组蛋白脱乙酰酶 11; HDAC11
HGNC 批准的基因符号:HDAC11
细胞遗传学位置:3p25.1 基因组坐标(GRCh38):3:13,480,306-13,506,416(来自 NCBI)
▼ 说明
HDAC11 作为赖氨酸脱脂酰基酶发挥作用,调节 I 型干扰素(IFN;参见 147660) 信号传导(Cao et al., 2019)。
▼ 克隆与表达
通过使用酵母 HOS3 序列作为查询搜索 EST 数据库,然后使用人真皮成纤维细胞 cDNA 作为模板进行 PCR,Gao 等人(2002)克隆了HDAC11。推导的 347 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 39 kD,包含 I 类和 II 类 HDAC 共有的 9 个脱乙酰酶基序。推定的催化核心区域包括真核 HDAC 共有的不变活性位点残基。 Northern 印迹分析揭示了一个 1.7-kb 转录本,对应于 347 个氨基酸的蛋白质,以及一个更丰富的 3.2-kb 转录本。脑、心脏、骨骼肌和肾脏中的表达最高。实时 PCR 还显示 HDAC11 在睾丸中高表达。对转染的 293 细胞进行细胞分级分离后,HDAC11 与核提取物分开。
▼ 基因结构
高等人(2002) 确定 HDAC11 基因包含 9 个外显子,跨度约为 25 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Gao 等人(2002) 将 HDAC11 基因定位到染色体 3p25.2。
▼ 基因功能
通过免疫纯化的重组 HDAC11 的体外测定,Gao 等人(2002)证实HDAC11具有HDAC活性并且该活性可被HDAC抑制剂trapoxin抑制。在免疫共沉淀实验中,HDAC11 与 HDA6(300272) 相互作用,但不与 RbAp48(RBBP4; 602923)、NCOR(参见 600848)、SMART 或小鼠 Sin3a(607776) 相互作用。
使用纯化的重组人 HDAC11,Cao 等人(2019) 鉴定出 HDAC11 是一种赖氨酸脱脂酰基转移酶,其催化效率比其脱乙酰酶活性高 10,000 倍以上。 HDAC11 直接去除 SHMT2(607226) lys245 处的脂肪酰基。 SHMT2 的赖氨酸脂肪酰化促进 IL1R1(147810) 易位至晚期内体/溶酶体并调节其稳定性。从 SHMT2 中去除赖氨酸脂肪酰化并不影响其酶活性,但影响了 SHMT2 调节 IL1R1 泛素化和细胞表面水平的能力。因此,通过调节 SHMT2 的赖氨酸脂肪酰化,HDAC11 调节 I 型 IFN 信号传导。