趋化因子、CC 基序、配体 4-LIKE 1; CCL4L1
CCL4L
小诱导细胞因子 A4 样; SCYA4L
淋巴细胞激活基因 1; LAG1
AT744.2
HGNC 批准的基因符号:CCL4L1
细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:33,500,001-39,800,000
▼ 克隆与表达
静息 T 细胞的有丝分裂刺激导致许多基因从头转录,包括编码淋巴因子 MIP-1-α(464.1; 182283) 和 MIP-1-β(744.1; 182284) 的基因。欧文等人(1990) 发现包含紧密连锁的 464.1 和 744.1 基因的基因组片段在许多个体的基因组中重复。他们分别将非等位基因命名为 464.2(SCYA3L1; 601395) 和 AT744.2。 464.2和744.2基因也彼此紧密相连。
Baixeras 等人使用 cDNA 文库的消减杂交(1990) 鉴定出一个名为 LAG1 的基因。该cDNA编码69个氨基酸的多肽,属于由活化的淋巴细胞和/或单核细胞分泌的一类蛋白质。通过原位杂交,对该基因进行了克隆和测序。
MIP1B 是一种 8 kD 酸性蛋白,在单核细胞、T 细胞和其他淋巴细胞中受到刺激后表达上调。它属于 CC 趋化因子亚家族,指导特定白细胞亚群的迁移。莫迪等人(2001) 指出,自从分离出第一个 MIP1B 分子克隆以来,关于编码 MIP1B 和相关蛋白质的基因的确切数量一直存在混乱。他们证明,MIP1B 由 2 个旁系同源基因 ACT2(CCL4) 和 LAG1(CCL4L) 编码,这两个基因紧密位于 17 号染色体的长臂上。这些蛋白质具有共同的长度,并且 92 个氨基酸中有 89 个是相同的。前 2 个氨基酸差异发生在信号肽中,而第三个差异则发生在成熟蛋白质中。在转录区域内,基因在 662 个核苷酸中有 25 个不同。 EST 数据库分析鉴定出 5 个代表 LAG1 转录物的克隆,这些转录物是选择性剪接的,其中省略了 115 bp 的外显子 2。
Lu 等人使用 RT-PCR 分析(2004) 表明 ACT2 和 LAG1 是不同的基因,单核细胞主要表达 ACT2,而外周 B 淋巴细胞表达 ACT2 和 LAG1 的混合物。卢等人(2004) 还鉴定了主要表达 LAG1 的 B 细胞系。他们得出结论,单核细胞和 B 细胞使用不同的机制来调节这 2 个基因的表达。卢等人(2004) 认为最有效的抗 HIV 药物是那些能够增加与 CCR5 具有最高亲和力的 CCL4 蛋白(即 ACT2 或 LAG1)表达的药物(601373)。
Townson 等人使用基因组 DNA 的实时 PCR 技术(2002) 发现 100 个白人个体中 CCL4L1 基因的每个二倍体基因组的拷贝数在 0 到 6 之间。
科洛布兰等人(2005) 表明 CCL4 和 CCL4L 都会产生缺乏外显子 2 的剪接变体。
▼ 测绘
通过对体细胞杂交体的分析,欧文等人。 Tasaki 等(1990) 将 AT744.2 基因对应到 17 号染色体(1999) 报道了 AT744.2 相对于 CC 趋化因子基因簇中 17q11.2 的其他基因的排列。通过基因组序列分析,莫迪等人(2001) 确定 ACT2 和 LAG1 基因位于 17 号染色体上,相距约 651 kb。
通过对位于染色体 17q12 的片段重复中的 BAC 克隆进行测序,Modi(2004) 鉴定了 CCL3L1(601395) 和 CCL4L1 基因的 2 个完整拷贝。 CCL4L1 的端粒副本称为 CCL4L2(610757)。
▼ 分子遗传学
科洛布兰等人(2005) 鉴定了 CCL4L 基因中的多态性,即内含子 2 受体剪接位点 +590 处的 G 到 A 的变化。他们将该等位基因命名为 L2 和原始等位基因 L1。与L1相比,L2等位基因使用了几个新的受体剪接位点并生成9个新的mRNA。 175 名西班牙 HIV 阳性患者(28.6%) 的 L2 等位基因频率显着高于 220 名健康对照者(16.6%)。
▼ 命名法
莫迪等人(2001)指出ACT2与CCL4、SCYA4和MIP1B同义,而LAG1与CCL4L和SCYA4L同义。