肺癌易感性 3； LNCR3

肺腺癌，易感性

细胞遗传学位置：5p15.33 基因组坐标（GRCh38）：5:1-4,400,000

有关肺癌遗传异质性的一般表型描述和讨论，请参阅 211980。

▼ 测绘

McKay 等人在一项针对 3,259 名肺癌患者和 4,159 名对照者的全基因组关联研究中（2008） 发现肺癌与染色体 5p15.33 上的 2 个 SNP、rs402710 和 rs2736100 之间存在显着关联（分别为 p = 2 x 10（-7） 和 p = 4 x 10（-6））。研究结果在 2,899 例病例和 5,573 例对照中得到重复（2 个 SNP 分别为 p = 7 x 10（-5） 和 p = 0.016）。染色体 5p15 上的易感区包含 2 个基因：TERT（187270） 和 CLPTM1L（612585），表明其中一个或两个基因可能在肺癌病因学中发挥作用。

王等人（2008） 在一项针对 5,095 例肺癌病例和 5,200 例对照的全基因组关联研究中发现，染色体 5p15.33 上的 rs401681 与肺癌易感性之间存在显着关联。研究结果在另外 2,484 例病例和 3,036 例对照中得到了重复（p 值 = 7.90 x 10（-9））。 rs401681 的 A 等位基因与肺癌风险降低相关。 SNP 位于 CLPTM1L 基因的内含子 13 内。

鉴于 5p15.33 区域与癌症生物学的相关性，并在确认该区域内的 SNP 与基底细胞癌风险（605462） 的关联后，Rafnar 等人（2009） 在超过 30,000 个癌症病例和 45,000 个对照中评估了 SNP rs401681 与另外 16 种癌症类型的关联。他们发现 C 等位基因与肺癌相关（OR = 1.15，p = 7.2 x 10（-8）），与膀胱癌、前列腺癌和子宫颈癌的相关性较弱。值得注意的是，大多数癌症类型的风险与环境因素密切相关。肺癌研究包括 4,265 名患者和 34,666 名对照者。

Landi 等人在一项肺癌及其主要组织学类型的全基因组关联研究中，涉及 515,922 个 SNP、5,739 例肺癌病例和 5,848 例对照（2009） 发现 TERT SNP rs2736100 与腺癌风险之间存在关联（比值比，1.23；校正 p = 3.02 x 10（-7））。将他们的结果与之前 10 项研究（总共 13,300 例病例和 19,666 名对照）的汇总数据相结合的荟萃分析重复了这一发现（比值比，1.24；校正 p = 3.74 x 10（-14））。兰迪等人（2009） 得出的结论是，先前确定的染色体 5p15.33 上的 rs2736100 与肺癌风险的关联仅限于腺癌组织学类型，并指出 rs2736100 位于 TERT 的内含子 2 的推定调节区域内。

胡等人（2011） 对 5,408 名受试者（2,331 名肺癌患者和 3,077 名对照者）进行了全基因组关联扫描，随后在 12,722 名受试者（6,313 名病例和 6,409 名对照者）中进行了两阶段验证。综合分析确定了 6 个复制良好的 SNP，它们具有孤立的效应和显着的肺癌相关性。胡等人（2011） 证实了 TERT-CLPTM1L 区域中 5p15.33 的位点，其特征为 rs465498 和 rs2736100（分别为 p = 1.2 x 10（-20） 和 p = 1.0 x 10（-27））。作者还证实了一个相关的 SNP，rs4488809（参见 LNCR5，614210），位于染色体 3q28 上 TP63（603273） 的第一个内含子中（p = 7.2 x 10（-26））。