DIX 域包含蛋白 1; DIXDC1

COILED-COIL DIX1; CCD1
KIAA1735

HGNC 批准的基因符号:DIXDC1

细胞遗传学位置:11q23.1 基因组坐标(GRCh38):11:111,927,315-112,022,653(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从大小分级的海马 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000)克隆了 DIXDC1,他们将其命名为 KIAA1735。 cDNA的3-prime UTR含有一个Alu元件,推导的蛋白质含有493个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到成人全脑和几个特定脑区域中高表达。在检查的所有其他组织和大脑区域中均检测到中间表达。

通过使用 DVL1(601365) 的 DIX 结构域作为查询搜索数据库,Katoh 和 Katoh(2003) 鉴定出了人类 DIXDC1。推导的 472 个氨基酸 DIXDC1 蛋白具有与 MYH1(160730) 和 MYH2(160740) 中发现的类似的中央肌球蛋白尾同源(MTH) 区域,以及 C 端 DIX 结构域。在 MTH 区域内,DIXDC1 包含 2 个酪氨酸磷酸化位点和一个亮氨酸拉链基序。 DIXDC1 被预测为细胞质蛋白。 Katoh 和 Katoh(2003) 还鉴定了小鼠 Dixdc1,它编码推导的 474 个氨基酸的蛋白质,与人类 DIXDC1 具有 90.9% 的氨基酸同一性。与人类 DIXDC1 相比,小鼠 Dixdc1 的 MTH 区域只有 1 个酪氨酸磷酸化位点,并且没有亮氨酸拉链基序。

Wang 等人通过使用 AXIN2(604025) C 端一半作为诱饵进行酵母 2-杂交分析,然后使用来自各种组织和细胞系的 RNA 进行 RACE 和 RT-PCR(2006)克隆了具有不同转录起始位点的DIXDC1的2个变体。缩写形式 s-DIXDC1 与 Katoh 和 Katoh(2003) 报道的序列相同,是斑马鱼 Ccd1 的同源物。长形式 l-DIXDC1 编码推导的 683 个氨基酸的蛋白质,其 N 末端延伸包含钙调蛋白(参见 600806)同源(CH) 结构域。 Northern 印迹分析检测到 5.1、5.8、6.3 和 6.8 kb DIXDC1 转录物的组织特异性表达。表达在心肌和骨骼肌中最为丰富。内源性和表位标记的 DIXDC1 亚型的免疫定位将 s-DIXDC1 定位于细胞质,将 l-DIXDC1 定位于肌节蛋白应力纤维细丝末端的粘附斑块,并与纽蛋白共定位(VCL; 193065)。

▼ 基因功能

黄等人(2004) 发现 CCD1 阻断轴蛋白(AXN1;603816) 和 DVL 激活 JNK(参见 601158)。 CCD1、DVL 和 RAC(参见 RAC1;602048)共表达时形成三元复合物。黄等人(2004) 证明 CCD1 通过同时竞争 MEKK1(MAP3K1; 600982) 结合和隔离 MEKK4(MAP3K4; 602425) 来抑制轴蛋白介导的 JNK 激活。

王等人(2006) 发现 l-DIXDC1,而不是 s-DIXDC1,在体外和体内直接结合丝状肌节蛋白。肌节蛋白结合由 l-DIXDC1 的氨基酸 127 至 300 介导; CH、DIX 和 MTH 结构域不是肌节蛋白结合所必需的。动力学分析表明,每 200 个肌节蛋白单体分子结合 1 个 l-DIXDC1 分子。

▼ 基因结构

Katoh 和 Katoh(2003) 确定 DIXDC1 基因包含 16 个外显子,长度约为 45 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Katoh 和 Katoh(2003) 将 DIXDC1 基因定位到染色体 11q23.1。它位于 DLAT 基因(608770) 的 4.0 kb 范围内,与该基因呈尾对头方向。