含硫氧还蛋白结构域的蛋白质 15; TXNDC15

5 号染色体开放解读码组 14; C5ORF14
Bunker Gear,果蝇,同源物;BUG

HGNC 批准的基因符号:TXNDC15

细胞遗传学位置:5q31.1 基因组坐标(GRCh38):5:134,873,770-134,901,635(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过数据库分析,Honjo 等人(2016) 鉴定 TXNDC15 是果蝇“掩体齿轮”的人类直系同源物;(错误)基因。

▼ 测绘

Hartz(2017) 根据 TXNDC15 序列(GenBank AK026278) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TXNDC15 基因对应到染色体 5q31.1。

▼ 基因功能

Shaheen 等人通过对 TXNDC15 进行 siRNA 敲低的人 TERT-RPE1 细胞进行免疫荧光分析(2016)观察到纤毛发生的明显缺陷,与对照细胞相比,纤毛突变细胞显着减少。此外,对纤毛受体 TMEM67(609884) 染色的敲低细胞进行免疫荧光显微镜检查显示,与对照细胞相比,TMEM67 定位到过渡区的位置不正确。

▼ 分子遗传学

Shaheen 等人在来自 2 个沙特家庭和 1 个巴基斯坦 Meckel 综合征家庭(MKS14;619879)的先证者中(2016) 鉴定了 TXNDC15 基因(617778.0001-617778.0003) 突变的纯合性。据报道,其中 1 个家庭因疾病而被隔离。功能分析显示突变成纤维细胞中纤毛发生异常,以及 TXNDC15 敲低细胞中 TMEM67(609884) 纤毛受体错误定位至过渡区。

Ridnoi 等人在患有梅克尔综合征的爱沙尼亚胎儿中(2019) 鉴定了 TXNDC15 基因突变的复合杂合性:1 bp 重复(617778.0004) 和错义突变(L212P; 617778.0005),该突变与家族中的疾病分离,并且在 gnomAD 中以非常低的次要等位基因频率存在数据库。

Radhakrishnan 等人在患有梅克尔综合征的印度胎儿中(2019) 鉴定了 TXNDC15 基因(R282X; 617778.0006) 中无义突变的纯合性,该突变与家族中的疾病分离,并且在 gnomAD 数据库中以非常低的次要等位基因频率存在。

▼ 动物模型

本庄等人(2016) 发现 bug 基因的敲低导致果蝇幼虫对热不敏感。

▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):

.0001 梅克尔综合症 14
TXNDC15、15-BP DEL、NT672

Shaheen 等人在患有梅克尔综合征(MKS14; 619879) 的沙特近亲家庭(F-89) 的死产男婴(10DG2025) 中进行了研究(2016) 鉴定了 TXNDC15 基因外显子 3 中 15 bp 缺失(c.672_686del, NM_024715.3) 的纯合性,预计会导致硫氧还蛋白折叠域内 5 个高度保守的氨基酸残基(Ser225_His229del) 缺失。先证者有 2 个类似患病的表兄弟姐妹;据说这种突变与家族中的疾病有关,但没有提供细节。

.0002 梅克尔综合症 14
TXNDC15、IVS1、G-A、+1

Shaheen 等人在来自沙特近亲家庭(F-125) 的患有梅克尔综合征(MKS14; 619879) 的女性先证者(14DG0937) 中(2016) 鉴定了 TXNDC15 基因内含子 1 中剪接位点突变(c.103+1G-A, NM_024715.3) 的纯合性。先证者有 2 个类似患病的兄弟姐妹;没有关于家庭隔离的报道。

.0003 梅克尔综合症 14
TXNDC15,1-BP DUP,956T

在来自巴基斯坦的 Mirpuri 近亲家族(家族 3)的先证者中,患有 Meckel 综合征(MKS14;619879),Shaheen 等人(2016) 鉴定了 TXNDC15 基因外显子 5 中 1 bp 重复(c.956dupT, NM_024715.3) 的纯合性,导致预计会导致过早终止密码子(Ser321LysfsTer15) 的移码。先证者有一个类似受影响的同胞,但没有报告家庭隔离。对患者成纤维细胞的免疫荧光分析显示,纤毛发生存在明显缺陷,与对照细胞相比,纤毛细胞数量显着减少。

.0004 梅克尔综合症 14
TXNDC15,1-BP DUP,NT211(rs70024847)

Ridnoi 等人在患有梅克尔综合征的爱沙尼亚胎儿中(MKS14;619879)(2019) 鉴定了 TXNDC15 基因突变的复合杂合性:从父亲继承的 1 bp 重复(c.211dup, NM_024715.3),导致预计会导致过早终止密码子(Gln71ProfsTer32) 的移码,以及 c .635T-C 转变从母亲遗传而来,导致 leu212 到 pro(L212P;617778.0005)的取代。这两种变体在 gnomAD 数据库中均以非常低的次要等位基因频率(分别为 0.029% 和 0.00041%)存在。

.0005 梅克尔综合症 14
TXNDC15、LEU212PRO

讨论 TXNDC15 基因中的 c.635T-C 转变(c.635T-C,NM_024715.3),导致 leu212 到 pro(L212P) 取代,这种取代在爱沙尼亚胎儿的复合杂合状态中发现Ridnoi 等人患有梅克尔综合征(MKS14; 619879)(2019),参见 617778.0004。

.0006 梅克尔综合症 14
TXNDC15、ARG282TER

Radhakrishnan 等人在患有梅克尔综合征(MKS14; 619879) 的印度胎儿中(2019) 鉴定了 TXNDC15 基因外显子 4 中 c.844C-T 转换(c.844C-T, NM_024715.3) 的纯合性,导致 arg282 到 ter(R282X) 取代。未受影响的父母的突变是杂合的,该突变在 gnomAD 数据库中以非常低的次要等位基因频率(0.000008128) 存在。