锌指蛋白 148; ZNF148
锌结合蛋白 89; ZBP89
HT-β
ZFP148
HGNC 批准的基因符号:ZNF148
细胞遗传学位置:3q21.2 基因组坐标(GRCh38):3:125,225,669-125,375,354(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
王等人(1993)报道了编码人锌指蛋白的基因的分离,该蛋白能够结合人T细胞受体的CACCC框(TCR;参见186880)。他们从人类植物血凝素刺激的外周血 T 细胞文库中克隆了 cDNA。王等人(1993) 表明编码的 454 个氨基酸蛋白 ZNF148,被 Merchant 等人称为 ht-β(1996),预测质量为 49 kD,包含 4 个串联锌结合结构域。通过Northern印迹分析,他们表明该基因转录为4.2、7.6和8.6 kb的3个mRNA,并在几种T细胞系中表达。
Tommerup 等人通过使用与锌指蛋白 H/C 连接序列相对应的简并寡核苷酸筛选人胰岛素瘤 cDNA 文库(1993) 分离了几种编码锌指蛋白的 cDNA,包括 ZNF148。 ZNF148 cDNA 预测属于锌指蛋白 Kruppel 家族的蛋白。
商人等人(1996) 分离出一种大鼠基因,其产物(他们称之为 ZBP89)与人类 ZNF148(他们称之为 ht-β)有 89% 的相似度。然而,ZBP89 是根据其与人胃泌素(137250) 基因启动子的结合而分离出来的。 ZBP89的尺寸几乎是ht-β的两倍,可能是替代的拼接产品。商人等人(1996) 推测多种形式的 ht-β 也可能出现。功能性 C 末端结构域的选择性剪接见于其他不可分割的转录因子,例如 NF-kappa-B(164011)。 ZBP89 是锌指蛋白 Kruppel 家族的成员。
通过 Jurkat 人类 T 细胞 RNA 的 5-prime RACE,Law 等人(2006)克隆了 ZBP89 的剪接变体,它编码 N 端截短的蛋白质,称为 ZBP89-δ-N,它缺乏全长 ZBP89 的酸性结构域和 p300 相互作用区域。 RT-PCR 在 Jurkat 细胞、正常结肠和结肠腺癌以及所有检查的结肠癌细胞系中检测到 ZBP89 和 ZBP89-δ-N。从 Jurkat 细胞中分离出来的两种同工型均以 100 kD 的表观分子质量迁移,但由于其等电点之间存在较大差异,因此可以在二维凝胶上进行解析。
▼ 基因功能
王等人(1993) 表明人类 ZNF148 蛋白可以结合人类和小鼠 TCR 基因的 CACCC 框启动子并激活转录。
商人等人(1996) 报道大鼠 Zbp89 抑制表皮生长因子(EGF; 131530) 胃泌素启动子的诱导。法律等人(1998) 发现人类 ZNF148 与其大鼠同源物一样,抑制胃泌素基因表达。
法律等人(1998) 确定 ZNF148 抑制鸟氨酸脱羧酶(ODC; 165640) 基因的 SP1(189906) 激活。 ZNF148 和 SP1 以相互排斥的方式与 ODC 基因近端启动子中的 GC 框结合。张等人(2003) 证明 ZNF148 还抑制 SP1 介导的波形蛋白(193060) 启动子的激活。 ZNF148 的 N 端锌指与 SP1 相互作用并抑制基因表达,TAFII130(TAF4; 601796) 与 ZNF148 和 SP1 在昆虫细胞中共转染可挽救基因表达。由于 ZNF148 和 TAFII130 都与 SP1 富含谷氨酰胺的区域相互作用,Zhang 等人(2003) 假设这些蛋白质可能竞争 SP1 结合。
吴等人(2007) 表明 ZNF148 通过充当衔接蛋白并将 HDAC1(601241) 招募到波形蛋白启动子来抑制波形蛋白表达。
法律等人(2006) 生成了 ZBP89-δ-N 敲入小鼠。仅表达 ZBP89-δ N 的纯合小鼠表现出显着的生长延迟和活力降低,48 周时死亡率为 50%,104 周时死亡率为 60%。组织病理学器官和组织检查未发现明显异常,但结肠淋巴细胞浸润略有增加。转基因小鼠对右旋糖酐硫酸钠诱导的结肠炎的易感性增加,这与 ZBP89-δ-N 基因剂量相关。受影响更严重的纯合子小鼠表现出淋巴细胞浸润升高、正常隐窝结构移位和粘膜下水肿。
▼ 基因结构
费奥等人(2001) 确定 ZNF148 基因包含 9 个外显子,跨度约为 130 kb。外显子 4 包含翻译起始位点。小鼠Znf148表现出相同的基因组结构,具有相同的内含子-外显子组织,并且启动子区域显示看家基因的典型特征,具有高G/C含量并且不存在典型的TATA和CAAT框。小鼠启动子的功能分析揭示了一个假定的成肌细胞特异性调节元件。
法律等人(2006) 在 ZNF148 基因(4B) 中鉴定了一个替代外显子 4,其中包括一个替代启动子和翻译起始位点。外显子 4B 在黑猩猩 Znf148 中发现,但在小鼠 Znf148 中没有发现,表明替代启动子的利用仅限于原始人类。
▼ 测绘
Tommerup 和 Vissing(1995) 通过 FISH 将 ZNF148 基因定位到 3q21-q22。法律等人(1998) 通过与 YAC/BAC 重叠群的杂交和 FISH 表明,ZNF148 基因定位于 3q21。
