ATP 结合框,亚科 B,成员 9; ABCB9
Tap 样蛋白质; TAPL
HGNC 批准的基因符号:ABCB9
细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:122,918,610-122,975,114(来自 NCBI)
▼ 正文
有关转运蛋白 ATP 结合框(ABC) 家族的背景信息,请参阅 ABCA4(601691)。
▼ 说明
除了“完整”之外, ABC转运蛋白具有2个跨膜结构域和2个核苷酸结合结构域,有“半”和“半”结构域。蛋白质,例如 ABCB9,每个结构域仅包含 1 个。全转运蛋白通常存在于质膜中,而半转运蛋白则存在于亚细胞器中(Zhang 等人总结,2000)。
▼ 克隆与表达
通过搜索 EST 数据库并筛选 T 淋巴细胞 cDNA 文库,Zhang 等人(2000)获得了编码ABCB9的cDNA。序列分析预测,766 个氨基酸的 ABCB9 蛋白具有 10 个潜在的 N 端跨膜片段。 ABCB9 与啮齿动物序列具有 94% 的同一性,并且与 2 个人内质网半转运蛋白 TAP1(ABCB2; 170260) 和 TAP2(ABCB3; 170261) 具有约 39% 的同一性。 RT-PCR 和基因组序列分析证实睾丸和大脑中存在表达的 129 bp 剪接变异体。 Northern 印迹分析在大多数测试组织中检测到 3.7-kb 转录物的低表达,并在表达相对较高的组织(例如睾丸)中检测到额外的 2.2-kb 转录物。蛋白质印迹分析显示 72 kD 非糖基化蛋白的表达,明显小于预测质量 84.5 kD,并且在溶酶体中富集。免疫荧光显微镜证明 ABCB9 与溶酶体蛋白 LAMP1(153330) 和 LAMP2(309060) 共定位。免疫组织化学分析检测啮齿动物生精小管支持细胞中 ABCB9 的表达。
▼ 测绘
阿利克梅茨等人(1996) 将 ABCB9 基因对应的 EST 对应到 12q24。
▼ 基因功能
格拉布等人(2019) 指出,人类 ABCB9(他们称之为 TAPL)将 6 至 59 个氨基酸的多肽从胞质溶胶转运到溶酶体中。
▼ 生化特征
格拉布等人(2019) 指出人类 TAPL 有 2 个功能部分。 6 个 C 端跨膜螺旋(TMH) 和胞质核苷酸结合域(NBD) 统称为 CoreTAPL,形成在 ATP 依赖性肽转运中完全活跃的同二聚体。 4 个额外的 N 端 TMH,统称为 TMD0,对于肽转运可以忽略不计,但对于溶酶体定位至关重要,即使它们缺乏常规靶向序列。格拉布等人(2019) 确定 TAPL 采取从内质网(ER) 经高尔基体和早期内体到达溶酶体的直接路线,并且 TMD0 跨膜螺旋内的保守带电残基对于溶酶体靶向的各个步骤至关重要。特别是,TMH1 中的 asp17 及其与 arg57 的盐桥对于从 ER 释放 TAPL 至关重要,而 asp45 和 asp49 对于从高尔基体到内体和溶酶体区室的第二个转移步骤很重要。 YIF1B(619109)的跨膜结构域与TAPL的TMD0直接或间接相互作用,YIF1B参与TAPL溶酶体靶向,但不是必要因素。