DGCR8 微处理器复合体子单元; DGCR8
迪乔治综合征关键区基因 8
HGNC 批准的基因符号:DGCR8
细胞遗传学位置:22q11.21 基因组坐标(GRCh38):22:20,080,241-20,111,872(来自 NCBI)
▼ 说明
DGCR8 是一种双链 RNA 结合蛋白,可与 Drosha(608828) 相互作用并促进 microRNA(miRNA) 成熟(Chen 等人总结,2012)。
▼ 克隆与表达
Shiohama 等人通过在 22 号染色体的 DiGeorge 综合征(188400) 关键区域中搜索基因,然后对大脑 cDNA 文库进行 PCR 并筛选胎儿心脏 cDNA 文库,(2003)克隆了DGCR8。推导的 773 个氨基酸的蛋白质在其 N 端半部包含一个 WW 基序,在其 C 端半部包含 2 个双链 RNA 结合基序。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到 4.5 kb 的主要转录本普遍表达,而 3.5 kb 和 1.5 kb 的次要转录本仅在睾丸中发现。小鼠胚胎的原位杂交揭示了不同发育阶段的原代脑、肢芽、血管、胸腺和腭的神经上皮中 Dgcr8 的表达。
▼ 基因功能
RNase III 蛋白在 microRNA(miRNA) 生物合成中发挥着关键作用。核 RNase III Drosha 裂解初级 miRNA(pri-miRNA),释放发夹状的 pre-miRNA,随后被切割生成成熟 miRNA。 Han 等人通过对人胚胎肾细胞核提取物进行免疫沉淀(2004) 发现 DGCR8 直接与 Drosha 相互作用,并且这两种蛋白质存在于约 650 kD 的复合物中。 DGCR8 和 Drosha 除了彼此相互作用之外,还可以在不存在单链 RNA(ssRNA) 的情况下形成同二聚体。用小干扰 RNA 去除 HeLa 细胞中的 DGCR8 会导致 pri-miRNA 的积累以及 pre-miRNA 和成熟 miRNA 的损失。韩等人(2004) 得出结论,DGCR8 对于将 pri-miRNA 加工成 pre-miRNA 至关重要。
格雷戈里等人(2004) 证明人类 Drosha 是 2 个多蛋白复合物的组成部分。较大的复合物含有多种 RNA 相关蛋白,包括 RNA 解旋酶、结合双链 RNA 的蛋白、新型异质核核糖核蛋白和尤文肉瘤蛋白家族。较小的复合物由 Drosha 和双链 RNA 结合蛋白 DGCR8 组成,DGCR8 是迪乔治综合征中删除的基因的产物。体内敲除和体外重建研究表明,这个较小的复合体(称为微处理器)的两个组件对于介导从初级 miRNA 转录物生成 miRNA 是必要且充分的。
韩等人(2006) 使用计算和生化分析来阐明 Drosha-DGCR8 处理 pri-miRNA 的分子基础。典型的后生动物 pri-miRNA 由大约 33 bp 的茎组成,具有末端环和基底 ssRNA 片段。韩等人(2006) 发现基础 ssRNA 片段对于加工至关重要,而末端环是可有可无的。切割位点主要由距茎-ssRNA连接处的距离(约11bp)决定。 DGCR8(而非 Drosha)直接且特异性地与 pri-miRNA 相互作用,并且基础 ssRNA 片段对于这种相互作用至关重要。韩等人(2006) 提出 DGCR8 可能作为分子锚来测量茎-ssRNA 连接处的距离。
王等人(2007) 通过生成 Dgcr8 敲除模型研究了 miRNA 在胚胎干(ES) 细胞分化中的作用。对小鼠敲除 ES 细胞的分析表明,DGCR8 对于 miRNA 的生物合成至关重要。 Dgcr8缺陷型小鼠ES细胞增殖缓慢,并在细胞周期的G1期积累。在诱导分化时,Dgcr8缺陷型ES细胞并未完全下调多能性标记物,并保留了产生ES细胞集落的能力;然而,它们确实表达了一些分化标记。该表型与报道的 Dicer1(606241) 敲除细胞的表型不同,表明 Dicer 在 ES 细胞功能中具有孤立于 miRNA 的作用。王等人(2007) 得出结论,miRNA 在 ES 细胞自我更新的沉默中发挥作用,这种自我更新通常在分化诱导时发生。
Wang 等人通过筛选小鼠 miRNA,寻找能够挽救 Dgcr8 敲除小鼠 ES 细胞生长缺陷的 miRNA(2008) 鉴定了一组具有共享种子序列(AAGUGC) 的 ES 细胞特异性 miRNA,其中包括 miR290 簇的几个成员。在 Cdkn1a(116899) 转录物的 3-prime UTR 中发现了互补的靶序列。测试的所有 5 个 ES 细胞特异性 miRNA(miR291a-3p、miR291b-3p、miR294、miR295 和 miR302d)直接靶向 Cdkn1a 的 3 素 UTR 并抑制报告基因表达。还在其他细胞周期蛋白 E 抑制剂的 3 素 UTR 中鉴定了靶位点(参见 CCNE1;123837)-CDK2(116953) 途径,包括 Rb1(614041)、Rbl1(116957)、Rbl2(180203) 和 Lats2( 604861)。定量 RT-PCR 证实这些基因在 Dgcr8 敲除小鼠 ES 细胞中表达增加。王等人(2008) 得出结论,ES 细胞特异性 miRNA 在加速 G1-S 转变和促进细胞增殖方面具有核心作用。
