锌指蛋白 513; ZNF513
HGNC 批准的基因符号:ZNF513
细胞遗传学位置:2p23.3 基因组坐标(GRCh38):2:27,377,235-27,380,734(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
纳兹等人(2010) 将常染色体隐性遗传色素性视网膜炎的基因座对应到巴基斯坦近亲家庭的染色体 2p24.1-p22.3 上。通过寻找该区域的基因,Li 等人(2010) 鉴定出 ZNF513。推导的541个氨基酸的蛋白质具有2个N端核定位信号和3个C2H2型锌指基序。定量 RT-PCR 检测到小鼠中普遍存在的表达。在小鼠眼组织中,视网膜中的表达最高,晶状体和角膜中的表达最低。小鼠 Znf513 的视网膜表达随着年龄的增长而逐渐增加,并在 180 至 300 天之间开始趋于平稳。人视网膜原位杂交在外核层、内核层和神经节细胞层检测到ZNF513。荧光标记的 ZNF513 在转染的 COS-7 细胞的分散核灶中表达,但不在核仁中表达。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Li 等人(2010) 将 ZNF513 基因定位到染色体 2p24.1-p22.3
▼ 基因功能
Li 等人使用转染的小鼠成纤维细胞进行染色质免疫沉淀分析(2010) 发现人类 ZNF513 结合一小部分剪切 DNA。具体来说,ZNF513 与视网膜转录因子 Pax6(607108) 和 Sp4(600540) 的近端启动子及其靶标视紫红质(RHO; 180380)、Irbp(RBP3; 180290)、Arr3(301770) 和光感受器视蛋白(例如,OPN1SW;613522)。
▼ 分子遗传学
Naz 等人之前研究过,在巴基斯坦家庭的受影响成员中,将常染色体隐性视网膜色素变性对应到染色体 2p24.1-p22.3(2010),李等人(2010) 分析了 33 个候选基因并鉴定了 ZNF513 基因中的纯合突变(C339R; 613598.0001)。
▼ 动物模型
通过数据库分析,Li 等人(2010)发现Znf513在早期胚胎斑马鱼的大脑和眼睛中表达。他们表明,斑马鱼胚胎中 Znf513 的敲低会导致视网膜发育异常,对光感受器产生重大影响,包括视网膜变薄并伴有光感受器变性。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 色素性视网膜炎 58(1 个家族)
ZNF513、CYS339ARG
Naz 等人之前研究过,患有色素性视网膜炎(RP58; 613617) 的巴基斯坦近亲家庭成员受到影响(2010),李等人(2010) 鉴定了 ZNF513 基因外显子 4 中 1015T-C 转变的纯合性,导致高度保守残基处的 cys339 到 arg(C339R) 取代。该突变在家族中随疾病分离,并且在 242 条种族匹配的染色体中未发现。功能研究表明,与野生型转录本相比,突变型 Znf513 转录本未能挽救敲低斑马鱼的异常视网膜发育,并且突变蛋白未能与视网膜特异性基因的启动子结合。