硒代半胱氨酸插入序列结合蛋白2-样; SECISBP2L

SECIS 结合蛋白 2 样; SBP2L
KIAA0256

HGNC 批准的基因符号:SECISBP2L

细胞遗传学位置:15q21.1 基因组坐标(GRCh38):15:48,988,638-49,046,446(来自 NCBI)

▼ 说明

硒蛋白含有氨基酸硒代半胱氨酸(sec),它由UGA(通常是终止密码子)编码。 SECISBP2(607693) 结合硒蛋白 mRNA 3 素 UTR 中的秒插入序列(SECIS),从而允许将 UGA 解码为秒。 SECISBP2L 与 SECISBP2 具有显着的相似性,并结合含有 SECIS 的序列,但它缺乏催化 sec 掺入蛋白质的能力(Donovan 和 Copeland,2012)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的人 KG-1 未成熟骨髓性白血病细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1996) 获得了部分 SECISBP2L 克隆,他们将其命名为 KIAA0256。 Northern 印迹分析检测到所有受检查的人体组织和细胞系中都有可变的 SECISBP2L 表达。

Donovan 和 Copeland(2012) 指出,推导的 1,101 个氨基酸的 SBP2L 蛋白包含一个与 SECISBP2 保守的 N 端基序、一个中央 sec 掺入结构域(SID) 和一个 C 端 RNA 结合结构域(RBD)。数据库分析显示脊椎动物同时表达SBP2和SBP2L,而一些无脊椎动物仅表达Sbp2l。

▼ 基因功能

Donovan 和 Copeland(2012) 此前发现体外翻译的人 SBP2L 缺乏 sec 掺入活性。他们发现,SBP2L 的分离催化区域(包含 SID 和 RBD)结合了包含 SECIS 的合成序列,但在 sec 掺入中同样没有活性。人 U87MG 胶质母细胞瘤细胞的免疫沉淀显示 SBP2L 结合几种内源性硒蛋白 mRNA。然而,与SBP2的SID和RBD不同,SBP2L中的SID和RBD没有形成稳定的相互作用。 SBP2L 的过表达和敲低均不会改变转染 HEK293 细胞中硒蛋白的含量。 Donovan 和 Copeland(2012) 得出结论,SBP2L 可能在硒蛋白的表达中具有调节作用。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1996) 将 SECISBP2L 基因对应到 15 号染色体。

Hartz(2014) 根据 SECISBP2L 序列(GenBank D87445) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SECISBP2L 基因对应到染色体 15q21.1。