富含脯氨酸的小蛋白 4; SPRR4
HGNC 批准的基因符号:SPRR4
细胞遗传学位置:1q21.3 基因组坐标(GRCh38):1:152,968,750-152,972,574(来自 NCBI)
▼ 说明
SPRR 蛋白,例如 SPRR4,是角化细胞包膜的前体,角化细胞包膜是在复层鳞状上皮最外层形成的结构。 SPRR 基因簇在染色体 1q21 上跨越约 170 kb(Cabral 等人总结,2001)。
▼ 克隆与表达
Cabral 等人通过在 EST 数据库中搜索 SPRR1 的同源物(参见 SPRR1A, 182265),然后对表皮 RNA 进行 RT-PCR(2001)克隆了SPRR4。 SPRR4 蛋白由 79 个氨基酸组成,富含谷氨酰胺(主要在 N 末端)、脯氨酸和赖氨酸。 SPRR4 的中心区域包含 4 个 PKxKxxCA 八聚体拷贝,但缺乏其他 SPRR 蛋白中发现的 PEP 序列。 SPRR4 的 N 和 C 末端与其他 SPRR 蛋白高度同源。 24 种人体组织的 Northern 印迹分析以及复层鳞状上皮和非鳞状组织的 RT-PCR 未能检测到 SPRR4 表达。 RT-PCR分析检测到正常人表皮和角质形成细胞中SPRR4的弱表达。转染的人角质形成细胞的共聚焦显微镜显示,在没有钙的情况下,SPRR4 定位在细胞质中,而在有钙的情况下,SPRR4 易位到细胞外周。
▼ 基因功能
Cabral 等人使用 Northern blot 分析(2001) 发现在暴露于紫外线(UV)-B 或 UV-C(但不是 UV-A)48 小时后,人表皮和角质形成细胞中 SPRR4 的表达显着上调。与其他 SPRR 不同,钙诱导的分化对 SPRR4 表达没有影响。在正常皮肤长期暴露于紫外线后,SPRR4 转录物也会被强烈诱导,尤其是在基底上层。卡布拉尔等人(2001)得出结论,SPRR4在正常条件下不在皮肤中表达,但在紫外线照射后被高度诱导,并选择性地掺入不成熟、脆弱和疏水性差的细胞包膜中。他们假设 SPRR4 参与紫外线照射后皮肤完整性的维持。
▼ 基因结构
卡布拉尔等人(2001) 确定,与其他 SPRR 基因一样,SPRR4 基因包含 2 个外显子,整个 ORF 存在于外显子 2 中。
▼ 测绘
Cabral 等人使用粘粒克隆(2001) 将 SPRR4 基因定位到染色体 1q21 上 SPRR 基因簇的近端,位于 SPRR1A 和外皮蛋白(IVL; 147360) 基因之间。