锌指 CCCH 结构域蛋白 12D; ZC3H12D

p34
C6ORF95
MCPIP4

HGNC 批准的基因符号:ZC3H12D

细胞遗传学位置:6q25.1 基因组坐标(GRCh38):6:149,446,795-149,485,014(来自 NCBI)

▼ 说明

ZC3H12D 是一种 CCCH 型锌指蛋白,如 TTP(ZFP36; 190700)、ZAP(ZC3HAV1; 607312) 和 ROQUIN(RC3H1; 609424),而大多数哺乳动物锌指蛋白是 CCHH 或 CCCC 型蛋白。梁等人(2008) 发现 ZC3H12B(也称为 MCPIP2)和其他 MCPIP 蛋白 MCPIP1(ZC3H12A; 610562)、MCPIP2(ZC3H12B; 300889) 和 MCPIP3(ZC3H12C; 615001) 调节巨噬细胞活化。

▼ 克隆与表达

王等人(2007) 报道了散发性肺肿瘤(211980) 中染色体 6q25.1 上频繁发生杂合性丢失(LOH),并确定了 2.2 Mb 的 LOH 最小区域。通过使用来自肺癌谱系的显示与该区域关联的基因组DNA进行直接测序和SNP基因分型,他们鉴定了一个新的候选基因ZC3H12D,并鉴定了密码子106处的非同义A/G SNP,其将赖氨酸改变为精氨酸。推导的 321 个氨基酸蛋白的预测分子量为 34 kD,并包含锌指 CCCH(C-x8-C-x5-C-x3-H) 基序。该蛋白质与其他哺乳动物和低等生物(如斑马鱼和果蝇)的同源物具有重要的保守性。

通过数据库搜索与MCPIP1相似的基因,Liang等人(2008) 鉴定出 MCPIP4,这是一种 527 个氨基酸的蛋白质,含有单个中央 CCCH 型锌指,没有其他可识别的基序。通过 Northern 印迹分析,用脂多糖(LPS) 而不是 Ifng(147570) 处理的小鼠巨噬细胞显示出对 MCPIP4 的一定诱导作用。

▼ 基因功能

王等人(2007)进行的体外克隆形成和体内裸鼠研究表明,与G等位基因相比,ZC3H12D 106A等位基因的过度表达发挥肿瘤抑制功能。

▼ 分子遗传学

王等人(2007) 发现大约 73%(8/11) 具有 LOH 和 A/G SNP 的杂合肺癌组织也表现出 A 等位基因的缺失。王等人(2007) 指出,ZC3H12D 基因位于包含肺癌易感性位点(608935) 的区域内,但 A/G SNP 的关联研究表明,频率较低的 106G(精氨酸)等位基因与肺癌易感性之间没有关联。 Bailey-Wilson 等人研究的家庭(2004)。

▼ 基因结构

王等人(2007)确定ZC3H12D基因包含6个编码外显子和2个非翻译外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Wang 等人(2007) 将 ZC3H12D 基因对应到染色体 6q25.1(版本 36.2)。