PHD 手指蛋白 5A; PHF5A

剪接因子 3B,子单元 7; SF3B7
SF3B,14-KD 亚基,B; SF3B14B

HGNC 批准的基因符号:PHF5A

细胞遗传学位置:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:41,459,717-41,468,692(来自 NCBI)

▼ 说明

PHF5A 是催化前体 mRNA 剪接的多组分剪接体复合物的亚基(Will 等,2002)。

▼ 克隆与表达

通过对与 U2 小核 RNA(RNU2-1 180690) 相关的 HeLa 细胞 SF3B 复合物进行免疫纯化的蛋白质进行质谱分析,Will 等人(2002) 鉴定出 PHF5A,他们将其称为 SF3B14B。推导的 110 个氨基酸蛋白质富含半胱氨酸,计算分子量为 12.4 kD。 SDS-PAGE 检测到 SF3B14B 的表观分子质量为 14 kD。数据库分析揭示了 SF3B14B 在果蝇、拟南芥和酿酒酵母中的密切直系同源物。

特拉普等人(2002) 克隆小鼠 Phf5a。推导的 110 个氨基酸蛋白与人类 PHF5A 具有 100% 的同一性。两种蛋白均含有预测的核定位信号和富含半胱氨酸的中央 PHD 指结构域。 Northern印迹分析检测到1.2-kb Phf5a转录本在小鼠精原细胞系中强烈表达,而在精母细胞系和睾丸中表达较弱。 RNase 保护和 EST 数据库分析揭示了小鼠胚胎和出生后小鼠组织中普遍存在的 Phf5a 表达。荧光标记的 Phf5a 在转染的 NIH3T3 细胞的细胞核中表达,但排除在核仁之外。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Trappe 等人(2002) 将 PHF5A 基因定位到染色体 22q13.2。他们将小鼠 Phf5a 基因定位到与人类染色体 22q13 具有同线性同源性的 15E 号染色体区域。特拉普等人(2002) 还鉴定了可能的小鼠和人类 PHF5A 假基因。