1 也在内皮、脊神经节和软骨中表达，但在大脑中不表达。

▼ 基因功能

下野等人（2000）发现 RFP 与 EPC1 相互作用，并且这两种蛋白质都会抑制基因转录。酵母2-杂交分析表明，RFP 的卷曲螺旋结构域与 EPC 的 EPcA 结构域和 C 末端区域相关。两种蛋白质均从人类细胞裂解物中共沉淀，并且大部分共定位于细胞核中。 RFP 的卷曲螺旋结构域和 EPC1 的 C 末端区域在报告基因检测中抑制转录活性，而 EPC1 的 EPcA 结构域则激活转录活性。

多永等人（2004）发现 TIP60、EPC1 和 ING3（607493）的重组三聚体复合物足以在体外重建核小体 HAT 活性。

基等人（2007）发现在大鼠成肌细胞系分化为骨骼肌细胞期间 Epc1 表达上调。分化是由 Epc1 过度表达诱导的，并且在 Epc1 敲低细胞中严重受损。 Hop 的共转染增强了 Epc1 诱导的肌细胞生成素（MYOG; 159980）反式激活和肌管形成。 Hop 基因敲除小鼠的骨骼肌显示肌球蛋白重链（见 160730）和肌细胞生成素的表达减少，并且 Hop 基因敲除小鼠的腿筋肌肉显示损伤后愈合延迟。 Hop 基因敲除小鼠的骨骼肌成肌细胞的分化受到损害。基等人（2007）得出结论，EPC1 在骨骼肌分化的启动中发挥作用，并且其与 HOP 的相互作用是充分活动所必需的。

▼ 分子遗传学

胰腺癌的体细胞突变

比安金等人（2012）进行了外显子组测序和拷贝数分析，以确定前瞻性临床队列中的基因组畸变，该队列由 142 名早期（I 期和 II 期）散发性胰腺导管腺癌患者组成。对 99 个信息丰富的肿瘤的详细分析发现了显着的异质性，其中包括 2,016 个非沉默突变和 1,628 个拷贝数变异。比安金等人（2012）定义了 16 个显着突变的基因，重申了已知的突变并揭示了新的突变基因，包括参与染色质修饰的其他基因（EPC1 和 ARID2，609539）、DNA 损伤修复（ATM；607585）和其他机制（ZIM2（参见 601483））；MAP2K4，601335；NALCN，611549；SLC16A4，603878；和 MAGEA6，300176）。与体外功能数据和动物模型的综合分析为这些遗传畸变在致癌作用中的潜在作用提供了支持证据。对反复突变基因的基于通路的分析概括了胰腺导管腺癌核心信号通路中的聚类，并在每个通路中鉴定了新的突变基因。比安金等人（2012）还发现了传统上被描述为轴突引导胚胎调节因子的基因中频繁且多样的体细胞畸变，特别是 SLIT/ROBO（见 603742）信号传导，这在小鼠睡美人转座子介导的胰腺癌体细胞突变模型中也很明显，提供轴突引导基因可能参与胰腺癌发生的进一步支持证据。

▼ 测绘

通过辐射混合分析，Shimono 等人（2000）将 EPC1 基因定位到染色体 10p11。