肌节蛋白相关蛋白 2/3 复合抑制剂; ARPIN
15 号染色体开放解读码组 38; C15ORF38
HGNC 批准的基因符号: ARPIN
细胞遗传学位置:15q26.1 基因组坐标(GRCh38):15:89,895,006-89,912,952(来自 NCBI)
▼ 说明
C15ORF38 编码 arpin,一种细胞迁移的负调节因子,可抑制片状伪足尖端的肌节蛋白聚合(Dang et al., 2013)。
▼ 克隆与表达
Dang 等人使用生物信息学分析来鉴定含有在人类因子中发现的酸性基序的蛋白质,该酸性基序使细胞骨架 ARP2/3 复合物成核(参见 604221)(2013) 鉴定了 C15ORF38,他们将其称为 arpin,这是其活性的助记符(ARP2/3 抑制;参见基因功能)。推导的 226 个氨基酸的蛋白质是结构化的,但它具有高度移动的 C 末端,其中含有结合 ARP2/3 的酸性基序。免疫荧光分析将 arpin 定位于扩散的小鼠胚胎成纤维细胞的板状伪足的尖端。
▼ 基因功能
具有 C 端 VCA 结构域的因子,例如 WAVE1(WASF1;605035),可激活 ARP2/3 复合体,促进肌节蛋白分支和聚合以及细胞运动。党等人(2013) 发现人 arpin 与 WAVE1 的 VCA 竞争与 ARP2/3 的结合。在体外,arpin 通过 VCA 激活的 ARP2/3 以剂量依赖性方式抑制肌节蛋白分支和聚合。缺失分析表明,arpin C 末端酸性区域是与 ARP2/3 相互作用并抑制 ARP2/3 所必需的。 RAC1(602048) 是片状足形成的主要调节因子,通过 WAVE 复合物激活 ARP2/3,也通过诱导 arpin 和 ARP2/3 之间的复合物形成来抑制 ARP2/3。人 RPE1 细胞中 arpin 的敲低增加了板状伪足的突出速度和细胞扩散。在人类和鱼类细胞以及鱼类和阿米巴原虫模型中敲低 arpin 产生了类似的效果,细胞速度增加,方向持久性增加。党等人(2013) 得出结论,arpin 是细胞运动的负调节剂。他们假设,arpin 通过减慢细胞速度来使细胞转动。
▼ 测绘
Hartz(2013) 根据 C15ORF38 序列(GenBank AK093274) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 C15ORF38 基因对应到染色体 15q26.1。