ARF GTP 酶激活蛋白,具有 GTP 酶结构域、锚蛋白重复序列和 血小板-白细胞C 激酶底物 同源结构域 3; AGAP3

CENTAURIN, γ-3; CENTG3

此条目中涉及的其他实体:
包括 CRAM 相关 GTP 酶;包括岩壁

HGNC 批准的基因符号:AGAP3

细胞遗传学位置:7q36.1 基因组坐标(GRCh38):7:151,085,867-151,144,434(来自 NCBI)

▼ 说明

AGAP3 基因编码多种蛋白质亚型。全长 AGAP3 是 NMDA 受体复合物的组成部分(参见 138253),调节 RAS(HRAS;190020)/ERK(参见 601795)信号传导和 AMPA 受体(参见 138248)转移(Oku 和 Huganir,2013)。较小的亚型 CRAG 是一种 GTP 酶,可介导 PML(102578) 体形成和扩展的聚谷氨酰胺蛋白的降解(Qin 等,2006)。

▼ 克隆与表达

通过筛选大鼠大脑中的 Cram 靶点(DPYSL5;608383),Qin 等人(2006) 确定了 Crag。他们克隆了小鼠Crag,并通过数据库分析确定CRAG是人类AGAP3的剪接变体。推导的 369 个氨基酸的小鼠蛋白具有富含谷氨酰胺的 N 端、中央 RAS 同源结构域和 C 端核定位信号(NLS)。对小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到一个编码 Crag 的短转录本,主要在大脑和心脏中表达,以及一个广泛表达的较长转录本,可能编码全长 Agap3。蛋白质印迹分析显示,与成年小鼠大脑相比,胚胎小鼠大脑中的 Crag 表达更强。 HeLa 细胞和大鼠海马神经元的免疫细胞化学分析表明,CRAG 在静止状态下广泛定位于细胞质中,但在紫外线(UV) 照射后形成核包含物(NI)。

Oku 和 Huganir(2013) 报道,大鼠 Agap3 编码至少 3 个亚型:98 kD 全长蛋白、58 kD 蛋白和 43 kD 蛋白(Crag)。全长 Agap3 包含 GTPase 样结构域、血小板-白细胞C 激酶底物(PLEK; 173570) 同源(PH) 结构域、ArfGAP 结构域、锚蛋白(参见 612641)重复序列和推定的 C 端 I 型 PDZ 配体。大鼠组织的蛋白质印迹分析表明,全长 Agap3 在睾丸、肺和脑中表达,而 Crag 仅在脑中表达。全长 Agap3 和 Crag,但不包括 58-kD 亚型,在大鼠大脑的突触部分中富集。大鼠脑匀浆的蛋白质印迹分析表明,全长 Agap3 表达在出生后 7 至 15 天最高,但持续到成年期,而 Crag 表达从出生后 15 天开始逐渐增加。

▼ 基因功能

通过在 HeLa 细胞中过度表达小鼠 Crag 突变体,Qin 等人(2006) 确定 Crag 在紫外线照射后形成 NIs 需要 NLS,而不是 GTPase 结构域。 GTPase 测定表明,Crag 通常由 UV 照射激活,但 N 端 GFP 融合导致组成型激活和 NI 的基础定位。在紫外线刺激的大鼠背根神经节神经元和 HeLa 细胞中,Crag 以 GTPase 依赖性方式与 PML 体共定位。免疫共沉淀实验表明,内源性 CRAG 和 PML 在紫外线刺激的神经元和 HeLa 细胞中相互作用。 Crag-Pml 相互作用以依赖于 Crag GTPase 结构域和 Pml RING Finger 结构域的方式增加泛素积累。 CRAG 内含物存在于 Machado-Joseph 病(MJD; 109150) 患者的大脑中,这是一种以聚谷氨酰胺重复序列(polyQ) 扩张为特征的疾病。扩展的polyQ(Q69),但不是正常长度的polyQ(Q12),与海马神经元中的内源性Crag 以及HeLa 细胞中过度表达的小鼠Crag 相关。 Crag 和 Q12 表现出弥漫性细胞质表达,而 Q69 和 Crag 则定位于 NI。 Crag 以活性氧(ROS) 依赖性方式诱导 NI 形成,以响应应激源(包括紫外线和过氧化氢)。 Q69(但不是 Q12)以 ROS 依赖性方式与 Crag 相关并激活。 Crag 以 NLS 依赖性方式促进 Q69 易位至 NI,并且 Crag 需要其 NLS 和 GTPase 结构域以泛素蛋白酶体依赖性方式促进 Q69 降解,从而减少细胞凋亡。

Oku 和 Huganir(2013) 使用酵母 2 杂交筛选表明,全长大鼠 Agap3 与 NMDA 受体复合体成员 Syngap(SYNGAP1;603384) 相互作用。免疫共沉淀实验证实了转染的 HEK293 细胞和大鼠原代皮质培养物中的相互作用。将纯化的 Syngap RasGAP 结构域添加到 Agap3 GTPase 样结构域中可增加 Agap3 GTPase 的体外活性。敲除和免疫共沉淀实验将 Agap3 鉴定为 NMDA 受体信号传导复合物的一个组成部分,并表明它孤立于 Syngap 功能调节 NMDA 受体依赖性 Ras/ERK 信号传导。 Agap3 与活性但非非活性的 Arf6(600464) 共免疫沉淀,并通过其 ArfGAP 结构域负向调节基础 Ras 水平和 Arf6 活性。 Agap3 敲除增加了基础 Ras 和 Arf6 活性,这反过来又阻止了通常由化学长时程增强(LTP) 诱导的 Ras 增加。诱变实验表明 Agap3 的 GTPase 结构域是 Ras/ERK 信号转导所必需的。分离皮质培养物中的敲低实验表明,Agap3 以 ArfGAP 结构域依赖性方式降低 Glua1 AMPA 受体亚基(GRIA1;138248)的表面水平,这与神经元棘密度增加相关。此外,Agap3 在化学诱导的 LTP 过程中调节 Glua1 向细胞表面的转移。 Oku 和 Huganir(2013) 提出 AGAP3 是 NMDA 受体复合物的重要信号成分,它将 NMDA 受体激活与 AMPA 受体转移联系起来。

▼ 测绘

Gross(2016) 根据 AGAP3 序列(GenBank BC044644) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 AGAP3 基因对应到染色体 7q36.1。