同种异体移植物炎症因子 1; AIF1
干扰素反应记录 1; IRT1
IBA1
HGNC 批准的基因符号:AIF1
细胞遗传学位置:6p21.33 基因组坐标(GRCh38):6:31,615,234-31,617,015(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Autieri(1996) 从人外周血淋巴细胞 cDNA 文库中克隆了 AIF1(同种异体移植物炎症因子-1)的全长 cDNA。差异显示PCR显示,相应的大鼠基因在球囊血管成形术期间发生的血管损伤中表达增加。序列分析显示,AIF1编码143个氨基酸的多肽,比大鼠Aif1短4个氨基酸;这方面的差异主要存在于 C 端。 AIF1 的氨基酸基序分析揭示了共有的 EF 手螺旋环结构域,这是钙结合蛋白的保守特征。 Autieri(1996) 表明 Aif1 表达在球囊血管成形术后 3 天内升高 8 至 9 倍。作者还证明,促细胞分裂素植物血凝素 A(PHA) 可以增强外周血淋巴细胞中 AIF1 mRNA 的组成水平。作者得出的结论是,AIF1 代表一种细胞因子诱导的、组织特异性的、高度保守的转录物,在血管创伤反应中瞬时表达。 Northern印迹分析显示,AIF1在多种人体组织中表达,其中在淋巴来源的组织中表达最高,特别是脾脏、血液淋巴细胞和胸腺。
▼ 基因功能
Autieri 和 Agrawal(1998) 通过用各种细胞因子刺激血管平滑肌细胞(VSMC) 鉴定了 IRT1。 Northern印迹分析显示,在用γ-干扰素(IFNG;147570)刺激但用其他细胞因子或生长因子刺激的VSMC中,1.3-kb IRT1转录物在人体组织和VSMC中广泛但可变的组成型表达。 IRT1 表达在增殖的 T 细胞中下调。大鼠颈动脉球囊血管成形术刺激了 IRT1 的表达,这可能是由于损伤部位存在产生 Ifng 的 T 淋巴细胞。预测的蛋白质包含亮氨酸拉链基序、疏水区、核定位序列和 2 个潜在的磷酸化位点。 VMSC 中 IRT1 的过度表达导致形态改变并抑制细胞生长。
Autieri 等人使用体外结合和免疫共沉淀测定(2003) 确定 AIF1 与肌节蛋白相互作用。在未刺激的 VSMC 中,AIF1 与 F-肌节蛋白共定位,但在 PDGF(参见 190040)刺激后易位至板状伪足。用 AIF1 逆转录病毒稳定转导的 VSMC 对 PDGF 的响应速度比对照细胞快 2.6 倍。 AIF1 与 RAC1(602048) 共定位,AIF1 转导的 VSMC 显示 RAC1 的组成型和增强激活。奥蒂耶里等人(2003) 得出结论,AIF1 结合并聚合 F-肌节蛋白并调节 RAC1 活性和 VSMC 迁移。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 AIF1 基因定位到 6 号染色体(SHGC-132025)。
AIF1 基因位于肿瘤坏死因子(TNF) 基因簇中,该基因簇位于 6p21.3 上人类主要组织相容性复合体(MHC) 所代表的区域中(Allcock 等人,2004)。