FEM1 同系物 B; FEM1B
FEM1,线虫,同系物,B
凋亡途径中的 FEM1 样蛋白,α
F1A-α
KIAA0396
HGNC 批准的基因符号:FEM1B
细胞遗传学位置:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:68,277,745-68,295,862(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Ishikawa 等人通过对从尺寸分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1997) 克隆了 FEM1B,他们将其命名为 KIAA0396。 RT-PCR 分析检测到所有检查的成体组织中 FEM1B 表达较低。
文图拉-霍尔曼等人(1998) 克隆小鼠 Fem1b。推导的 627 个氨基酸蛋白与秀丽隐杆线虫 Fem1 具有 30% 的氨基酸同一性,与小鼠 Fem1a(613538) 具有 39% 的氨基酸同一性。 Fem1b 具有 7 个 N 末端锚蛋白(参见 612641)重复序列和一个在 Fem1 同源物中高度保守的中心结构域。 Northern 印迹分析检测到 2.5 kb Fem1b 转录物在睾丸中大量表达,而在其他组织中几乎没有表达。在所有其他检查组织以及第 7 至 17 天之间的小鼠胚胎中均检测到 7.2-kb 转录物的较弱表达。第 17 天胚胎也强烈表达 1.9-kb Fem1b 转录物。动物园印迹分析在人类、猴子、大鼠、狗和牛中检测到了 Fem1b 直系同源物。
Chan 等人使用小鼠 Fas 的胞质结构域(TNFRSF6;134637)作为人 B 细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中的诱饵,然后进行数据库分析和人下丘脑 cDNA 文库的筛选(1999) 克隆了 FEM1B,他们将其称为 F1A-α。推导的 627 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 70 kD。陈等人(1999) 还克隆了小鼠 F1a-α,它与人类 F1A-α 仅存在 8 个残基不同。与秀丽隐杆线虫 Fem1 一样,小鼠和人类 F1A-α 都有 6 个 N 末端锚蛋白重复序列。人体组织的 Northern 印迹分析检测到 5.5-和 7.5-kb 转录物的普遍表达。仅在睾丸中检测到 1.35 和 2.5 kb 的转录本。
Sun 和 Shieh(2009) 报道,全长 627 个氨基酸的 FEM1B 蛋白在其 N 端半部包含 6 个锚蛋白重复序列,在其 C 端半部包含 von Hippel-Lindau(VHL; 608537) 框。细胞分级实验表明,荧光标记的 FEM1B 主要与细胞质区室分开,但也在细胞核部分中检测到。
▼ 基因功能
陈等人(1999) 发现 F1A-α 在人类细胞系中过度表达时会诱导细胞凋亡。突变分析显示,跨越 F1A-α 氨基酸 82 至 342 的区域(包括 5 个锚蛋白重复序列和紧邻这些重复序列的远端区域)对于 F1A-α 凋亡功能至关重要。 F1A-α 需要被 半胱天冬酶-3(CASP3; 600636) 样蛋白酶切割才能发挥其凋亡功能,并且 F1A-α 诱导的细胞凋亡可以被 半胱天冬酶 抑制剂阻断。 F1A-α 在 asp342 之后被切割,产生约 38 和 32 kD 的 F1A-α 片段。免疫沉淀分析显示,F1A-α 的蛋白水解裂解允许 F1A-α 片段与死亡受体(例如 Fas 和 TNFR1)结合(TNFRSF1A;191190)。 BCLXL(600039) 和 半胱天冬酶-9(CASP9; 602234) 和 FADD(602457) 的显性失活突变体可阻断 F1A-α 的凋亡功能,表明这些分子在 F1A-α 信号转导中发挥作用。
Sun 和 Shieh(2009) 使用酵母 2 杂交分析表明,人 FEM1B 与复制检查点蛋白 CHK1(CHEK1; 603078) 相互作用,并通过蛋白质下拉测定和 HCT116 人结肠癌细胞的免疫共沉淀分析证实了这种相互作用。 。突变分析显示,FEM1B 中的 2 个孤立区域介导与 CHK1 的相互作用,一个位于 N 末端结构域,另一个位于中心区域。体外激酶测定将 FEM1B 鉴定为 CHK1 底物。通过喜树碱(CPT) 药理学诱导复制应激增加了位于裂解 HCT116 细胞核部分的 FEM1B 比例。 FEM1B 的敲低会干扰对 CPT 诱导的复制应激的多种反应,包括 CHK1 的磷酸化和激活、RAD9(603761) 的染色质关联、RAD17(603139) 的磷酸化和 ATR(601215) 的激活,从而导致 CHK1 介导的复制受损保护细胞免受复制压力。 Sun 和 Shieh(2009) 得出结论,FEM1B 充当连接 CHK1 和 RAD9 的桥梁,从而促进复制应激诱导的检查点信号传导。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Ishikawa 等人(1997) 将 FEM1B 基因对应到 15 号染色体。 Gross(2010) 根据 FEM1B 序列(GenBank AF178632) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 FEM1B 基因对应到染色体 15q23。
Ventura-Holman 等人使用种间回交分析(1998) 将小鼠 Fem1b 基因定位到 9 号染色体。