TMF1 调节的核蛋白 1; TRNP1
TMF 调节的核蛋白; TRNP
HGNC 批准的基因符号:TRNP1
细胞遗传学位置:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:26,993,692-27,000,886(来自 NCBI)
▼ 说明
TRNP1 是一种核蛋白,可加速细胞周期进程并调节大脑皮层的扩张和折叠(Volpe 等,2006;Stahl 等,2013)。
▼ 克隆与表达
Volpe 等人在小鼠体内对 Tmf(TMF1; 601126) 相互作用蛋白进行酵母 2 杂交筛选(2006) 克隆了 Trnp1,他们将其称为 Trnp。通过数据库分析,他们在所有胎盘哺乳动物和负鼠中鉴定出了 Trnp1 直向同源物,但在非哺乳动物脊椎动物中却没有。推导的小鼠和人TRNP1蛋白分别含有223和227个氨基酸,并且具有90%的序列相似性。 TRNP1 蛋白是高度碱性的,其 N 末端一半包含富含脯氨酸的区域以及富含甘氨酸和丙氨酸的区域,这些区域在所有胎盘哺乳动物中都是保守的。 RT-PCR 显示 Trnp1 mRNA 在小鼠脑、脾和肠中表达最强。蛋白质印迹分析显示,小鼠大脑和肾脏中存在一种表观分子量约为 36 kD 的蛋白质,但睾丸中没有。在培养的小鼠成肌细胞和成纤维细胞中检测到内源性 TRNP1 蛋白表达,但在培养的人 HEK293 细胞和 MCF-7 乳腺癌细胞中未检测到内源性 TRNP1 蛋白表达。转染小鼠成肌细胞的免疫细胞化学和亚细胞分离揭示了 Trnp1 的独特核定位以及与含有染色质的不溶性核部分的关联。
Stahl 等人使用原位杂交(2013)显示人胚胎大脑皮层切片中TRNP1 mRNA在脑室区和皮质板中高表达,在室下区低表达。免疫组织化学在胚胎小鼠前脑中显示出类似的表达模式,其中Trnp1定位于心室区神经元和放射状胶质细胞以及皮质板神经元,但不定位于心室下区的基底祖细胞。在小鼠大脑皮层中,Trnp1 表达在发育过程中下降,并且在出生后第一周几乎检测不到。在出生后晚期和成年阶段,小鼠 Trnp1 仅在侧脑室室管膜下区检测到,该部位有助于嗅球中活跃的成年神经发生。免疫染色显示小鼠 Trnp1 均匀分布在常染色质中,但在异染色质中不存在,并且这种关联在体外和体内的整个有丝分裂过程中保持稳定。
▼ 基因结构
沃尔普等人(2006)确定TRNP1基因包含2个外显子,其中只有第一个是蛋白质编码。
▼ 测绘
通过序列分析,Volpe 等人(2006) 将人类 TRNP1 基因定位到染色体 1p36.11,将小鼠 Trnp1 基因定位到染色体 4D3。
▼ 基因功能
沃尔普等人(2006)发现MCF-7细胞中小鼠Trnp1的异位表达增加了细胞增殖并增加了细胞周期S和G2/M期的细胞比例。转染实验表明,Tmf 增加了小鼠 Trnp1 的蛋白体降解。
斯塔尔等人(2013) 表明,在离体的小鼠胚胎大脑皮质中过度表达小鼠 Trnp1 会增加细胞增殖、切向神经元扩张、细胞周期重入率和放射状胶质细胞的自我更新。相比之下,Trnp1敲除增加了基底放射状胶质细胞和基底祖细胞的生成,从而促进了通常光滑的小鼠大脑皮层的放射状扩张和折叠,并导致皮质板中神经元的横向分散。基因表达芯片显示,Trnp1 敲低会导致转录调控、神经分化和染色质重塑相关基因的表达失调。在人类胚胎大脑皮层切片中,作者观察到 TRNP1 的表达与大脑皮层的径向扩张和折叠之间呈负相关。