磷酸酶和肌节蛋白调节剂 3; PHACTR3
支架相关蛋白磷酸酶 1 抑制蛋白;SCAPININ
HGNC 批准的基因符号:PHACTR3
细胞遗传学位置:20q13.32-q13.33 基因组坐标(GRCh38):20:59,577,509-59,847,711(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
相良等人(2003) 开发了针对 PHACTR3 的 2 种亚型的抗体,他们将其命名为 scapinin-S 和 scapinin-L,它们与骨髓性白血病(HL-60) 细胞的染色质耗尽的细胞核相关。通过免疫筛选 HL-60 cDNA 表达文库,然后进行 3-prime 和 5-prime RACE,他们克隆了 2 个剪接变体。 Scapinin-S 编码推导的 448 个氨基酸的蛋白质,表观分子量为 60 kD,scapinin-L 编码推导的 518 个氨基酸的蛋白质,表观分子量为 75 kD。 Northern印迹分析检测到大脑中的斯卡皮宁高表达,而胸腺、脾脏和胎盘中的水平低得多。转染的和内源性的斯卡皮蛋白的免疫定位显示主要是核定位。免疫染色显示HL-60细胞的细胞核呈颗粒状分布。在 HeLa 细胞中,荧光标记的 scapinin-L 定位于一些细胞质延伸以及细胞核。 scapinin-S 和 scapinin-L 均集中在染色质耗尽的 HL-60 细胞核的核基质-中间丝支架内。这 2 种蛋白质大部分在中间丝部分中回收。
通过在数据库中搜索与大鼠 Phactr1(608723) 相似的序列,Allen 等人(2004) 在小鼠和人类中鉴定了 4 个 PHACTR 基因家族,包括 PHACTR3。 PHACTR 蛋白在 N 端和 C 端 RPEL 重复序列周围的序列以及 C 端肌节蛋白和蛋白磷酸酶 1(PP1;参见 PPP1CA,176875)结合域中具有最高的相似性。大鼠脑原位杂交显示 Phactr3 弥漫性表达,皮层和海马的丰度高于纹状体和丘脑。
▼ 基因功能
相良等人(2003) 在胎盘 cDNA 文库的酵母 2 杂交检测中发现 scapinin 与 PPP1CA 相互作用。在 COS-7 细胞中共表达后,两种 scapinin 亚型均与 PPP1CA 共免疫沉淀。突变分析确定 70 个氨基酸的 C 端结构域与 PPP1CA 结合。该结构域还抑制兔骨骼肌 PP1 活性。
艾伦等人(2004) 发现小鼠 Phactr3 在人胚胎肾细胞中表达后与 PP1 和肌节蛋白共沉淀。
▼ 基因结构
相良等人(2003) 确定 PHACTR3 基因包含 13 个外显子,跨度约为 130 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Sagara 等人(2003) 将 PHACTR3 基因定位到染色体 20q13.32。