AFG2 AAA ATP酶同源物A； AFG2A

精子发生相关蛋白 5； SPATA5
精子发生相关因子； SPAF

HGNC 批准的基因符号：AFG2A

细胞遗传学位置：4q28.1 基因组坐标（GRCh38）：4:122,923,078-123,319,433（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

刘等人（2000）克隆了小鼠 Spata5，他们将其称为 Spaf。推导的 892 个氨基酸蛋白包含假定的线粒体定位信号和 AAA 家族蛋白典型的 2 个 ATP 酶模块（参见 601681）。对小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到 3-kb Spaf 转录物在睾丸中高表达，在脾脏中表达较弱，在其他检查组织中几乎没有表达。 Spaf 在小鼠 03RAT 细胞中也以 3kb 和 1.7kb 转录本高度表达，这些细胞源自低分化鳞状细胞癌。免疫组织化学分析在青春期前和成年小鼠睾丸中检测到 Spaf，它在精原细胞和早期精母细胞中表达，直至合子期。睾丸体细胞中未检测到 Spaf。 Spaf 广泛分布于生殖细胞的细胞质中，也定位于线粒体。蛋白质印迹分析检测到内源性和体外翻译的 Spaf，表观分子质量为 97 kD。

▼ 测绘

Hartz（2011）根据 SPATA5 序列（GenBank AF361489）与基因组序列（GRCh37）的比对，将 SPATA5 基因定位到染色体 4q28.1。

▼ 分子遗传学

Tanaka 等人对来自 10 个患有神经发育障碍（伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常）的家庭的 14 名儿童进行了研究（NEDHSB; 616577）（2015）鉴定了 SPATA5 基因中的纯合或复合杂合突变（参见例如 613940.0001-613940.0005）。这些突变是通过全外显子组测序发现的，并与家族中的疾病分开。没有进行变体的功能研究。

Kurata 等人在来自 2 个日本家庭的 3 名患有 NEDHSB 的儿童中（2016）鉴定了 SPATA5 基因中的复合杂合突变（参见例如 613940.0006-613940.0007）。这些突变是通过全外显子组发现的，并通过桑格测序证实。没有进行功能研究。

▼ 等位基因变异体（7 个精选示例）：

.0001 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、ALA844VAL

Tanaka 等人在 2 名姐妹（个体 1 和 2）中患有神经发育障碍，伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常（NEDHSB; 616577）（2015）鉴定了 SPATA5 基因中的复合杂合突变：c.2531C-T 转换（c.2531C-T，NM_145207.2），导致高度保守残基处的 ala844 到 val（A844V）取代，以及5 bp 缺失（c.1574_1578delATGCT; 613940.0002），导致移码和提前终止（Asn525ThrfsTer20）。这些突变是通过全外显子组测序发现并通过桑格测序证实的，与家族中的疾病分离，并且在 dbSNP、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库中未发现。没有进行变体的功能研究。

.0002 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、5-BP DEL、1574ATGCT

讨论 SPATA5 基因中的 5 bp 缺失（c.1574_1578delATGCT、NM_145207.2），导致移码和提前终止（Asn525ThrfsTer20），该现象在 2 名患有神经发育障碍（伴有听力损失、癫痫发作和大脑损伤）的姐妹中被发现Tanaka 等人的异常（NEDHSB；616577）（2015），参见 613940.0001。

.0003 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、SER448LEU

在一名 4 岁女孩（个体 4）中，她患有神经发育障碍，伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常（NEDHSB; 616577），Tanaka 等人（2015）鉴定了 SPATA5 基因中的复合杂合突变：c.1343C-T 转换（c.1343C-T，NM_145207.2），导致在高度保守的残基处发生 ser448 到 leu（S448L）的取代。第一个 AAA 结构域和 c.556C-T 转换，导致 arg186 到 ter（R186X；613940.0004）的替换。这些突变是通过全外显子组测序发现的，并通过桑格测序证实，与家族中的疾病分开。 c.1343C-T 突变在 ExAC 数据库中发现的频率非常低（低于万分之一），但在 dbSNP、1000 Genomes Project 或 Exome Variant Server 数据库中没有发现；在任何控制数据库中均未找到 c.556C-T。没有进行变体的功能研究。

.0004 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、ARG186TER

讨论 SPATA5 基因中的 c.556C-T 转换（c.556C-T，NM_145207.2），导致 arg186 到 ter（R186X）取代，在 2 名不相关患者的复合杂合状态中发现Tanaka 等人患有神经发育障碍，伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常（NEDHSB; 616577）（2015），参见 613940.0003 和 613940.0005。该突变是这两名欧洲血统患者的共同单倍型的一部分。

.0005 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、ALA100THR

在一名 2 岁女孩（个体 5）中，她患有神经发育障碍，伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常（NEDHSB; 616577），Tanaka 等人（2015）鉴定了 SPATA5 基因中的复合杂合突变：c.298G-A 转换（c.298G-A, NM_145207.2），导致在高度保守的残基处发生 ala100 到 thr（A100T）取代。 CDC48 N 端结构域和 R186X（613940.0004）。这些突变是通过全外显子组测序发现并通过桑格测序证实的，与家族中的疾病分离，并且在 dbSNP、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库中未发现。没有进行变体的功能研究。

.0006 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、3-BP DEL、NT989

Kurata 等人在 2 名患有神经发育障碍、听力损失、癫痫发作和大脑异常的同胞中（NEDHSB; 616577）（2016）鉴定了 SPATA5 基因中的复合杂合突变：3-bp 缺失（c.989_991del, NM_145207.2），导致从母亲遗传的 thr330（Thr330del）框内缺失，以及 4-bp 缺失删除（c.2130_2133del；613940.0007），导致移码和提前终止（Glu711ProfsTer21），遗传自父亲。这些突变通过全外显子组测序进行鉴定，并通过桑格测序进行确认。没有进行功能研究。

.0007 伴有听力损失、癫痫发作和大脑异常的神经发育障碍
AFG2A、4-BP DEL、NT2130

为了讨论 SPATA5 基因中的 4 bp 缺失（c.2130_2133del、NM_145207.2），导致移码和提前终止（Glu711ProfsTer21），该现象在 2 名患有神经发育障碍并伴有听力损失的同胞中以复合杂合状态被发现， Kurata 等人的癫痫发作和大脑异常（NEDHSB；616577）（2016），参见 613940.0006。