RNA 结合基序蛋白 19; RBM19
KIAA0682
HGNC 批准的基因符号:RBM19
细胞遗传学位置:12q24.13-q24.21 基因组坐标(GRCh38):12:113,816,740-113,966,325(来自 NCBI)
▼ 说明
RBM19 预计在核糖体生物发生过程中充当 RNA 结合蛋白(Lorenzen et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
Ishikawa 等人通过对从大小分级的成人大脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1998) 克隆了 RBM19,他们将其称为 KIAA0682。转录本的 3 引物末端含有重复元件,推导的蛋白质含有 960 个氨基酸。 RT-PCR 分析检测到所有 10 个人体组织中都有 KIAA0682 表达。数据库分析揭示了酵母中可能的直系同源物。
通过数据库分析,Mayer 和 Fishman(2003) 在包括人类在内的多种动物物种中鉴定出了斑马鱼 rbm19(他们称之为 npo)的密切直系同源物,以及在酵母和植物中更远的直系同源物。推导的后生动物蛋白含有6个高度保守的RNA识别基序。原位杂交检测到早期斑马鱼胚胎中普遍存在的 npo 表达。后来,表达仅限于大脑和前消化道。在消化道中,npo 表达从前到后呈波状增加然后减少,在肠道中留下残留的点状表达模式。在内胚层来源的肠上皮细胞的子集中,npo 染色表现为细胞质斑点。
洛伦岑等人(2005) 观察了发育中的小鼠和鸡肠道中 Rbm19 mRNA 表达的动态模式。染色最初是弥漫性的,然后局限于十二指肠,最终仅限于利伯库恩隐窝中未分化的上皮祖细胞。成年小鼠十二指肠的免疫荧光染色将 Rbm19 定位于核仁。在人类肠道肿瘤中,RBM19 表达随着极性的丧失和细胞运动的增加而增加。在有丝分裂的 Caco-2 人结直肠癌细胞中,RBP19 定位在细胞周期中以核仁蛋白特征的方式变得弥散并重新浓缩。在分化的 Caco-2 细胞中,RBP19 定位于核仁的致密纤维成分。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Ishikawa 等人(1998) 将 KIAA0682 基因定位到 12 号染色体。
Hartz(2015) 根据 RBM19 序列(GenBank AB014582) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RBM19 基因对应到染色体 12q24.13-q24.21。
▼ 动物模型
Mayer 和 Fishman(2003) 使用 N-乙基-N-亚硝基脲筛选,培育出带有隐性致死突变的斑马鱼,该突变导致受精后 4.5 天缺乏肠道、肝脏和外分泌胰腺。其他器官系统未受影响,胰岛和胰岛素表达正常。 Mayer 和 Fishman(2003) 将这种突变命名为“nil per os”(npo),拉丁语,意思是“除了嘴巴什么都没有”。对早期阶段 npo 胚胎的检查揭示了原始消化器官的存在,这表明 npo 控制着肠道和胰腺发育的原始阶段和成熟阶段之间的进展。定位克隆鉴定了 RBM19 斑马鱼直系同源物中的 npo 突变。吗啡啉介导的 npo 敲除消除了消化器官的分化,类似于 npo 突变体中发现的情况。