甲状腺乳头状癌易感性候选基因 1; PTCSC1
非编码 RNA 197; NCRNA00197
HGNC 批准的基因符号:PTCSC1
细胞遗传学位置:8q24.22 基因组坐标(GRCh38):8:133,054,959-133,057,767(来自 NCBI)
▼ 说明
PTCSC1 等长非编码 RNA 具有 200 多个核苷酸,在基因调控中发挥着重要作用。 PTCSC1 作为参与细胞信号转导的蛋白质的关键支架(Koirala et al., 2017)。
▼ 克隆与表达
通过甲状腺总RNA的PCR,He等人(2009) 克隆了 PTCSC1 并通过其登录号 AK023948 指定它。 2.1 kb 转录本的 ORF 少于 100 个密码子。 AK023948 在正常人甲状腺组织中大量表达。
柯伊拉腊等人(2017) 报道 AK023948 有 2,807 个核苷酸。
▼ 基因功能
He 等人利用基因表达数据和 RT-PCR(2009) 发现 AK023948 表达在大量散发性和家族性乳头状甲状腺癌中下调。 AK023948 的表达孤立于其宿主基因 SLA(601099) 的表达。
柯伊拉腊等人(2017) 发现 AK023948 的激活会导致 AKT 的磷酸化和激活(参见 AKT1, 164730),并增强乳腺癌细胞系中的细胞生长。相反,在异种移植小鼠模型中,抑制或敲除 AK023948 可抑制 AKT 磷酸化和激活,增加细胞凋亡,并抑制乳腺癌细胞生长。 RNA 沉淀和倒数 RNA 免疫沉淀分析表明,AK023948 在 MCF-7 细胞中与 DHX9(603115) 相互作用,并且 AK023948 是 DHX9 与 PI3 激酶调节亚基 p85-β(PIK3R2; 603157) 相互作用所必需的,其与催化亚基(PIK3CA;171834)调节 AKT 活性。 AK023948 和 DHX9 增加了 p85-β 稳定性,但 DHX9 对 AK023948 表达或亚细胞分布没有影响。敲除 AK023948 会抑制 EGF(131530) 或胰岛素(176730) 诱导的 AKT 激活,还会损害酸中毒诱导的 AKT 激活。 AK023948 表达的操作对 SLA 基因表达没有影响。最后,与正常对照相比,乳腺癌组织和细胞系中 AK023948 的表达上调。柯伊拉腊等人(2017) 得出结论,AK023948 与 DHX9 和 p85-β 的相互作用对于响应生长因子和酸中毒等环境应激的 AKT 激活至关重要,并且可能有助于乳腺癌的发展。
▼ 基因结构
他等人(2009) 确定 PTCSC1 是一个单外显子基因。
▼ 测绘
他等人(2009) 确定 PTCSC1 基因对应到染色体 8q24,位于同一链上 SLA 基因(601099) 的内含子 3 内。 SLA 基因本身由甲状腺球蛋白基因内含子的反义链编码(TG;188450)。