病毒整合位点 1; VIS1

HIS1

HGNC 批准的基因符号:VIS1

细胞遗传学位置:2q14-q21 基因组坐标(GRCh38):2:112,200,001-136,100,000

▼ 克隆与表达

Askew 等人使用源自 2 个整合原病毒侧翼的细胞序列的基因组探针(1991)从鼠髓性白血病细胞系中克隆了病毒整合位点。来自 2 个整合位点 His1 和 His2 的探针均鉴定出许多白血病细胞系中的重排。

Askew 等人使用 Northern blot 分析(1994) 在 4 种转化的小鼠骨髓细胞系中鉴定出了 His1 转录本,但在所检查的任何正常细胞系中均未鉴定出 His1 转录本。其中两个细胞系源自逆转录病毒诱导的髓系白血病,其中含有整合的原病毒,通过启动子插入驱动 His1 表达。其他 2 个细胞系表达离散的 3 kb His1 RNA,Askew 等人(1994)克隆了相应的cDNA。 His1含有多个小ORF,但缺乏大ORF,并且在体外翻译过程中不产生蛋白质产物。然而,Askew 等人(1994) 表明 His1 RNA 被剪接和聚腺苷酸化。 His1 在包括人类在内的多种脊椎动物中保守。

李等人(1997) 从淋巴细胞基因组文库中分离出与小鼠 His1 基因同源的 8.5 kb 人类基因组克隆。小鼠和人类 HIS1 序列高度共线,多个序列高度保守的区域散布着差异区域。小鼠和人类 HIS1 基因在 6.6 kb 范围内具有 65% 的同一性,其中 3 素数末端的差异最大。小鼠 His1 转录起始位点侧翼的 5-prime 区域在人类基因中高度保守。序列分析揭示了外显子 3、内含子 1 和内含子 2 中其他推定功能域的保守性。使用来自这些区域的探针进行 Southern 印迹分析,检测到其他几种脊椎动物物种中的同源物。与小鼠基因一样,人类 HIS1 含有多个小 ORF,但小鼠 His1 中的 ORF 在人类 HIS1 中没有保守。李等人(1997) 得出结论,人类和小鼠 HIS1 不太可能编码蛋白质。

▼ 基因结构

阿斯科等人(1991) 确定小鼠 His1 基因包含 3 个外显子,跨度 6 kb。

李等人(1997) 报道人类 HIS1 基因具有与小鼠基因相似的基因组组织。人 HIS1(但小鼠 His1 除外)在内含子 2 和外显子 3 中含有 Alu 重复序列。这两个基因都富含 A/T,并且在外显子 3 中含有 mRNA 不稳定基序 ATTTA 的多个拷贝。TATA 框的变体 TTTAAA,位于小鼠 His1 转录起始位点的上游,相关序列在人 HIS1 中保守。

▼ 测绘

通过种间回交分析,Askew 等人(1991) 将 His1 基因座对应到小鼠 2 号染色体,将 His2 基因座对应到小鼠 19 号染色体。用来自人类同源区域的探针进行原位杂交,将 HIS1 基因座对应到人类染色体 2q14-q21。在小鼠中,His1 基因座定位到与任何已知癌基因或常见整合位点不同的区域,但接近在超过 90% 的辐射诱发白血病中观察到的缺失的近端断点。

▼ 命名法

HIS1 和 HIS2 分别是之前用于表示 histatin-1(142701) 和 histatin-2(142702) 的符号。因此,HGM 命名委员会使用 VIS1 表示“病毒整合位点 1”,即“病毒整合位点 1”。而不是 Askew 等人使用的 HIS1(1991)。