转移蛋白质颗粒复合物，亚基 6B; TRAPPC6B

陷阱复合体，亚基 6B
TPC6

HGNC 批准的基因符号：TRAPPC6B

细胞遗传学位置：14q21.1 基因组坐标（GRCh38）：14:39,147,814-39,170,333（来自 NCBI）

▼ 说明

TRAPPC6B 是 TRAPP 复合物的一个组成部分，该复合物是参与囊泡转移的束缚复合物（Kummel 等，2005）。

▼ 克隆与表达

格温等人（2006）鉴定了小鼠 Trappc6b。 Trappc6b 包含 TRAPPC6A（610396）中保守的 2 个基序和几个酵母 TRAPP 亚基，包括 Trs33（TRAAPPC6A 和 TRAPPC6B 的推定同源物）。

▼ 生化特征

库梅尔等人（2005）确定了人类 TPC6 的 1.7 埃晶体结构。 TPC6采用α-β-辫子拓扑并形成二聚体。尽管序列相似性较低，但 TPC6 的结构与 BET3（TRAAPPC3；610955）的结构相似，特别是在二聚化界面处。

▼ 基因功能

通过免疫沉淀和蛋白质下拉实验，Kummel 等人（2005）发现TPC6可以与BET3异二聚化。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 TRAPPC6B 基因测绘到 14 号染色体（WI-15625）。格温等人（2006）指出小鼠 Trappc6b 基因定位于 12 号染色体。

▼ 分子遗传学

Marin-Valencia 等人在来自 3 个埃及近亲家庭的 6 名患有神经发育障碍（伴有小头畸形、癫痫和脑萎缩）的患者中（NEDMEBA；617862）（2018）鉴定了 TRAPPC6B 基因（610397.0001）中的纯合剪接位点突变。通过纯合性作图和候选基因分析发现的突变与家族中的疾病分离。

Harripaul 等人在 2 名来自近亲家庭（IDH3）的患有智力障碍的患者中（2018）鉴定了 TRAPPC6B 基因中的纯合截短突变（R42X; 610397.0002）。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。临床信息、变异的功能研究以及患者细胞的研究尚未报告或进行。这些患者是从来自巴基斯坦和伊朗的 192 个患有常染色体隐性智力障碍的近亲家庭中确定的，他们接受了全外显子组测序。

▼ 动物模型

马林-瓦伦西亚等人（2018）发现斑马鱼胚胎中 trappc6b 基因的吗啡啉敲低会导致存活率下降、头部尺寸减小，并有证据表明细胞凋亡增加。 Trappc6b 突变体还表现出癫痫阈值降低，自发神经元放电增加，以及更频繁和更长的钙电流，与神经元过度兴奋一致。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 伴有小头畸形、癫痫和脑萎缩的神经发育障碍
TRAPPC6B、IVS2AS、A-G、-2

来自 3 个近亲埃及家庭的 6 名患者患有神经发育障碍，包括小头畸形、癫痫和脑萎缩（NEDMEBA; 617862） Marin-Valencia 等人（2018）在 TRAPPC6B 基因的内含子 2 中鉴定出纯合剪接位点突变（c.82-2A-G, NM_177452）。该突变预计会改变剪接，导致移码和提前终止（Glu28ValfsTer11）。该突变是通过纯合性作图、候选基因分析和全外显子组测序的结合发现的，与家族中的疾病分离。该突变在 gnomAD 数据库中以较低频率（0.00004991）被发现，在包含 2,608 名埃及人的内部数据库中以较低频率（0.0023）被发现，其中大多数人患有发育障碍。单倍型分析表明存在创始人效应。对患者成纤维细胞的分析显示，外显子 2 的跳跃导致了异常较短的转录本，证实了剪接位点的异常。然而，患者成纤维细胞没有表现出明显的内质网或高尔基体形态变化或细胞内转移缺陷。

.0002 伴有小头畸形、癫痫和脑萎缩的神经发育障碍
TRAPPC6B、ARG42TER

Harripaul 等人发现，来自一个家庭的 2 名受影响个体（IDH3）患有智力障碍，可能与小头畸形、癫痫和脑萎缩等神经发育障碍一致（NEDMEBA；617862）（2018）在 TRAPPC6B 基因中鉴定出纯合 c.124C-T 转换（c.124C-T，NM_177452.3），导致 arg42 到 ter（R42X）取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。该变异在 ExAC 数据库中以非常低的频率（1.65 x 10（-5））发现于杂合状态。临床信息、变异的功能研究以及患者细胞的研究尚未报告或进行。这些患者是从来自巴基斯坦和伊朗的 192 个患有常染色体隐性智力障碍的近亲家庭中确定的，他们接受了全外显子组测序。