丝氨酸棕榈酰转移酶,长链碱基亚基 3; SPTLC3
SPTLC2L
LCB2B
HGNC 批准的基因符号:SPTLC3
细胞遗传学位置:20p12.1 基因组坐标(GRCh38):20:13,008,972-13,169,103(来自 NCBI)
▼ 说明
SPTLC3 基因编码丝氨酸棕榈酰转移酶第三亚基的同种型(SPT;EC 2.3.1.50),其催化鞘脂从头合成的限速步骤(Hornemann 等,2006)。
SPT 包含 2 个主要亚基:常见的 SPTLC1 亚基(605712) 和 SPTLC2(605713) 或其亚型 SPTLC2L(SPTLC3),具体取决于发生生物合成的组织(Hornemann 等,2006)。第三个亚基还有 2 个高度相关的亚型,SSSPTA(613540) 和 SSSPTB(610412),它们赋予 SPT 酶对酰基辅酶A 的偏好,并且对于最大酶活性至关重要(Han 等,2009)。
▼ 克隆与表达
Hornemann等人通过数据库分析寻找与SPTLC1(605712)和SPTLC2(605713)同源的序列(2006) 鉴定出 SPTLC3。推导的 552 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 63 kD,与 SPTLC2 具有 68% 的序列同一性。在大鼠、小鼠和狗中发现了 SPTLC3 直向同源物。人体组织实时定量PCR显示胎盘中表达量最高,其次是皮肤、肾上腺、睾丸、子宫、唾液腺、前列腺和肾脏,其他组织中表达量较低,外周血细胞和骨髓中无表达。 SPTLC3 和 SPTLC2 显示出不同的表达模式,可能反映了鞘脂合成的组织特异性要求。蛋白质印迹分析显示 SPTLC3 在人滋养层细胞系中表达。
▼ 基因功能
霍内曼等人(2006)发现HEK293细胞中SPTLC3的过度表达(其内源性SPTLC3很少)导致SPT活性增加2至3倍。 SPTLC3特异性siRNA在HepG2细胞和人滋养层细胞中的表达显着降低了SPT活性,表明SPTLC3在SPT活性中发挥作用。 Triton X-100 特异性抑制 SPTLC3 活性,但对 SPTLC2 活性没有影响。 SPTLC3 与 SPTLC2 一样,可以与 SPTLC1 形成二聚体,并且 SPTLC1 可以将 SPTLC2 和 SPTLC3 锚定在内质网膜上。
▼ 基因结构
霍内曼等人(2006)确定SPTLC3基因含有12个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Hornemann 等人(2006) 将 SPTLC3 基因定位到染色体 20p12.3-p12.1。