肿瘤抑制剂候选物5; TUSC5
LOST1
HGNC 批准的基因符号:TRARG1
细胞遗传学位置:17p13.3 基因组坐标(GRCh38):17:1,279,662-1,300,978(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Konishi 等人利用数据库分析来识别肺癌中经常缺失的 17 号染色体区域中的基因,然后进行 PCR 和 5-prime 和 3-prime RACE(2003) 克隆了 TUSC5,他们将其称为 LOST1。转录物包含 2 个聚腺苷酸化信号,推导的 177 个氨基酸蛋白包含 2 个跨膜结构域。人体组织RT-PCR检测发现,TUSC5在心脏、平滑肌和骨骼肌中表达相对较高,在成人脑、支气管、心脏、乳腺、胃、肾上腺和胎儿脑中表达较低。
▼ 基因功能
小西等人(2003) 发现 LOST1 基因在小细胞肺癌细胞系中受到约 170 kb 纯合缺失的影响。他们使用实时 RT-PCR 表明,16 个肺癌样本中的 11 个(69%) 中 LOST1 的表达降低,并且在 6 个肺癌样本中的 4 个中,在 LOST1 基因的 5 引物末端观察到显着的 DNA 高甲基化。 LOST1 表达可忽略不计的癌细胞系。
小出等人(2007)发现Tusc5 mRNA和蛋白在大鼠棕色脂肪组织中大量表达,并且在Zucker瘦大鼠中冷暴露显着抑制其表达。在原代培养的大鼠棕色前脂肪细胞中,Tusc5 mRNA在分化过程中增加,并且地塞米松以剂量依赖性方式抑制Tusc5表达。
▼ 基因结构
小西等人(2003)确定TUSC5基因包含3个外显子。
▼ 测绘
通过构建 BAC 重叠群、限制性图谱和基因组序列分析,Konishi 等人(2003) 将 TUSC5 基因定位到染色体 17p13.3。