输出蛋白,tRNA; XPOT
EXPORTIN-T
HGNC 批准的基因符号:XPOT
细胞遗传学位置:12q14.2 基因组坐标(GRCh38):12:64,404,392-64,451,125(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
艺术等(1998) 和库泰等人(1998) 孤立鉴定了 XPOT,他们将其称为导出蛋白(tRNA) 或导出蛋白-t。艺术等(1998) 报道 XPOT 含有 960 个氨基酸,Kutay 等人(1998)报道XPOT含有963个氨基酸。
▼ 基因功能
在真核生物中,tRNA 在细胞核中合成,经过几个成熟步骤后输出到细胞质。艺术等(1998) 和库泰等人(1998) 孤立鉴定了 exportin-t 为 tRNA 输出的特定介体。 Exportin-t 是一种 RanGTP 结合、输入蛋白 β 相关因子,主要定位于核。它在细胞核和细胞质之间快速穿梭,并与核孔复合物相互作用。 Exportin-t 以高亲和力直接结合 tRNA。根据显微注射实验判断,其在非洲爪蟾卵母细胞中的细胞浓度对所有测试的 tRNA 的输出具有速率限制。 RanGTP 调节底物-输出蛋白-t 相互作用,使 tRNA 可以优先结合在细胞核中并在细胞质中释放。
▼ 生化特征
晶体结构
库克等人(2009) 报道了与 tRNA 和 RanGTP 复合的粟酒裂殖酵母 Xpot 的 3.2 埃分辨率结构,以及未结合的 Xpot 的 3.1 埃结构,揭示了该转运因子的核和胞质快照。 Xpot 在结合货物时经历了巨大的构象变化,包裹着 tRNA,特别是与 tRNA 5 和 3 引物末端结合。结合模式解释了 Xpot 如何识别细胞中所有成熟的 tRNA,并将它们与那些未经正确处理的 tRNA 区分开来,从而将 tRNA 输出与质量控制结合起来。
▼ 测绘
Gross(2013) 根据 XPOT 序列(GenBank AF039022) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 XPOT 基因对应到染色体 12q14.2。