聚合酶 II、RNA、亚基 I; POLR2I

RPB9,酿酒酵母,同源物
RNA 聚合酶 II,14.5-KD 亚基

HGNC 批准的基因符号:POLR2I

细胞遗传学位置:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:36,113,709-36,114,875(来自 NCBI)

▼ 正文

在真核细胞中,编码 mRNA 的基因的转录受到 RNA 聚合酶 II 与许多控制转录起始、延伸和终止的选择性和/或效率的辅因子的组合的影响。根据其来源,RNA 聚合酶 II 由 10 至 14 个 220 至 10 kD 的多肽组成。有关 RNA 聚合酶 II 的结构和功能的一般信息,请参见 POLR2A(180660)。

▼ 克隆与表达

人 RNA 聚合酶 II(POLR2A) 最大亚基的 cDNA 编码平均分子量 220 kD 的多肽。第二大亚基(POLR2B;180661)的分子量约为 140 kD。阿克尔等人(1993) 报道了与酵母中 RPB9 同源的人类亚基的基因组序列。 POLR2I 基因被转录成 3 种主要的 RNA。相应的 mRNA 包含相同的开放解读码组,编码 125 个氨基酸残基的蛋白质,计算分子量为 14,523 道尔顿。

▼ 基因结构

阿克尔等人(1993) 发现 POLR2I 基因由 6 个外显子组成,长度范围从 52 到超过 110 bp。

▼ 基因功能

缺乏RPB9的酵母细胞无法在高温和低温下生长,并且mRNA起始位点选择存在缺陷。麦库恩等人(1995)发现POLR2I在高拷贝数质粒上的表达在高温下恢复了生长,但在低拷贝数质粒上则不然。重组 POLR2I 还能够像酵母 RPB9 亚基一样有效地纠正体外 CYC1 启动子处出现的起始位点选择缺陷。

▼ 测绘

通过原位杂交,Acker 等人(1994) 将 POLR2I 基因分配给染色体 19q12。

▼ 生化特征

晶体结构

克莱默等人(2000) 使用扩展至 3 埃分辨率的 X 射线衍射数据推导了 10 亚基酵母 RNA 聚合酶 II 的主干模型。所有10个亚基均与相应的人类蛋白质表现出高度的同一性,并且10个亚基中的9个在3种真核RNA聚合酶I、II和III中是保守的。该模型的显着特征包括一对由 Rpb1(180660)、Rpb5(180664) 和 Rpb9 亚基形成的颌,似乎可以抓住活性中心下游的 DNA。由 Rpb1、Rpb2(180661) 和 Rpb6(604414) 形成的 DNA 上靠近活性中心的钳位可能被 RNA 锁定在闭合位置,从而解释了转录复合物的高度稳定性。活性中心下方的蛋白质复合物中的孔可以允许聚合底物进入,并在校对和通过 DNA 中的暂停位点期间允许转录物退出。