SCHLAFEN 家族,成员 12 ; SLFN12L
SLFN12样
HGNC 批准的基因符号:SLFN12L
细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:35,464,254-35,537,678(来自 NCBI)
▼ 说明
Schlafen(SLFN) 家族包含 9 个小鼠基因和 6 个人类基因,其中包括 SLFN12L,其编码的蛋白质具有保守的 N 末端,其中包含推定的 AAA ATP 酶结构域。较长的 SLFN 蛋白具有类似于 DNA/RNA 解旋酶结构域的 C 端基序。小鼠研究表明 SLFN 蛋白参与细胞生长和 T 细胞发育的调节(Geserick 等人(2004) 和 Li 等人(2012) 总结)。
▼ 克隆与表达
Schwarz 等人使用小鼠胸腺 cDNA 文库进行消减杂交来鉴定由于正选择而上调的基因,然后进行数据库分析(1998) 鉴定了小鼠 Slfn1、Slfn2、Slfn3 和 Slfn4。 Northern 印迹分析显示所有 4 个基因均低表达。 RT-PCR 分析检测到 Slfn1、Slfn2 和 Slfn4 在胸腺、淋巴结和脾脏中表达最高。
范·祖伦等人(2011) 指出人类 SLFN12(614955) 和 SLFN12L 与小鼠 Slfn1、Slfn2、Slfn3 和 Slfn4 是直系同源的。
▼ 测绘
Gross(2012) 根据 SLFN12L 序列(GenBank NM_001195790) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SLFN12L 基因对应到染色体 17q12。
布斯托斯等人(2009) 发现,在所检查的所有哺乳动物基因组中,SLFN 基因聚集在同一直系同源区域内,两侧是 UNC45(UNC45B; 611220) 和 PEX12(601758) 基因。人类和小鼠的 SLFN 簇分别位于 17 号和 11 号染色体上。
▼ 基因功能
SLFN12L 的假定小鼠直系同源物
Schwarz 等人的泛函分析(1998) 表明小鼠 Slfn1 通过破坏胸腺细胞分裂来抑制细胞生长和胸腺发育。施瓦茨等人(1998) 得出结论,SLFN 蛋白家族参与指导细胞生长和 T 细胞发育。
布雷迪等人(2005) 发现细胞周期蛋白 D1(CCND1; 168461) 的丝裂原驱动诱导是小鼠 Slfn1 的靶标,能够导致细胞周期中 G1 中期停滞。
范·祖伦等人(2011) 发现小鼠 Slfn4 mRNA 水平在巨噬细胞激活过程中上调,但在分化过程中下调。体内骨髓谱系中 Slfn4 的组成型表达扰乱了骨髓生成。范·祖伦等人(2011) 假设巨噬细胞分化过程中 Slfn4 下调对于该谱系的发育是必要的。
▼ 进化
布斯托斯等人(2009) 使用基因组和系统发育研究来研究 SLFN 基因家族的进化和作用。他们发现SLFN家族广泛分布在哺乳动物中,有4个主要分支,它们以不同的目的经历了谱系特异性的扩张或收缩,包括灵长类动物和啮齿类动物。布斯托斯等人(2009) 还鉴定了软骨鱼和两栖动物中的 SLFN 家族成员。他们发现证据表明正选择作用于许多 SLFN 基因。 SLFN 家族的一个成员从小鼠水平转移到正痘病毒,作者假设它在使病毒能够存活于宿主防御机制中发挥着作用。病毒 SLFN 序列在纯化选择下不断进化,表明它们的功能相关性。
范·祖伦等人(2011) 指出,只有 2 个 SLFN 家族成员 SLFN5(614952) 和 SLFN14(614958) 在小鼠和人类中具有直接直系同源物,这与 SLFN 家族在哺乳动物物种中的快速进化一致。人 SLFN12 和 SLFN12L 在小鼠中具有 4 个直向同源物(Slfn1、Slfn2、Slfn3 和 Slfn4),人 SLFN11(614953) 和 SLFN13(614957) 在小鼠中具有 3 个直向同源物(Slfn8、Slfn9 和 Slfn10)。
▼ 动物模型
伯杰等人(2010) 报道了 N-乙基-N-亚硝基脲诱导的小鼠突变,称为 elektra。他们将 elektra 突变鉴定为 Slfn2 基因中的 ile135 到 asp(I135D) 替换。尽管 Slfn2 没有人类直系同源物,但 Berger 等人(2010) 指出它与 SLFN12 和 SLFN12L 最相似。 elektra 突变纯合子小鼠表现出对细菌和病毒感染的易感性增强,T 细胞和炎症单核细胞数量减少,这些细胞和炎症单核细胞在感染后无法增殖,并通过内在细胞凋亡途径响应不同的增殖刺激而死亡。他们还拥有更大比例的准备复制 DNA 的 T 细胞,并且他们的 T 细胞表达激活标记子集,表明处于半激活状态。伯杰等人(2010) 的结论是,Slfn2 通过调节 T 细胞和单核细胞的静止状态,在防御病原体方面发挥生理作用。