聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员 4; PARP4
聚(ADP-核糖)聚合酶 4; PARP4
ADP-核糖基转移酶样 1; ADPRTL1
VAULT 聚(ADP-核糖)聚合酶; VPARP
KIAA0177
HGNC 批准的基因符号:PARP4
细胞遗传学位置:13q12.12 基因组坐标(GRCh38):13:24,420,931-24,512,778(来自 NCBI)
▼ 说明
ADPRTL1 是催化 ADP-核糖多个支链可逆添加至靶蛋白的多种酶之一。 ADPRTL1 还与称为“穹窿”的大核糖核蛋白(RNP) 复合物相关。由于其独特的结构特点。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行随机测序(1996) 克隆了 ADPRTL1 的部分 cDNA,他们将其命名为 KIAA0177。 Northern印迹分析显示其表达无处不在,在心脏、肺、肾和外周血白细胞中检测到最高水平。
Kickhoefer 等人使用 N 端截短的大鼠主要穹窿蛋白(MVP;605088)作为酵母 2 杂交筛选中的诱饵,然后使用 5 素 RACE(1999) 从 HeLa 细胞 cDNA 文库中克隆了 ADPRTL1,并将其命名为 VPARP。推导的 1,724 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 193 kD。 ADPRTL1 具有一个 N 端 BRCA1(113705) C 端(BRCT) 结构域、一个 PARP(ADPRT; 173870) 样催化结构域、一个具有 2 个类似于间 α-胰蛋白酶抑制剂的序列的结构域(参见 147270)和一个 C 结构域。 -末端 MVP 相互作用域。 BRCT 结构域可能参与蛋白质-蛋白质相互作用,并且存在于参与细胞周期检查点 DNA 损伤反应的蛋白质中。推定的催化结构域与 PARP 的催化亚基有 29% 的同一性,并包含一个保守的 NAD 结合袋。 Northern 印迹分析显示除脑外的所有检查组织中都有 5.4 kb 的转录物。在肾脏中检测到最高表达,其次是脾脏和肝脏。对分级分离的 HeLa 细胞进行蛋白质印迹分析,检测到均匀分布在细胞核、细胞质和微粒体部分之间的 193 kD 蛋白质。微粒体部分中的所有 ADPRTL1 蛋白均与穹窿颗粒相关。 HeLa 细胞中 ADPRTL1 的免疫荧光定位显示与 MVP 共定位的点状细胞质分布。还有与 MVP 无关的核 ADPRTL1 点,以及 ADPRTL1 的一部分与 β-微管蛋白(191130) 沿着分裂细胞中的有丝分裂纺锤体共定位。
仍然等人(1999)获得了部分ADPRTL1克隆,并通过脑cDNA文库的5-prime RACE和筛选胸腺cDNA文库产生了全长cDNA。序列分析表明,催化结构域的N端富含谷氨酸,可能作为自修饰位点。 ADPRTL1 不包含 DNA 结合所需的二分核定位信号或 N 末端锌指结构域。它具有潜在的不可切割的 N 端信号肽、中央假定的跨膜结构域以及其 C 端区域的潜在 SH3 配体结合基序。
▼ 基因功能
通过酵母 2-杂交分析和重组蛋白的体外结合测定,Kickhoefer 等人(1999) 证实了 ADPRTL1 和 MVP 之间的直接相互作用。 C 端结构域(残基 1562 至 1724)是 ADPRTL1 可以结合 MVP 的最小序列。当 PARP 样催化结构域在大肠杆菌中表达为重组蛋白时,显示出 ADP-核糖基酶活性。从大鼠肝脏纯化并与放射性标记 NAD 一起孵育的 Vault 颗粒显示出 Mvp 的显着 ADP 核糖基化和 Adprtl1 的一些自动修饰。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Still 等人(1999) 将 ADPRTL1 基因着丝粒定位到染色体 13q11 上的 ZNF198 基因(602221)。