聚(rC)-结合蛋白2； PCBP2

异质核核糖核蛋白 E2； HNRNPE2
HNRPE2

HGNC 批准的基因符号：PCBP2

细胞遗传学位置：12q13.13 基因组坐标（GRCh38）：12:53,452,102-53,481,162（来自 NCBI）

▼ 说明

异质核核糖蛋白 E2 是一种具有翻译调节功能的聚（rC）结合蛋白（Ostareck-Lederer et al., 1998）。

▼ 克隆与表达

莱弗斯等人（1995）描述了聚（rC）结合蛋白的 2 个 cDNA 的克隆和表征，他们将其称为 PCBP1（601209）和 PCBP2。作者分析了 EST 数据库中预测编码具有 K 同源（KH）结构域的蛋白质的序列。 60 至 70 个氨基酸的 KH 基序存在于几种假定的核酸结合蛋白中，例如 FMR1（309550）和 HNRNPK（600712），并且被认为参与 RNA 结合。作者使用 1 EST 的引物制作了一种探针，用于筛选转化的人羊膜细胞的 cDNA 文库。他们分离出的 PCBP1 cDNA 编码一种推定的 356 个氨基酸的蛋白质，其中包含 3 个 KH 结构域。它在DNA水平上与PCBP2有83%的同源性，在氨基酸水平上有90%的同源性。 PCBP2 蛋白与小鼠 hnRNP-X/mCTBP 蛋白相似度约为 99%（Hahm 等人，1993），并且可能是同源物。

Chkheidze 和 Liebhaber（2003）确定内源性 HeLa 细胞 PCBP2 以颗粒状和弥漫性染色模式定位于细胞核，该模式与 PCBP1 观察到的斑点模式不同。他们在 PCBP2 内、KH2 和 KH3 之间的 9 个氨基酸片段内以及 KH3 的 12 个氨基酸片段内发现了 2 个核定位信号。突变分析表明，这两种信号都是核定位所必需的。 PCBP2 的剪接变体包含 KH2 和 KH3 之间的 31 个氨基酸片段，显示出细胞核和细胞质分布。

▼ 基因功能

当痘苗病毒系统在转化的羊膜细胞中表达时，Leffers 等人（1995）发现 PCBP1 和 PCBP2 在未磷酸化时均结合聚（rC）；磷酸化蛋白质以低得多的亲和力结合。在所有分析的人体组织中均检测到了两种 PCBP 的转录本。

Perrotti 等人研究了分化停滞，这是具有融合 BCR-ABL 基因（151410）的慢性粒细胞白血病细胞的一个特征（2002）发现 BCR-ABL 调节粒细胞分化的主要调节因子 C/EBP-α（CEBPA; 116897）的表达，诱导 HNRNPE2，从而抑制 CEBPA mRNA 的翻译。

Eiring 等人使用小鼠和人骨髓性白血病细胞系（2010）表明 microRNA-328（MIR328; 613701）抑制 HNRNPE2 活性。成熟 MIR328 序列的富含 C 的区域与聚（rC）结合区域 HNRNPE2 相互作用。这种相互作用阻止了 HNRNPE2 与 CEBPA 富含 C 的 5 引物上游区域之间的结合，从而使 CEBPA 免受 HNRNPE2 的翻译抑制。具有突变种子序列的 Mir328 与 Hnrnpe2 结合并恢复小鼠骨髓前体中的 Cebpa 表达，表明 MIR328 对 HNRNPE2 和 CEBPA 的影响与其种子序列无关。

▼ 进化

哺乳动物基因组中进化最受限制的区域之一是超保守元件uc.338，这是哺乳动物特有的223个碱基对区域，在人类、小鼠和大鼠之间完全保守，与PCBP2的短蛋白质编码外显子重叠。贝杰拉诺等人（2006）表明，四足动物中一类保守的主要非编码区起源于以前未知的短散布重复元件（SINE）反座子家族，该家族在志留纪时期活跃于肉翅目（叶鳍鱼类和陆生脊椎动物）中，至少 410万年前，似乎最近在“活化石”中活跃起来。印度尼西亚腔棘鱼，Latimeria menadoensis。 Bejerano 等人使用小鼠增强子测定（2006）表明，神经发育基因 ISL1（600366）的一个拷贝（50 万个碱基）是一种增强子，它概括了 Isl1 表达模式的多个方面。其他几个拷贝代表了先前存在的肉翅目基因中间的新的、可能是调节性的、选择性剪接的外显子。其中一个超过 200 个碱基对的超保守区域，在哺乳动物中 100% 相同，与腔棘鱼 SINE 80% 相同，包含 mRNA 加工基因 PCBP2 的 31 个氨基酸残基的选择性剪接外显子。贝杰拉诺等人（2006）得出的结论是，这个 SINE 元件增加了越来越多的例子，在这些例子中，转座元件的遗迹已经获得了服务于宿主的功能，这个过程被称为“外适应”，并为至少一些转座元件提供了起源。许多高度保守的脊椎动物特异性基因组序列。

▼ 测绘

Tommerup 和 Leffers（1996）通过荧光原位杂交将 PCBP2 定位到 FRA12A（136630）的 12q13.12-q13.13 远端。

Makeyev 和 Liebhaber（2000）鉴定了 2 个经过加工的 PCBP2 假基因，对应到染色体 21q22.3 和染色体 8q21-q22。

▼ 基因结构

Makeyev 和 Liebhaber（2000）确定人和小鼠 PCBP2 基因包含 15 个外显子，跨度超过 19 kb。