Antona 等人通过 Southern blot 分析(1998)确定ZNF148是一个单拷贝基因。通过 FISH,他们将 ZNF148 基因定位到染色体 3q21,并通过种间回交分析,他们将小鼠 Znf148 基因定位到 16 号染色体的一个区域,该区域与人类染色体 3q21 显示同线性。
▼ 分子遗传学
Stevens 等人在 4 名患有整体发育迟缓、胼胝体发育不良和面容畸形(GDACCF; 617260) 的无关儿童中进行了研究(2016) 在 ZNF148 基因(601897.0001-601897.0004) 中鉴定出 4 个不同的从头杂合截短突变。所有突变都发生在最后一个外显子(外显子 9),预计会逃避无义介导的 mRNA 衰减并导致截短蛋白的表达。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但 Stevens 等人(2016) 假设截短的蛋白质可能具有显性失活或毒性功能获得效应。这些突变是通过对 2,172 名智力障碍或多种先天异常患者进行全外显子组测序发现的。在 3 名患者中检测到额外基因的变异,但这些变异与表型无关。
▼ 动物模型
竹内等人(2003) 在嵌合 Zfp148 +/- 小鼠中观察到突变没有种系遗传,并且其中一些小鼠完全缺乏精原细胞。该表型不能被野生型支持细胞或基质细胞拯救,因此是细胞自主表型。结果表明,Zfp148 的 2 个功能等位基因是胎儿生殖细胞正常发育所必需的。 Bai 和 Merchant(2001) 表明 Zfp148 激活 p53(191170),p53 在细胞周期调节中发挥重要作用。原始生殖细胞在大约胚胎第 13.5 天停止增殖,这与 p53 磷酸化的诱导及其向细胞核的易位相关。 p53 的磷酸化在 Zfp148 +/- 胚胎干细胞和来自嵌合 Zfp148 +/- 胚胎的胎儿生殖细胞中受损。因此,Zfp148可能是生殖细胞发育中调节p53所必需的。竹内等人(2003) 观察到不育嵌合 Zfp148 杂合子的睾丸表型与人类纯支持细胞综合征的表型相似(参见 400042)。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 整体发育迟缓、胼胝体发育不良和面容不均匀
ZNF148、LYS598TER
Stevens 等人在一名患有全身发育迟缓、胼胝体发育不良和面容畸形的 6.7 岁女孩中(GDACCF; 617260)(2016) 在 ZNF148 基因的外显子 9 中鉴定出从头杂合的 c.1792A-T 颠换(c.1792A-T, NM_021964.2),导致 lys598 至 ter(K598X) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,ExAC 数据库中不存在该突变(2016 年 5 月 19 日)。没有对变异体进行功能研究,也没有对患者细胞进行研究,但预计该突变会逃脱无义介导的 mRNA 衰减并被表达,可能导致功能获得效应。
.0002 整体发育迟缓、胼胝体缺失和面容不均匀
ZNF148、1-BP DUP、NT1583
Stevens 等人在一名患有全身发育迟缓、胼胝体缺失和面容畸形的男婴中(GDACCF; 617260)(2016) 在 ZNF148 基因的外显子 9 中发现了一个从头杂合的 1-bp 重复(c.1583dup, NM_021964.2),导致移码和提前终止(Ser529GlufsTer2)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,ExAC 数据库中不存在该突变(2016 年 5 月 19 日)。没有对变异体进行功能研究,也没有对患者细胞进行研究,但预计该突变会逃脱无义介导的 mRNA 衰减并被表达,可能导致功能获得效应。
.0003 整体发育迟缓、胼胝体缺失或胼胝体缺失以及面容不均匀
ZNF148、1-BP DUP、NT970
Stevens 等人在一名 11.7 岁女孩中进行了研究,该女孩患有全身发育迟缓、胼胝体缺失和面容畸形(GDACCF; 617260)(2016) 在 ZNF148 基因的外显子 9 中发现了一个从头杂合的 1-bp 重复(c.970dup, NM_021964.2),导致移码和提前终止(Ser324PhefsTer14)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,ExAC 数据库中不存在该突变(2016 年 5 月 19 日)。没有对变异体进行功能研究,也没有对患者细胞进行研究,但预计该突变会逃脱无义介导的 mRNA 衰减并被表达,可能导致功能获得效应。
.0004 整体发育迟缓、胼胝体发育不良和面容不均匀
ZNF148,1-BP INS,1581C
Stevens 等人在一名患有整体发育迟缓、胼胝体发育不良和面容畸形的 7 岁女孩中(GDACCF; 617260)(2016) 在 ZNF148 基因的外显子 9 中发现了一个从头杂合的 1-bp 插入(c.1581_1582insC, NM_021964.2),导致移码和提前终止(Lys528GlnfsTer3)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,ExAC 数据库中不存在该突变(2016 年 5 月 19 日)。没有对变异体进行功能研究,也没有对患者细胞进行研究,但预计该突变会逃脱无义介导的 mRNA 衰减并被表达,可能导致功能获得效应。