长基因间非编码 RNA 1082; LINC01082

长非编码 RNA TCONS_00024492
lncRNA TCONS_00024492
TCONS_00024492

HGNC 批准的基因符号:LINC01082

细胞遗传学位置:16q24.1 基因组坐标(GRCh38):16:86,196,181-86,199,720(来自 NCBI)

▼ 说明

长非编码 RNA(lncRNA),例如 LINC01082,被认为参与染色质结构和基因表达的远程控制(Szafranski et al., 2013)。

▼ 克隆与表达

Szafranski 等人通过寻找肺泡毛细血管发育不良伴肺静脉错位(ACDMPV; 265380)(一种致命的肺部发育障碍)患者 16 号染色体区域中缺失的基因,发现了这一区域的基因缺失(2013) 识别了 LINC01082,他们将其称为 TCONS_00024492。数据库分析表明 TCONS_00024492 在肺中表达增加。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Szafranski 等人(2013) 将 TCONS_00024492 基因对应到染色体 16q24.1。

▼ 细胞遗传学

在 ACDMPV 患者中发现了 FOXF1 基因(601089) 的杂合突变,该基因与 16q24.1 上的 LINC01082 基因接近。萨弗兰斯基等人(2014) 报道了一名 7 个月大时 ACDMPV 发病相对较晚的患者,发现 FOXF1 基因上游 306 kb 处存在 1.5 Mb 缺失,使 FOXF1 和 LINC01081(614977) 保持完整,但删除了部分 LINC01082 。与对照相比,肺组织中 FOXF1 表达减少了 70%,表明 LINC01082 作为 FOXF1 表达的远程调节因子。该缺失发生在母体染色体上,表明 FOXF1 具有父系印记。