含有三联基序的蛋白质 36; TRIM36

RBCC728

HGNC 批准的基因符号：TRIM36

细胞遗传学位置：5q22.3 基因组坐标（GRCh38）：5:115,124,772-115,180,294（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Reymond 等人使用 B框 结构域共有序列筛选 EST 数据库中的新 TRIM 家族成员（2001） 鉴定并克隆了小鼠和人类 TRIM36。推导的蛋白质包含 N 端 RING 结构域、B框-1 和 B框-2 结构域以及卷曲螺旋区域。

Balint 等人通过对肾细胞癌中重复的 5 号染色体区域进行测序，（2004） 鉴定了 TRIM36，他们将其指定为 RBCC728。他们通过胎儿大脑和成人肾脏 cDNA 文库的 PCR 获得了全长 cDNA。推导的 728 个氨基酸蛋白具有 N 端环指 C3HC4 结构、2 个 B 框、卷曲螺旋区域、III 型纤连蛋白（参见 135600）结构域和 SPRY 蛋白中发现的 C 端结构域（参见 SPRY1） ；602465）。 TRIM36 还包含二分核定位信号。 TRIM36 与 MID1（300552） 具有 26% 的氨基酸同一性。定量RT-PCR检测到TRIM36在睾丸中表达最高，其次是前列腺和大脑，在肾、肺和心脏中表达较弱。与正常组织相比，TRIM36 表达在一些前列腺癌中上调。 COS-7 细胞中重组和内源 TRIM36 的免疫组织化学分析显示，该蛋白在细胞质中以轻微丝状染色模式表达。 TRIM36 经常聚集在细胞与细胞接触的部位附近，有丝分裂细胞的 TRIM36 染色呈阴性。

辛格等人（2017） 发现 TRIM36 基因在人类胎儿大脑中表达。在斑马鱼胚胎中，它在神经板、神经管和后体节的一部分中表达。

▼ 基因结构

巴林特等人（2004） 确定 TRIM36 基因包含 10 个外显子，跨度为 55 kb。

▼ 测绘

通过辐射混合分析，雷蒙德等人（2001） 将 TRIM36 基因定位到染色体 5q22。通过鸟枪法测序，Balint 等人（2004） 鉴定了 BAC 内的 TRIM36 基因对应到染色体 5q22.3。

▼ 分子遗传学

Singh 等人在一个 20 周大的胎儿中，由印度近亲父母怀上，患有无脑畸形（ANPH1；206500）（2017） 鉴定了 TRIM36 基因中的纯合错义突变（P508T; 609317.0001）。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。与对照相比，突变的细胞转染导致微管破坏、纺锤体紊乱、染色体排列松散、胞质分裂异常、细胞增殖减少和细胞凋亡增加。使用 siRNA 细胞敲低 TRIM36 也获得了类似的结果。辛格等人（2017） 得出结论，突变的 TRIM36 在神经管形成过程中对神经细胞增殖产生不利影响，导致无脑畸形。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 无脑畸形 1（1 名患者）
TRIM36、PRO508THR

Singh 等人在一个 20 周大的胎儿中，由印度近亲父母（IIS-15 家族）出生，患有无脑畸形（ANPH1；206500）（2017） 在 TRIM36 基因的外显子 8 中鉴定出纯合 c.1522C-A 颠换（c.1522C-A，NM_018700），导致 B30 中高度保守的残基处发生 pro508 至 thr（P508T） 取代。 2/SPRY 域。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。该变体根据 dbSNP（版本 135）、1000 基因组计划和外显子组变体服务器数据库进行过滤。 ExAC 数据库（2016 年 9 月 1 日）在南亚血统个体中发现该病毒的频率较低（0.00026）。体外研究和患者细胞研究表明突变蛋白不如野生型蛋白稳定。细胞转染研究表明，与对照相比，该突变导致微管破坏、纺锤体紊乱、染色体排列松散、胞质分裂异常、细胞增殖减少和细胞凋亡增加。使用 siRNA 细胞敲低 TRIM36 也获得了类似的结果。