SLIT-ROBO RHO GTP 酶激活蛋白 2B； SRGAP2B
HGNC 批准的基因符号：SRGAP2B
细胞遗传学位置：1q21.1 基因组坐标（GRCh38）：1:144,887,288-145,095,380（来自 NCBI）
▼ 说明
SRGAP2B 基因是 SRGAP2A 基因（606524） 的人类特异性旁系同源基因，由不完全片段复制产生（Dennis 等人，2012）。
▼ 克隆与表达
丹尼斯等人（2012） 利用单倍体葡萄胎鉴定了参考基因组中缺失的高度相同的序列，并证实 SRGAP2 基因仅在人类中复制了 3 次。丹尼斯等人（2012） 表明，大约 340 万年前，SRGAP2 的启动子和前 9 个外显子从 1q32.1（SRGAP2A） 复制到 1q21.1（SRGAP2B）。随后，大约 2.4 年前和 100 万年前，两个较大的重复将 SRGAP2B 分别复制到染色体 1p12（SRGAP2C；614704）和近端 1q21.1（SRGAP2D；614705）。
Charrier 等人通过使用人类 SRGAP2A 的 cDNA 序列搜索参考基因组（2012） 鉴定 SRGAP2B 基因是 SRGAP2A 的复制品。 SRGAP2B 和 SRGAP2C 基因在祖先拷贝（SRGAP2A） 的内含子 9 中有一个 3-prime 断点，预计表达含有 459 个氨基酸的蛋白质（Dennis 等人，2012 年；Charrier 等人，2012 年）。前452个氨基酸对应于SRGAP2A的F-BAR结构域的前452个氨基酸。由于 SRGAP2A 的内含子 9 在 SRGAP2B 和 SRGAP2C 中成为 3 素非翻译区，因此两者都使用位于内含子 9 的备用终止密码子，该密码子添加了 7 个氨基酸（VRECYGF）（Dennis 等人，2012 年；Charrier 等人，2012 年） ）。
通过原位杂交，Charrier 等人（2012） 发现 SRGAP2A、SRGAP2B 和 SRGAP2C 在人类胎儿皮质的生发层（心室区和心室下区）中表达，其中神经祖细胞分裂产生有丝分裂后神经元。在皮质板中也检测到显着的表达。在表达 OCT4（164177） 的未分化人胚胎干细胞中检测到低水平的 SRGAP2A、SRGAP2B 和 SRGAP2C，并随着这些细胞分化为神经元而增加。
丹尼斯等人（2012） 确定 SRGAP2B 基因的部分重复导致在染色体 1q21.1 上靠近 SRGAP2B 的 SRGAP2D 基因的形成。 Dennis 等人使用毛细管测序（2012） 表明 SRGAP2B/D 转录本的相对表达明显较低（胎儿和成人大脑中 SRGAP2C 转录本丰度分别为 14-25% 和 30-72%）。许多转录物和推定的剪接亚型不太可能编码源自 SRGAP2B/D 的功能蛋白。
Dennis 等人使用 1000 个基因组计划中 14 个种群的 661 个人的序列数据（2012） 估计了 SRGAP2 旁系同源物的二倍体拷贝数。作者发现 SRGAP2B 和 SRGAP2D 基因在所有测试个体中的拷贝数从 0 到 4 个不等。在所有检测的人类中，祖先 SRGAP2（SRGAP2A） 和衍生的 SRGAP2C 拷贝固定为二倍体拷贝数 2。
▼ 基因功能
丹尼斯等人（2012） 鉴定了 3 个因 SRGAP2B 纯合缺失的个体。这一发现，以及与 SRGAP2C 相比，SRGAP2B 在人脑中的表达显着降低，导致 Dennis 等人（2012） 表明 SRGAP2B 不太可能发挥作用。丹尼斯等人（2012） 还发现正常个体的 SRGAP2D 纯合删除，即孙女副本具有外显子 2 和 3 的获得性内部删除。
▼ 基因结构
SRGAP2B 基因包含 9 个外显子（Dennis 等人，2012；Charrier 等人，2012），并向着丝粒转录（Dennis 等人，2012）。
库茨纳等人（2015） 确定 SRGAP2B 基因有 9 个编码外显子，跨度超过 200 kb。
▼ 测绘
SRGAP2B 基因位于染色体 1q21.1 上（Dennis 等人，2012；Charrier 等人，2012）。
▼ 进化
丹尼斯等人（2012） 观察到 SRGAP2B、SRGAP2C 和 SRGAP2D 在所有检测的非人类类人猿中都不存在，但在尼安德特人和丹尼索瓦人基因组中都存在。丹尼斯等人（2012） 因此得出结论，自智人和尼安德特人大约 100 万年前分化以来，没有发生新的 SRGAP2 重复。
通过计算机分析，Kutzner 等人（2015） 发现 4 个 FAM72 基因（参见 614710）中的每一个都与 1 号染色体相对链上的 SRGAP2 基因配对。FAM72/SRGAP2 基因对存在于脊椎动物中，但只有原始人类，包括尼安德特人和丹尼索瓦人，有 4 个旁系同源 FAM72/SRGAP2 对。没有物种拥有 2 或 3 个 FAM72/SRGAP2 基因对，包括黑猩猩和大猩猩，它们只有 1 个这样的基因对。
