信号识别颗粒,9-KD; SRP9
Alu RNA 结合蛋白,9-KD 亚基; ALURBP
HGNC 批准的基因符号:SRP9
细胞遗传学位置:1q42.12 基因组坐标(GRCh38):1:225,777,826-225,790,464(来自 NCBI)
▼ 说明
SRP9 是信号识别颗粒(SRP) 的组成部分,信号识别颗粒是一种核糖核蛋白复合物,可介导蛋白质靶向内质网。 SRP9 和 SRP14(600708) 共同构成 SRP 的 Alu 结构域(Hsu 等人总结,1995)。
▼ 克隆与表达
短散布元件(SINE) 是普遍存在的重复 DNA,存在于许多(如果不是全部)哺乳动物的基因组中。在人类中,最常见的 SINE 是大约 100 万个 Alu 序列,占基因组 DNA 的 5%。人Alu重复序列的祖先可能是7SL RNA,它是信号识别颗粒的组成部分。一些 Alu 重复序列被转录,并且非编码 RNA 预计会形成二级结构。大多数灵长类动物 Alu 序列是二聚体,具有 2 个不同的基序,并包含 RNA 聚合酶 III 内部启动子,后面是聚(A) 尾。 Alu 介导的同源重组与 Alu 序列插入一样与多种遗传性疾病有关。一些 Alu 转录物通过 3-prime 加工转化为聚(A)-单体,称为小细胞质(sc) Alu RNA。 “Alu域” SRP 由称为 SRP9(9 kD) 和 SRP14(600708) 的 2 个蛋白质以及 7SL RNA 的 Alu 同源区域组成。 SRP9 和 SRP14 的信息分别通过对狗和小鼠基因的研究获得。人类和小鼠的 SRP14 蛋白大约有 90% 相同(Chang 等,1994)。许等人(1995) 克隆了人类 SRP9 cDNA,并表明预测的蛋白质与其犬同源物相似度约为 96%。此外,当 SRP9 与 SRP14 一起在体外翻译时,Hsu 等人(1995) 发现 Alu RNA 结合活性被重建,并且 scAlu RNA、7SL RNA 和包含 Alu 序列基序的人工转录物都以相似的亲和力结合。
有关信号识别粒子数据库的信息,请参阅 Larsen 等人(1998)。
▼ 基因家族
信号识别颗粒(SRP) 是一种核糖核蛋白复合物,可介导蛋白质靶向内质网(ER)。该复合物由 7S(或 7SL)RNA 和 6 种不同的蛋白质组成:SRP9、SRP14(600708)、SRP19(182175)、SRP54(604857)、SRP68(604858) 和 SRP72(602122)。这些蛋白质以单体(SRP19 和 SRP54)或异二聚体(SRP9/SRP14 和 SRP68/SRP72)形式与 7S RNA 结合。 SRP9和SRP14构成7S的Alu结构域,而其他4个蛋白属于S结构域。 SRP 至少具有 3 个与蛋白质亚基相关的不同功能:信号识别、翻译停滞以及通过与对接蛋白相互作用实现 ER 膜靶向(Lingelbach 等人总结,1988)。
▼ 生化特征
晶体结构
维肯里德等人(2000) 报道了异源二聚体 SRP9/14 的 2 个晶体结构,它们要么与 SRP RNA 的 5-prime 结构域结合,要么与包含 SRP RNA 的 5-prime 和 3-prime 结构域的构建体结合。
冷冻电子显微镜
哈利克等人(2004) 提出了靶向复合物的结构,该复合物由与携带信号序列的活性 80S 核糖体结合的哺乳动物 SRP 组成。这种结构通过冷冻电子显微镜确定为 12 埃分辨率,使 Halic 等人得以实现(2004) 生成 SRP 功能构象的分子模型。该模型显示了 SRP 的 S 结构域如何在新生链出口位点接触大核糖体亚基以结合信号序列,以及 Alu 结构域如何进入核糖体的延伸因子结合位点,解释了其延伸抑制活性。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 SRP9 序列(GenBank BC008443) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SRP9 基因对应到染色体 1q42.12。