在缺乏 Dgcr8(一种 microRNA 生物合成所需的蛋白质)的情况下,小鼠胚胎干(ES) 细胞无法抑制自我更新。梅尔顿等人(2010)表明,引入let7(605386) microRNA(体细胞中高度表达的microRNA家族)可以抑制Dgcr8缺失的自我更新,但不能抑制野生型ES细胞的自我更新。将 ES 细胞细胞周期调节(ESCC) microRNA 引入 Dgcr8 缺失的 ES 细胞中,阻断了 let7 抑制自我更新的能力。分析和生物信息分析表明,let7 抑制大量的自我更新基因,而 ESCC microRNA 间接激活这些基因。此外,let7家族的抑制促进体细胞去分化为诱导多能干细胞。梅尔顿等人(2010) 得出结论,ESCC 和 LET7 microRNA 通过共同的途径发挥作用,以交替稳定自我更新和分化的细胞命运。
春等人(2014) 在精神分裂症相关 22q11 缺失综合征的小鼠模型中,确定了听觉皮层丘脑皮质谷氨酸能投射处突触传递的特定破坏(参见 600850)。这种缺陷是由丘脑中 Drd2(126450) 的异常升高引起的,这使得 22q11 缺失综合征丘脑皮层投射对抗精神病药物敏感,并导致与精神分裂症患者中观察到的相似的声音惊吓反应缺陷。 miRNA 处理基因 Dgcr8 的单倍体不足是导致 Drd2 升高和听觉丘脑皮层投射对抗精神病药物过敏的原因。春等人(2014) 得出的结论是,这一结果表明 DGCR8-miRNA-DRD2 依赖性丘脑皮质破坏是精神分裂症相关精神病的潜在致病事件。
▼ 基因结构
盐滨等人(2003) 确定 DGCR8 基因包含 14 个外显子,跨度超过 35 kb。外显子 1 上游区域显示出高 GC 和 CpG 含量。小鼠Dgcr8基因与人类基因具有相同的基因结构和大小。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Shiohama 等人(2003) 将 DGCR8 基因定位到染色体 22q11.2。他们将小鼠 Dgcr8 基因定位到 16q 染色体的一个区域,该区域显示出与人类染色体 22q11.2 同线性的同源性。然而,与人类相比,小鼠的染色体片段是翻转的,因此人类和小鼠基因的方向是相反的。
▼ 动物模型
22q11.2 微缺失的个体表现出行为和认知缺陷,并且患精神分裂症的风险很高。斯塔克等人(2008) 设计了一种小鼠品系,该小鼠品系携带半合子 1.3-Mb 染色体缺陷,跨越人类 22q11.2 基因座的同线片段。这种半合子微缺失被称为 Df(16)A +/-,包含 27 个基因,代表了人类片段中的大部分功能基因。在行为上,与野生型同窝小鼠相比,Df(16)A +/- 小鼠过度活跃,并且在 PPI 任务中表现出缺陷。雄性(而非雌性)似乎害怕探索环境。斯塔克等人(2008) 发现 Df(16)A +/- 小鼠的大脑微结构异常,尽管不存在明显的大脑异常。在海马体中,Df(16)A +/- 小鼠的树突棘数量和大小减少,CA1 锥体神经元的树突复杂性降低。对杂合 Dgcr8 缺陷小鼠的分析表明,Df(16)A +/- 小鼠中 miRNA 生物合成、树突复杂性和 PPI 性能的改变是由于 Dgcr8 单倍体不足所致。斯塔克等人(2008) 得出结论,异常的 miRNA 加工会导致与人类 22q11.2 缺失相关的行为和神经元缺陷。
陈等人(2012) 发现,血管平滑肌细胞(VSMC) 特异性缺失 Dgcr8 的纯合小鼠在胚胎第 14.5 天死亡,而缺失杂合的小鼠能够存活,没有明显的异常。对胚胎的检查表明,VSMC 中 Dgcr8 的缺失会导致生长延迟、血管扩张和广泛的肝脏出血。对胚胎胸主动脉的检查表明,Dgcr8 的缺失会减少 VSMC 的增殖、增强细胞凋亡并破坏其分化。从机制上讲,Dgcr8 的缺失会失调 VSMC 中的 miRNA 生物发生,从而影响细胞生存途径并导致增殖减少、细胞凋亡增强和分化破坏。
林等人(2015) 发现施万细胞(SC) 特异性缺失 Dgcr8 的小鼠在出生后第一周发育正常,但它们出现严重的肢体缺陷,周围神经髓鞘形成减少,类似于先天性髓鞘形成不足的小鼠模型。免疫荧光分析显示,缺乏Dgcr8的SC继续增殖,但未能下调Sox2(184429)和上调Egr2(129010),缺乏髓磷脂基因表达,并表现出增殖增加和分化减少。相应地,缺乏 Dgcr8 的突变神经表现出改变的基因表达谱,并表达去神经相关基因。对突变神经中基因表达的分析证实,Shh(600725) 是去神经特异性基因。此外,Dgcr8对于髓磷脂的维持是必需的,因为成熟SC中Dgcr8的消除会导致基因表达失调并增加巨噬细胞浸润。