D4Z4 结合元件转录,非编码; DBET
DBE 转录,非编码
HGNC 批准的基因符号:DBET
细胞遗传学位置:4q35.2 基因组坐标(GRCh38):4:190,064,502-190,067,864(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
面肩肱型肌营养不良症(FSHD; 158900) 是一种常染色体显性遗传疾病,与染色体 4q35 上 D4Z4 重复次数减少(参见 606009)和染色体 4q35 基因去抑制有关。 Cabianca 等人使用实时 RT-PCR(2012) 鉴定了一种长非编码 RNA,DBET,仅由 FSHD 肌肉活检和培养的肌肉细胞表达。 DBET的转录从邻近D4Z4的区域开始,并且DBET包含邻近D4Z4的非删除元件(NDE)和D4Z4内的D4Z4结合元件(DBE)。 Northern 印迹分析检测到约 9.8 kb 的 DBET 转录本。分级分离和抑制剂实验表明,DBET 是一种成熟的核转录物,主要与 FSHD 基因座染色质去抑制相关。
▼ 基因功能
卡比安卡等人(2012) 发现人类 4 号染色体/CHO(chr4/CHO) 杂交细胞中染色体 4q35 基因和 DBET 均不表达。然而,在 RNA 干扰介导的抑制性 Polycomb 复合物 2 核心亚基 Suz12(606245) 敲低或 DNA 甲基化和组蛋白脱乙酰化抑制后,4q35 基因和 DBET 均被诱导。 DBET 直接与组蛋白甲基转移酶 Ash1l(ASH1; 607999) 相互作用。 chr4/CHO 细胞中 Ash1l 的敲低会损害染色体 4q35 基因(包括 DBET)的抑制。相反,DBET 的敲低会损害 Ash1l 在明显的正反馈循环中向 FSHD 基因座的募集。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Cabianca 等人(2012) 将 DBET 对应到靠近 D4Z4 重复序列和表达的 DUX4 基因的染色体 4q35 区域(606009)。