低密度脂蛋白胆固醇水平定量性状基因座 6; LDLCQ6

染色体 1p13 上 SORT1（SORT1-TBS1; 602458） 的转录因子结合位点负责该位点与低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C） 变异性的关联。

▼ 测绘

特斯洛维奇等人（2010） 对超过 100,000 名欧洲血统个体进行了一项针对血浆脂质的全基因组关联研究，并报告了 95 个显着相关的位点（P = 小于 5 x 10（-8）），其中 59 个显示出与血统的脂质性状在全基因组范围内显着关联。第一次。在他们的研究中，与 LDL-C 最强的关联是由 SORT1 基因附近的 rs629301 代表的 1p13 上的一个位点获得的（效应大小为 -5.65，p = 1 x 10（170））。

穆苏努鲁等人（2010） 指出，在 GWAS 中，与 LDL-C 相关的相同 1p13 SNP 也与冠状动脉疾病和心肌梗死（MI） 孤立相关（Teslovich 等，2010；Samani 等，2007；心肌梗死遗传学联盟，2009）。这些 SNP 主要等位基因纯合的欧洲血统个体的 LDL-C 升高高达 16 mg dl（-1），并且 MI 风险增加约 40%（Samani 等，2007；Myocardial Infarction Genetics） Consortium，2009）与次要等位基因纯合子相比。因此，相同的基因位点与公认的中间表型和硬临床疾病终点相关。

▼ 分子遗传学

Musunuru 等人在一项识别和表征染色体 1p13 上因果 DNA 变异的研究中（2010） 通过对人类队列和人源性肝细胞的一系列研究证明，1p13 位点 rs1274374（SORT1-TBS1; 602458.0001） 上常见的非编码多态性会创建 CEBP（116897） 转录因子结合位点并改变肝脏表达SORT1 基因的。 Musunuru 等人通过小鼠肝脏中的小干扰 RNA 敲除和病毒过度表达（2010） 证明 Sort1 通过调节肝脏 VLDL 分泌来改变血浆 LDL 胆固醇和极低密度脂蛋白（VLDL） 颗粒水平。因此，Musunuru 等人（2010） 得出的结论是，他们为脂蛋白代谢的新调节途径提供了功能证据，并表明调节该途径可能会改变人类患心肌梗死的风险。作者还证明，GWAS 识别的常见非编码 DNA 变异可以直接影响临床表型。穆苏努鲁等人（2010） 认为，他们新描述的途径的临床重要性是由替代 1p13 纯合子之间大约 40% 的 MI 风险差异来定义的，这一效应与 LDLR（606945） 和 PCSK9（607786） 的常见变体相当，并且大于HMGCR（142910） 中常见变异的影响。 SNP rs1274374 位于 2 个基因 CELSR2（604265） 和 PSRC1（604265） 之间的非编码 DNA 区域。